More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_0802 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_0802  MgtE intracellular region  100 
 
 		 416 aa  821    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1681  MgtE intracellular region  66.75 
 
 		 431 aa  526  1e-148  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000106965  normal  0.399701 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4001  MgtE intracellular region  64.11 
 
 		 431 aa  513  1e-144  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.114119  normal  0.413173 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4061  MgtE intracellular region  64.11 
 
 		 431 aa  513  1e-144  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.803121  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4488  MgtE intracellular region  63.64 
 
 		 431 aa  511  1e-144  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.837041  normal  0.0679384 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2208  MgtE intracellular region  62.68 
 
 		 432 aa  503  1e-141  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.55571 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1134  MgtE intracellular region  61.89 
 
 		 412 aa  495  1e-139  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.121056  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3987  MgtE intracellular region  64.18 
 
 		 417 aa  493  9.999999999999999e-139  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.576405  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1864  MgtE intracellular region  59.67 
 
 		 438 aa  480  1e-134  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1195  MgtE intracellular region  59.95 
 
 		 427 aa  472  1e-132  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.680204  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1447  MgtE intracellular region  58.05 
 
 		 424 aa  466  9.999999999999999e-131  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.202567  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3817  MgtE intracellular region  60.58 
 
 		 447 aa  457  1e-127  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.446632  normal  0.333957 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1818  MgtE intracellular region  62.62 
 
 		 429 aa  453  1.0000000000000001e-126  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.705628 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0901  MgtE intracellular region  57.08 
 
 		 474 aa  444  1.0000000000000001e-124  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.885625  normal  0.115332 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11257  hypothetical protein  58.99 
 
 		 435 aa  447  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000354165 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1190  MgtE intracellular region  57.62 
 
 		 445 aa  441  9.999999999999999e-123  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.067335  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0664  MgtE intracellular region  55.1 
 
 		 427 aa  431  1e-119  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.108649 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8408  MgtE intracellular region  55.77 
 
 		 426 aa  423  1e-117  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.879169  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0717  MgtE intracellular region  53.53 
 
 		 428 aa  410  1e-113  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.205021 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1158  MgtE intracellular region  56.12 
 
 		 435 aa  408  1e-113  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.328594  normal  0.0567731 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0122  MgtE intracellular region  55.77 
 
 		 454 aa  410  1e-113  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.522016 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3009  MgtE intracellular region  54.79 
 
 		 402 aa  407  1.0000000000000001e-112  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.315291  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0701  MgtE intracellular region  53.64 
 
 		 431 aa  400  9.999999999999999e-111  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2483  MgtE intracellular region  54.81 
 
 		 435 aa  389  1e-107  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0317832 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2510  MgtE intracellular region  52.43 
 
 		 427 aa  387  1e-106  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000104929 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2790  MgtE intracellular region  51.69 
 
 		 427 aa  382  1e-105  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.045049  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19370  Mg/Co/Ni transporter MgtE with CBS domain  51.68 
 
 		 440 aa  372  1e-102  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0503098  normal  0.0197915 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15330  Mg/Co/Ni transporter MgtE with CBS domain  49.05 
 
 		 422 aa  370  1e-101  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.346083  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27830  Mg/Co/Ni transporter MgtE with CBS domain  51.93 
 
 		 427 aa  366  1e-100  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.885994 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0766  MgtE intracellular region  55.98 
 
 		 430 aa  363  3e-99  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2913  MgtE intracellular region  51.94 
 
 		 430 aa  358  9.999999999999999e-98  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.553029  normal  0.0535058 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11290  Mg/Co/Ni transporter MgtE with CBS domain  47.82 
 
 		 453 aa  319  5e-86  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.371515  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2338  MgtE intracellular region  31.72 
 
 		 421 aa  166  6.9999999999999995e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2041  MgtE intracellular region  28.87 
 
 		 426 aa  155  1e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000239361  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1738  MgtE intracellular region  28.07 
 
 		 430 aa  140  3e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0595  CBS domain-containing protein  32.02 
 
 		 418 aa  131  3e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.297001  normal  0.536913 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1158  MgtE intracellular region  28 
 
 		 420 aa  126  8.000000000000001e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3240  MgtE intracellular region  25.77 
 
 		 433 aa  126  8.000000000000001e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0475  MgtE intracellular region  31.93 
 
 		 413 aa  126  9e-28  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.45499  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0069  MgtE intracellular region  27.51 
 
 		 625 aa  125  1e-27  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7400  hypothetical protein  31.58 
 
 		 430 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.090921  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0481  magnesium transporter  36.94 
 
 		 450 aa  121  1.9999999999999998e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.000026878  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2720  magnesium transporter  32.02 
 
 		 453 aa  118  1.9999999999999998e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.786081  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0076  MgtE intracellular region  26.68 
 
 		 459 aa  117  3.9999999999999997e-25  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.740588  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0668  magnesium transporter  30.9 
 
 		 454 aa  117  3.9999999999999997e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.175865  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3354  magnesium transporter  30.9 
 
