175 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_3392 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_3392  peptidase M42 family protein  100 
 
 		 402 aa  798    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.13042  normal  0.889959 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0915  peptidase M42 family protein  59.84 
 
 		 397 aa  429  1e-119  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0858  peptidase M42 family protein  59.58 
 
 		 397 aa  430  1e-119  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.967973  normal  0.0317113 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0112  hydrolase, peptidase M42 family  53.51 
 
 		 372 aa  380  1e-104  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.294228  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0140  hydrolase, peptidase M42 family  51.95 
 
 		 399 aa  375  1e-103  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.138245  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2678  peptidase M42 family hydrolase  51.74 
 
 		 394 aa  370  1e-101  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.899426 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0814  peptidase M42 family protein  49.59 
 
 		 371 aa  355  7.999999999999999e-97  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0829922  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3665  peptidase M42 family protein  48.8 
 
 		 392 aa  347  3e-94  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00161837 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2956  peptidase M42 family protein  48.27 
 
 		 387 aa  337  2.9999999999999997e-91  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.730035  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0220  peptidase M42 family protein  50.57 
 
 		 363 aa  333  4e-90  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2957  peptidase M42 family protein  48.08 
 
 		 399 aa  328  7e-89  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.705814  normal  0.012913 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1987  peptidase M42  50.13 
 
 		 387 aa  320  1.9999999999999998e-86  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4102  peptidase M42  48.48 
 
 		 396 aa  315  8e-85  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.727152 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1340  peptidase M42 family hydrolase  49.03 
 
 		 394 aa  310  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34980  Glutamyl aminopeptidase familiy M42  47.09 
 
 		 405 aa  310  2.9999999999999997e-83  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1748  hypothetical protein  50.14 
 
 		 394 aa  309  6.999999999999999e-83  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1666  hypothetical protein  48.99 
 
 		 398 aa  308  9e-83  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.669233  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19350  hypothetical protein  48.7 
 
 		 398 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0348157  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3749  peptidase M42  46.91 
 
 		 398 aa  307  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0267864 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1631  hypothetical protein  46.52 
 
 		 398 aa  306  4.0000000000000004e-82  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1298  peptidase M42 family hydrolase  49.28 
 
 		 394 aa  303  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3966  peptidase M42 family protein  49.57 
 
 		 394 aa  294  2e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.123914 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1427  peptidase M42 family protein  38.42 
 
 		 343 aa  243  5e-63  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1456  peptidase M42 family protein  38.42 
 
 		 343 aa  243  5e-63  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0795  glucanase; deblocking aminopeptidase  38.87 
 
 		 349 aa  242  9e-63  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0139828  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0790  peptidase M42 family protein  38.87 
 
 		 349 aa  242  9e-63  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0799  glucanase; deblocking aminopeptidase  38.58 
 
 		 349 aa  241  2e-62  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.650698  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0985  Peptidase, family M20/M25/M40 protein  38.58 
 
 		 349 aa  240  2.9999999999999997e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.14885e-38 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1078  Peptidase, family M20/M25/M40 protein  38.58 
 
 		 349 aa  240  2.9999999999999997e-62  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0754256  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4392  deblocking aminopeptidase  38.87 
 
 		 349 aa  240  4e-62  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000145821  hitchhiker  1.52043e-22 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0850  M20/M25/M40 family peptidase  38.58 
 
 		 349 aa  240  4e-62  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0897  M20/M25/M40 family peptidase  38.58 
 
 		 349 aa  240  4e-62  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.058165  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0939  deblocking aminopeptidase  38.87 
 
 		 349 aa  239  5.999999999999999e-62  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0018694  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0983  M20/M25/M40 family peptidase  38.28 
 
 		 349 aa  239  9e-62  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0064567  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0723  peptidase M42 family protein  38.01 
 
 		 349 aa  230  3e-59  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000063382  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1100  peptidase M42 family protein  38.35 
 
 		 340 aa  227  3e-58  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1943  hypothetical protein  35.93 
 
 		 345 aa  221  9.999999999999999e-57  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.643032  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0298  peptidase M42  39.39 
 
 		 357 aa  216  4e-55  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1785  peptidase M42 family protein  36.31 
 
 		 343 aa  210  5e-53  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0017  hypothetical protein  35.76 
 
 		 342 aa  206  4e-52  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000301485  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1252  aminopeptidase  32.46 
 
 		 344 aa  187  3e-46  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0654379  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0109  peptidase M42 family protein  34.49 
 
 		 340 aa  179  9e-44  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000430902  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2439  hypothetical protein  32.28 
 
 		 363 aa  171  3e-41  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0671697  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0952  peptidase M42 family protein  27.95 
 
 		 353 aa  119  7e-26  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00111271  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0820  peptidase M42 family protein  29.69 
 
 		 357 aa  83.2  0.000000000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.898697  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2999  peptidase M42 family protein  26.63 
 
 		 351 aa  68.2  0.0000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0724  peptidase M42 family protein  35.6 
 
 		 350 aa  67  0.0000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.143036  normal  0.785387 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3182  peptidases M20 and M42  24.58 
 
