More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_4296 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_4296  adenylosuccinate lyase  100 
 
 		 470 aa  946    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.173423  normal  0.315447 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3228  adenylosuccinate lyase  68.27 
 
 		 480 aa  624  1e-177  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01820  adenylosuccinate lyase  67.83 
 
 		 481 aa  619  1e-176  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35970  Adenylosuccinate lyase  66.6 
 
 		 488 aa  616  1e-175  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.773029 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3826  adenylosuccinate lyase  66.01 
 
 		 480 aa  602  1.0000000000000001e-171  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4033  adenylosuccinate lyase  65.8 
 
 		 480 aa  598  1e-170  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2476  adenylosuccinate lyase  65.23 
 
 		 484 aa  591  1e-168  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.408912  normal  0.116565 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25530  adenylosuccinate lyase  66.74 
 
 		 471 aa  586  1e-166  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.73948  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3976  adenylosuccinate lyase  65.08 
 
 		 483 aa  579  1e-164  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.976031 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20390  adenylosuccinate lyase  64.1 
 
 		 475 aa  557  1e-157  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3429  Adenylosuccinate lyase  65.15 
 
 		 482 aa  557  1e-157  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.216694 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3858  adenylosuccinate lyase  51.8 
 
 		 460 aa  491  1e-137  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1978  adenylosuccinate lyase  54.31 
 
 		 478 aa  484  1e-135  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.673816  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0707  adenylosuccinate lyase  54.26 
 
 		 480 aa  478  1e-133  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.444547 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1137  adenylosuccinate lyase  48.19 
 
 		 465 aa  442  1e-123  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1849  adenylosuccinate lyase  53.39 
 
 		 455 aa  442  1e-123  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0518  adenylosuccinate lyase  52.36 
 
 		 456 aa  440  9.999999999999999e-123  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.448433 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1994  adenylosuccinate lyase  48.88 
 
 		 456 aa  435  1e-121  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.922086 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01129  adenylosuccinate lyase  48.88 
 
 		 456 aa  435  1e-120  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2516  adenylosuccinate lyase  48.66 
 
 		 456 aa  433  1e-120  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00611502  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1294  adenylosuccinate lyase  48.88 
 
 		 456 aa  435  1e-120  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1309  adenylosuccinate lyase  48.88 
 
 		 456 aa  435  1e-120  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2635  adenylosuccinate lyase  48.78 
 
 		 456 aa  432  1e-120  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1952  adenylosuccinate lyase  48.44 
 
 		 456 aa  432  1e-120  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01137  hypothetical protein  48.88 
 
 		 456 aa  435  1e-120  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1333  adenylosuccinate lyase  48.44 
 
 		 456 aa  432  1e-120  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.887926  normal  0.184863 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1349  adenylosuccinate lyase  48.44 
 
 		 456 aa  432  1e-120  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2134  adenylosuccinate lyase  48.44 
 
 		 456 aa  432  1e-120  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0323604 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1592  adenylosuccinate lyase  48.88 
 
 		 456 aa  435  1e-120  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000440379 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2472  adenylosuccinate lyase  48.88 
 
 		 456 aa  434  1e-120  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1311  adenylosuccinate lyase  48.66 
 
 		 456 aa  434  1e-120  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.634296  normal  0.266567 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1251  adenylosuccinate lyase  48.88 
 
 		 456 aa  434  1e-120  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1718  adenylosuccinate lyase  47.77 
 
 		 456 aa  431  1e-119  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2540  adenylosuccinate lyase  47.22 
 
 		 456 aa  431  1e-119  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2106  adenylosuccinate lyase  49.32 
 
 		 455 aa  430  1e-119  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2646  adenylosuccinate lyase  48.78 
 
 		 451 aa  431  1e-119  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.147554  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02370  adenylosuccinate lyase  47.1 
 
 		 455 aa  430  1e-119  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.718136  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1558  adenylosuccinate lyase  47.77 
 
 		 456 aa  430  1e-119  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0115488  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1610  adenylosuccinate lyase  47.77 
 
 		 456 aa  431  1e-119  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2853  adenylosuccinate lyase  47.77 
 
 		 456 aa  431  1e-119  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1273  adenylosuccinate lyase  51.13 
 
 		 455 aa  429  1e-119  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1601  adenylosuccinate lyase  48.55 
 
 		 456 aa  430  1e-119  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1676  adenylosuccinate lyase  48.55 
 
 		 456 aa  431  1e-119  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.167323  normal  0.0665218 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2707  adenylosuccinate lyase  47.53 
 
 		 456 aa  430  1e-119  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0624698 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1065  adenylosuccinate lyase  48.88 
 
 		 458 aa  429  1e-119  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.403225  normal  0.751482 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1745  adenylosuccinate lyase  48.55 
 
 		 456 aa  430  1e-119  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1867  adenylosuccinate lyase  47.99 
 
 		 456 aa  426  1e-118  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003857  adenylosuccinate lyase  48.55 
 
 		 456 aa  426  1e-118  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.574073  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1826  adenylosuccinate lyase  46.1 
 
 		 456 aa  426  1e-118  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2446  adenylosuccinate lyase  50.68 
 
 		 454 aa  426  1e-118  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.673472  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1593  adenylosuccinate lyase  47.54 
 