 		 454 aa  117  3.9999999999999997e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.399526  normal  0.0702195 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0667  magnesium transporter  30.9 
 
 		 454 aa  116  6e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0861056  normal  0.126448 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0876  magnesium transporter  33.61 
 
 		 465 aa  116  1.0000000000000001e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3622  magnesium transporter  31.09 
 
 		 454 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.135678  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0822  magnesium transporter  33.61 
 
 		 465 aa  116  1.0000000000000001e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3966  magnesium transporter  30.04 
 
 		 454 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2396  CBS domain-containing protein  24.88 
 
 		 425 aa  115  2.0000000000000002e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0710  magnesium transporter  30.04 
 
 		 454 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000631089  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4245  magnesium transporter  29.18 
 
 		 454 aa  110  3e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.036971  unclonable  0.0000000195953 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1691  magnesium transporter  34.67 
 
 		 452 aa  110  6e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0276763 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0702  magnesium transporter  29.61 
 
 		 454 aa  109  1e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.952021 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3673  magnesium transporter  29.61 
 
 		 454 aa  109  1e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0193522  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0711  magnesium transporter  29.61 
 
 		 454 aa  108  2e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.194916  normal  0.348771 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2352  magnesium transporter  32.3 
 
 		 468 aa  108  2e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.814401  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3316  magnesium transporter  29.91 
 
 		 455 aa  108  2e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.497245  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0681  magnesium transporter  29.61 
 
 		 454 aa  108  2e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.299447  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12500  magnesium transporter  30.54 
 
 		 442 aa  107  3e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1642  magnesium transporter  31.4 
 
 		 462 aa  107  4e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1669  magnesium transporter  31.4 
 
 		 462 aa  107  5e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3303  magnesium transporter  31.51 
 
 		 461 aa  107  5e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2896  magnesium transporter  29.13 
 
 		 453 aa  106  9e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0679732  normal  0.300943 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0656  MgtE intracellular region  29.33 
 
 		 417 aa  105  1e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000076098  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03198  Mg/Co/Ni transporter MgtE (contains CBS domain)  30.84 
 
 		 452 aa  105  2e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0000340775  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2168  magnesium transporter  34.13 
 
 		 453 aa  105  2e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.571792  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2421  magnesium transporter  31.7 
 
 		 450 aa  105  2e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.545313  normal  0.154844 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4217  magnesium transporter  33.61 
 
 		 452 aa  105  2e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03755  magnesium transporter  30.17 
 
 		 449 aa  104  4e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.578894  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4147  magnesium transporter  30.49 
 
 		 454 aa  103  7e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.235845 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2831  magnesium transporter  32.22 
 
 		 458 aa  102  1e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0596  magnesium transporter  31.11 
 
 		 451 aa  101  2e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000141787  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2600  magnesium transporter  31.69 
 
 		 463 aa  101  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0809  magnesium transporter  30.89 
 
 		 542 aa  101  2e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0721  magnesium transporter  28.33 
 
 		 454 aa  100  3e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.167519 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2089  magnesium transporter  30.43 
 
 		 460 aa  100  4e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1269  magnesium transporter  32.92 
 
 		 465 aa  100  5e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0779643  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2231  magnesium transporter  33.48 
 
 		 450 aa  100  5e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.555024  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3382  magnesium transporter  28.76 
 
 		 454 aa  100  5e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.363371  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25770  Mg2+ transporter MgtE  31.28 
 
 		 462 aa  100  6e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0824  magnesium transporter  31.39 
 
 		 454 aa  99.8  9e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1461  magnesium transporter  33.05 
 
 		 463 aa  99.4  1e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00122115  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0331  magnesium transporter  28.45 
 
 		 458 aa  99  1e-19  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2430  divalent cation transporter  29.63 
 
 		 466 aa  98.6  2e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0143004 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1125  magnesium transporter  30.93 
 
 		 444 aa  98.6  2e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2001  magnesium transporter  35.14 
 
 		 447 aa  98.2  2e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4471  magnesium transporter  29.96 
 
 		 480 aa  97.8  3e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.223346 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1444  magnesium transporter  29.96 
 
 		 480 aa  97.8  3e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0516873  normal  0.652895 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1689  magnesium transporter  29.02 
 
 		 449 aa  97.4  4e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3760  magnesium transporter  29.96 
 
 		 480 aa  97.4  4e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00964036  normal  0.880674 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0714  magnesium transporter  30.32 
 
 		 449 aa  97.1  5e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0645  magnesium transporter  28.38 
 
 		 452 aa  96.3  9e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0824163  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1172  divalent cation transporter  32.61 
 
 		 450 aa  95.9  1e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000000987618  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0891  magnesium transporter  30.49 
 
 		 449 aa  95.9  1e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00182098 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3183  magnesium transporter  28.26 
 
 		 455 aa  95.9  1e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1567  magnesium transporter  29.46 
 
 		 481 aa  95.9  1e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1323  CBS domain-containing protein  25.11 
 
 		 423 aa  96.3  1e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.0000000111673  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>