 		 346 aa  66.2  0.0000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0675112 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0441  cellulase  25.89 
 
 		 350 aa  66.2  0.0000000009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.174946  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2478  Cellulase  29.41 
 
 		 359 aa  65.9  0.000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2098  peptidase M42 family protein  27.73 
 
 		 353 aa  64.7  0.000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.940358 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0377  cellulase  26.04 
 
 		 340 aa  63.5  0.000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2270  glucanase  27.22 
 
 		 344 aa  63.2  0.000000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0368  cellulase  26.7 
 
 		 350 aa  62.4  0.00000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0158908 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0895  Cellulase  28.53 
 
 		 355 aa  62.4  0.00000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0950  cellulase  25.64 
 
 		 384 aa  62.8  0.00000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.374031  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0468  cellulase  26.7 
 
 		 350 aa  62  0.00000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0307085  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1551  cellulase  26.7 
 
 		 350 aa  61.2  0.00000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0709  cellulase  25.85 
 
 		 351 aa  60.5  0.00000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.000744044  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1495  Cellulase  23.01 
 
 		 353 aa  60.5  0.00000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2536  exoaminopeptidase  27.37 
 
 		 345 aa  60.1  0.00000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0452  cellulase  28.21 
 
 		 362 aa  60.1  0.00000006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.547156  normal  1 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0278  endo-1,4-beta-glucanase  24.16 
 
 		 363 aa  59.7  0.00000008  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0208  peptidase M42 family protein  23.68 
 
 		 334 aa  59.7  0.00000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.53357  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1273  Cellulase  28.42 
 
 		 345 aa  58.5  0.0000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.758281  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1285  exoaminopeptidase  28.42 
 
 		 345 aa  58.5  0.0000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.836873 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0599  peptidase M42 family protein  25.19 
 
 		 342 aa  58.9  0.0000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000044001  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0542  cellulase  27.48 
 
 		 362 aa  58.9  0.0000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.192278  hitchhiker  0.00117454 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2521  exoaminopeptidase  28.42 
 
 		 345 aa  58.5  0.0000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2674  exoaminopeptidase  28.42 
 
 		 345 aa  58.5  0.0000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2234  peptidase M42 family protein  27.54 
 
 		 354 aa  57.4  0.0000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.323516 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2409  Cellulase  30.77 
 
 		 348 aa  57.4  0.0000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3616  exoaminopeptidase  27.84 
 
 		 345 aa  57.4  0.0000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.874424 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0609  peptidase M42 family protein  25.6 
 
 		 316 aa  57  0.0000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.467193  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02294  predicted peptidase  28.42 
 
 		 345 aa  57  0.0000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1216  putative lyase/synthase  28.46 
 
 		 356 aa  57  0.0000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0144913  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02255  hypothetical protein  28.42 
 
 		 345 aa  57  0.0000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04171  predicted endoglucanase with Zn-dependent exopeptidase domain  25.09 
 
 		 373 aa  56.2  0.000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3694  peptidase M42 family protein  25.09 
 
 		 373 aa  56.2  0.000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2196  hydrolase, putative  27.94 
 
 		 354 aa  55.8  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.84144  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1595  glutamyl aminopeptidase  26.3 
 
 		 355 aa  55.8  0.000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.505343  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0177  cellulase  26.14 
 
 		 339 aa  56.2  0.000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1390  peptidase M42 family protein  27.27 
 
 		 354 aa  56.2  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0386243  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04133  hypothetical protein  25.09 
 
 		 373 aa  56.2  0.000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2294  peptidase M42  26.51 
 
 		 356 aa  55.5  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.365569  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1726  sgc region protein SgcX  26.67 
 
 		 372 aa  55.5  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.955403  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0738  peptidase M42  30.12 
 
 		 353 aa  55.5  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.511886  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1385  peptidase M42 family protein  28.51 
 
 		 357 aa  55.5  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0995  inositol phosphatase/fructose-1,6-bisphosphatase  31.32 
 
 		 349 aa  55.1  0.000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.383048 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1729  putative sgc region protein SgcX  26.73 
 
 		 372 aa  55.1  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1730  hypothetical protein  26.67 
 
 		 372 aa  55.5  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0782167  normal  0.771203 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0675  peptidase M42 family protein  28.96 
 
 		 359 aa  54.7  0.000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.873369  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0313  Cellulase  24.9 
 
 		 342 aa  54.3  0.000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1790  sgc region protein SgcX  26.67 
 
 		 372 aa  54.7  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.00171255  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2681  peptidase M42 family protein  26.45 
 
 		 415 aa  54.7  0.000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000914613 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1761  peptidase M42 family protein  26.18 
 
 		 348 aa  54.7  0.000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1087  peptidase M42  25.14 
 
 		 349 aa  53.9  0.000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0252  peptidase M42  25.69 
 
 		 350 aa  53.5  0.000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0378  peptidase M42 family protein  24.58 
 
 		 327 aa  53.5  0.000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1549  putative sgc region protein SgcX  26.27 
 
 		 372 aa  53.5  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>