51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_4235 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_4235  cobalt transport protein  100 
 
 
294 aa  540  9.999999999999999e-153  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3444  cobalt transport protein  38.79 
 
 
265 aa  117  1.9999999999999998e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0362391 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11750  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  42.24 
 
 
656 aa  111  2.0000000000000002e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.348562  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3864  cobalt transport protein  36.44 
 
 
267 aa  109  5e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3823  cobalt transport protein  38.24 
 
 
266 aa  97.1  3e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.457934  normal  0.0215821 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3649  cobalt transport protein  38.17 
 
 
266 aa  94.7  2e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0253  cobalt transport protein  39.44 
 
 
313 aa  88.6  1e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.648323  normal  0.0540671 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5272  cobalt transport protein  36.54 
 
 
258 aa  83.6  0.000000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5361  cobalt transport protein  36.54 
 
 
258 aa  83.6  0.000000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5651  cobalt transport protein  36.54 
 
 
258 aa  83.6  0.000000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.263565  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0972  cobalt transport protein  36.84 
 
 
249 aa  79.7  0.00000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0589  ABC-type cobalt transport system  36.11 
 
 
258 aa  77  0.0000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0946935  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2044  cobalt transport protein  39.44 
 
 
264 aa  74.7  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.25955  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0414  cobalt transport protein  37.07 
 
 
895 aa  65.1  0.000000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.624811 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0821  cobalt ABC transporter permease  34.88 
 
 
275 aa  63.2  0.000000006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.505848  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2667  cobalt transport protein  26.29 
 
 
266 aa  59.7  0.00000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1801  cobalt transport family protein  25.95 
 
 
268 aa  57.8  0.0000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2657  cobalt transport protein  24 
 
 
266 aa  56.6  0.0000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.287835  hitchhiker  0.000000289223 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2498  cobalt transport protein  24 
 
 
266 aa  55.8  0.0000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0358431  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2669  cobalt transport protein  23.73 
 
 
266 aa  55.1  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00761496  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2659  cobalt transport protein  24.4 
 
 
266 aa  54.3  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000035997 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2642  cobalt transport protein  24.4 
 
 
273 aa  53.9  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.357292  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2462  cobalt transport protein  24.1 
 
 
287 aa  53.1  0.000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0531481  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2386  ABC transporter, permease; cobalt transport protein  22.29 
 
 
287 aa  53.1  0.000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00268022  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2425  ABC transporter, permease; cobalt transport protein  24.1 
 
 
287 aa  52.8  0.000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000434651  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23320  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  40.43 
 
 
811 aa  52  0.00001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2710  cobalt transport protein  23.16 
 
 
266 aa  52.4  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2288  cobalt transport protein  25.64 
 
 
268 aa  48.9  0.00009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.256211  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2247  cobalt transport protein  25.64 
 
 
268 aa  48.9  0.00009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000829673  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1413  cobalt transport protein  33.66 
 
 
260 aa  48.1  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0614  cobalt transport protein  23.18 
 
 
257 aa  47  0.0004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07620  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ  30.71 
 
 
276 aa  46.6  0.0005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08030  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ  39.05 
 
 
267 aa  46.6  0.0005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.154271 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0226  cobalt transport protein  28.35 
 
 
262 aa  46.2  0.0007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0135  cobalt transport protein  26.16 
 
 
264 aa  45.8  0.0008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000281903  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0172  cobalt transport protein  25.58 
 
 
264 aa  45.8  0.0009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000818149  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0141  cobalt transport protein  25.58 
 
 
264 aa  45.8  0.0009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00214311  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0136  cobalt ABC transporter permease  25.58 
 
 
264 aa  45.8  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000131502  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0141  cobalt transport protein  25.58 
 
 
264 aa  45.8  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0154  cobalt transport protein  25.58 
 
 
264 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.51702e-41 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0141  cobalt transport protein  25.58 
 
 
264 aa  45.8  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00121096  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0945  ABC transporter related  31.22 
 
 
764 aa  45.1  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0134  cobalt ABC transporter permease  25.58 
 
 
264 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0906186  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5164  cobalt transport protein  26.71 
 
 
264 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000252376  hitchhiker  0.0000000000119077 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1539  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ or related transporter  23.97 
 
 
278 aa  45.1  0.002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.173972  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0162  cobalt transport protein  26.71 
 
 
264 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000250375  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1453  cobalt transport protein  25 
 
 
267 aa  44.7  0.002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000563289  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0136  cobalt transport protein  26.09 
 
 
264 aa  43.9  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000517715  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0027  hypothetical protein  24.74 
 
 
255 aa  43.5  0.004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0066  cobalt transport protein  28.45 
 
 
238 aa  42.7  0.007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1302  cobalt transport protein  24.82 
 
 
267 aa  42.7  0.007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0789486  normal  0.0436887 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>