More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_4563 on replicon NC_009806
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009806  Krad_4563  redoxin domain-containing protein  100 
 
 
237 aa  472  1e-132  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2704  hypothetical protein  53.54 
 
 
205 aa  139  6e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.396222  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3091  Redoxin domain protein  38.15 
 
 
203 aa  134  9.999999999999999e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17970  thiol-disulfide isomerase-like thioredoxin  51.22 
 
 
203 aa  132  3.9999999999999996e-30  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2734  Redoxin domain protein  50 
 
 
204 aa  132  5e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0627049  normal  0.0544448 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24260  thiol-disulfide isomerase-like thioredoxin  51.22 
 
 
196 aa  129  3e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0670449  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3292  redoxin domain-containing protein  38.73 
 
 
200 aa  130  3e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4431  Redoxin domain protein  50 
 
 
193 aa  129  4.0000000000000003e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4573  Redoxin domain protein  50.39 
 
 
191 aa  127  1.0000000000000001e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2202  redoxin domain-containing protein  43.42 
 
 
194 aa  127  1.0000000000000001e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0269  Redoxin domain-containing protein  51.69 
 
 
188 aa  123  2e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.352663  normal  0.890492 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0572  thiol-disulfide isomerase and thioredoxins-like protein  45.33 
 
 
189 aa  124  2e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.220825  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0628  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  37.84 
 
 
206 aa  123  3e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.603467  hitchhiker  0.00557817 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5008  Redoxin domain protein  46.03 
 
 
248 aa  121  9.999999999999999e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.437471  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07200  thiol-disulfide isomerase-like thioredoxin  51.64 
 
 
181 aa  120  1.9999999999999998e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.246784 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0926  Redoxin domain protein  54.7 
 
 
199 aa  120  1.9999999999999998e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4473  redoxin domain-containing protein  43.2 
 
 
203 aa  119  3e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4304  redoxin domain-containing protein  43.2 
 
 
203 aa  119  3e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.213617  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4204  redoxin domain-containing protein  43.2 
 
 
203 aa  119  3e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3254  Redoxin domain protein  47.26 
 
 
198 aa  117  9.999999999999999e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0648017  normal  0.303521 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0444  Redoxin domain protein  47.62 
 
 
176 aa  117  9.999999999999999e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.567513  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8082  Redoxin domain protein  41.94 
 
 
180 aa  117  9.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4433  redoxin domain-containing protein  35.32 
 
 
208 aa  116  1.9999999999999998e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.390962  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3240  redoxin domain-containing protein  44.44 
 
 
198 aa  116  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0521  Redoxin domain protein  50 
 
 
206 aa  115  6.9999999999999995e-25  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.000754545  hitchhiker  0.00309639 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5746  redoxin domain-containing protein  43.65 
 
 
188 aa  114  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.487229  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0689  Redoxin domain protein  43.51 
 
 
188 aa  113  2.0000000000000002e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0960762  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2869  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  44.17 
 
 
200 aa  111  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10537  thioredoxin  41.18 
 
 
216 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.154005  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6717  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  35.68 
 
 
195 aa  106  3e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24350  thiol-disulfide isomerase-like thioredoxin  37.34 
 
 
203 aa  106  3e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0501  redoxin domain-containing protein  48.39 
 
 
200 aa  102  5e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4484  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  41.27 
 
 
195 aa  102  6e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.810998 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4098  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  44.19 
 
 
191 aa  101  8e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.311906 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0052  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  42.19 
 
 
200 aa  100  3e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.148538 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0685  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  38.65 
 
 
203 aa  100  3e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0692  redoxin  38.65 
 
 
203 aa  100  3e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.988682  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0705  redoxin domain-containing protein  38.65 
 
 
203 aa  100  3e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.106229 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0866  redoxin domain-containing protein  41.41 
 
 
200 aa  99  5e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.141982  normal  0.0297264 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5203  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  36.22 
 
 
201 aa  99  6e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4518  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  42.64 
 
 
191 aa  97.8  1e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000658769 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0251  redoxin domain-containing protein  40.62 
 
 
213 aa  98.2  1e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2203  redoxin domain-containing protein  46.15 
 
 
203 aa  97.8  1e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6120  redoxin domain-containing protein  38.1 
 
 
209 aa  97.1  2e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.16555  normal  0.593362 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0510  putative secreted protein  35.29 
 
 
209 aa  94.7  1e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.113668  normal  0.171566 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02940  thiol-disulfide isomerase-like thioredoxin  46.09 
 
 
183 aa  93.2  3e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0986235  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0841  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  29.5 
 
 
174 aa  92.8  4e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3710  redoxin domain-containing protein  40.62 
 
 
218 aa  92  7e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0827  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  40.87 
 
 
179 aa  91.3  1e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2812  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  40.62 
 
 
240 aa  90.9  1e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5347  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  39.84 
 