 		 455 aa  428  1e-118  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_29392  predicted protein  49.56 
 
 		 505 aa  426  1e-118  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.881924 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2020  adenylosuccinate lyase  47.77 
 
 		 456 aa  427  1e-118  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.581783  normal  0.312762 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01822  adenylosuccinate lyase  48.55 
 
 		 478 aa  427  1e-118  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2064  adenylosuccinate lyase  47.44 
 
 		 456 aa  426  1e-118  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00558095  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0026  adenylosuccinate lyase  50.79 
 
 		 455 aa  426  1e-118  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1764  adenylosuccinate lyase  49.66 
 
 		 455 aa  426  1e-118  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.207471  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2720  adenylosuccinate lyase  51.24 
 
 		 457 aa  422  1e-117  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.382764 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2480  adenylosuccinate lyase  48.21 
 
 		 456 aa  424  1e-117  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.866176  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1871  adenylosuccinate lyase  48.21 
 
 		 456 aa  424  1e-117  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0121528  hitchhiker  0.00000377009 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3268  adenylosuccinate lyase  48.76 
 
 		 457 aa  422  1e-117  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00567464 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2473  adenylosuccinate lyase  48.21 
 
 		 456 aa  424  1e-117  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00166519  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1879  adenylosuccinate lyase  46.65 
 
 		 455 aa  422  1e-117  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000162136 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1644  adenylosuccinate lyase  47.32 
 
 		 456 aa  425  1e-117  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2152  adenylosuccinate lyase  47.54 
 
 		 456 aa  422  1e-117  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0629713  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2593  adenylosuccinate lyase  48.21 
 
 		 456 aa  422  1e-117  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.138176  normal  0.0552843 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2235  adenylosuccinate lyase  47.99 
 
 		 456 aa  424  1e-117  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0334521  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2576  adenylosuccinate lyase  51.24 
 
 		 462 aa  421  1e-116  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000542791 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2627  adenylosuccinate lyase  52.48 
 
 		 455 aa  421  1e-116  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.108718  normal  0.687472 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0644  adenylosuccinate lyase  47.66 
 
 		 456 aa  421  1e-116  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2195  adenylosuccinate lyase  46.77 
 
 		 456 aa  421  1e-116  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2381  adenylosuccinate lyase  46.19 
 
 		 455 aa  420  1e-116  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.701794  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2262  adenylosuccinate lyase  45.98 
 
 		 456 aa  420  1e-116  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2402  adenylosuccinate lyase  47.97 
 
 		 456 aa  415  9.999999999999999e-116  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.129184  normal  0.0983593 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1794  adenylosuccinate lyase  50.67 
 
 		 459 aa  416  9.999999999999999e-116  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0813752  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2964  adenylosuccinate lyase  50.34 
 
 		 457 aa  415  9.999999999999999e-116  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.989167  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1940  adenylosuccinate lyase  45.98 
 
 		 455 aa  415  9.999999999999999e-116  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0593  adenylosuccinate lyase  50.79 
 
 		 462 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1511  adenylosuccinate lyase  49.67 
 
 		 483 aa  416  9.999999999999999e-116  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.411987 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1784  adenylosuccinate lyase  49.55 
 
 		 453 aa  414  1e-114  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.47541  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2902  adenylosuccinate lyase  46.43 
 
 		 456 aa  412  1e-114  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.451735  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2065  adenylosuccinate lyase  46.88 
 
 		 455 aa  414  1e-114  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2819  adenylosuccinate lyase  50.11 
 
 		 458 aa  413  1e-114  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3366  adenylosuccinate lyase  51.01 
 
 		 462 aa  415  1e-114  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000111293 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2956  adenylosuccinate lyase  49.44 
 
 		 458 aa  412  1e-114  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30110  adenylosuccinate lyase  48.2 
 
 		 456 aa  413  1e-114  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2554  adenylosuccinate lyase  50.34 
 
 		 457 aa  413  1e-114  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.660215 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3598  adenylosuccinate lyase  47.75 
 
 		 471 aa  409  1e-113  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2578  adenylosuccinate lyase  47.97 
 
 		 456 aa  410  1e-113  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.763537  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28380  adenylosuccinate lyase  47.58 
 
 		 462 aa  410  1e-113  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3402  adenylosuccinate lyase  50.11 
 
 		 462 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2442  adenylosuccinate lyase  50.11 
 
 		 462 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0834  adenylosuccinate lyase  45.31 
 
 		 456 aa  405  1.0000000000000001e-112  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3288  adenylosuccinate lyase  47.75 
 
 		 455 aa  407  1.0000000000000001e-112  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.650237  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0633  adenylosuccinate lyase  49.44 
 
 		 462 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1819  adenylosuccinate lyase  47.44 
 
 		 456 aa  408  1.0000000000000001e-112  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.558507  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2627  adenylosuccinate lyase  50.11 
 
 		 462 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0157894  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1358  adenylosuccinate lyase  48.19 
 
 		 455 aa  407  1.0000000000000001e-112  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0666  adenylosuccinate lyase  49.44 
 
 		 462 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.600757  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0961  adenylosuccinate lyase  47.01 
 
 		 457 aa  405  1.0000000000000001e-112  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.118587 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>