 
223 aa  89.7  3e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5664  redoxin domain-containing protein  39.84 
 
 
223 aa  89.7  3e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1959  redoxin domain-containing protein  40.17 
 
 
189 aa  88.6  9e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0329542  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0520  periplasmic protein thiol  35.62 
 
 
199 aa  88.2  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.797158  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5382  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  36.31 
 
 
240 aa  88.2  1e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1468  Redoxin domain-containing protein  35.77 
 
 
164 aa  85.9  5e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0261888  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0365  periplasmic protein thiol  29.28 
 
 
197 aa  85.1  9e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.69916  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0940  periplasmic protein thiol/disulfide oxidoreductase DsbE  40.35 
 
 
185 aa  84.7  0.000000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.126048 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1165  thioredoxin family protein, putative  38.02 
 
 
202 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1396  thiol-disulfide oxidoreductase  25.81 
 
 
173 aa  84  0.000000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0318  periplasmic protein thiol-disulfide oxidoreductase DsbE  34.06 
 
 
197 aa  84.3  0.000000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1598  thiol-disulfide oxidoreductase  25.2 
 
 
173 aa  82.8  0.000000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.966744  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2939  redoxin domain-containing protein  37.39 
 
 
179 aa  83.2  0.000000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.670984  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0204  periplasmic protein thiol/disulphide oxidoreductase DsbE  29.09 
 
 
198 aa  82.8  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.466624  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0240  Redoxin domain protein  33.87 
 
 
188 aa  83.2  0.000000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1356  thiol-disulfide oxidoreductase  25.2 
 
 
173 aa  82.4  0.000000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1634  thiol-disulfide oxidoreductase  25.2 
 
 
173 aa  82.4  0.000000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2283  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  32.69 
 
 
199 aa  82  0.000000000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000858823  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1036  Redoxin domain protein  38.52 
 
 
196 aa  82  0.000000000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2682  thioredoxin  31.97 
 
 
183 aa  81.6  0.000000000000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1279  putative thioredoxin family protein  35.77 
 
 
186 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1355  thiol-disulfide oxidoreductase  24.19 
 
 
173 aa  81.3  0.00000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2499  thioredoxin family protein, putative  35.77 
 
 
186 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.129809  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3498  thioredoxin  35.77 
 
 
202 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3285  putative thioredoxin family protein  35.77 
 
 
186 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0413  periplasmic protein thiol  35.34 
 
 
197 aa  81.6  0.00000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2673  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  38.93 
 
 
204 aa  81.3  0.00000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.153714  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0420  putative thioredoxin family protein  35.77 
 
 
186 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0509  redoxin domain-containing protein  34.96 
 
 
184 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3463  thioredoxin family protein  35.77 
 
 
186 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3501  thioredoxin family protein  35.77 
 
 
186 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.511578  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1566  thiol-disulfide oxidoreductase  26.02 
 
 
173 aa  80.5  0.00000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.62392e-19 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0533  redoxin domain-containing protein  34.96 
 
 
183 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.917814  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2624  Redoxin domain protein  35.09 
 
 
204 aa  80.1  0.00000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0576  redoxin domain-containing protein  33.33 
 
 
183 aa  79.7  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000460325 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0243  redoxin domain-containing protein  34.4 
 
 
184 aa  80.1  0.00000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.487537  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1383  thiol-disulfide oxidoreductase  25.2 
 
 
173 aa  79.3  0.00000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1494  thiol-disulfide oxidoreductase  25.2 
 
 
173 aa  79.3  0.00000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0087  thiol-disulfide isomerase-like protein  35.19 
 
 
170 aa  79.7  0.00000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.653321  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3817  thiol-disulfide oxidoreductase  25.2 
 
 
173 aa  79.7  0.00000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000000518727 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1234  redoxin domain-containing protein  32.52 
 
 
167 aa  79.3  0.00000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1528  thiol-disulfide oxidoreductase  25.2 
 
 
173 aa  79.3  0.00000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3690  Thiol-disulfide isomerase/thioredoxin-like  33.05 
 
 
183 aa  79  0.00000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.405129 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0212  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  32.54 
 
 
175 aa  78.6  0.00000000000007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0124  redoxin  33.06 
 
 
182 aa  79  0.00000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.909527  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1358  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  33.09 
 
 
179 aa  79  0.00000000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000315647  hitchhiker  0.00000356135 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0607  redoxin domain-containing protein  33.06 
 
 
182 aa  79  0.00000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0377  periplasmic thioredoxin (cytochrome c biogenesis)  29.28 
 
 
198 aa  78.6  0.00000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2433  redoxin domain-containing protein  36.42 
 
 
277 aa  78.6  0.00000000000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.983249 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4129  periplasmic protein thiol--disulphide oxidoreductase DsbE  33.9 
 
 
200 aa  78.2  0.0000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.213063  normal  0.330883 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>