69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_2845 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_2845    100 
 
 
965 bp  1913    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.133213 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2457    100 
 
 
893 bp  1770    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2458  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 
318 bp  91.7  4e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2846  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 
318 bp  91.7  4e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.114826 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3288  Integrase catalytic region  92.31 
 
 
963 bp  89.7  0.000000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1173  Integrase catalytic region  88.41 
 
 
969 bp  73.8  0.00000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0364  Integrase catalytic region  88.41 
 
 
969 bp  73.8  0.00000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0367  Integrase catalytic region  88.41 
 
 
969 bp  73.8  0.00000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0710    88.41 
 
 
5675 bp  73.8  0.00000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0712    88.41 
 
 
2569 bp  73.8  0.00000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0714    88.41 
 
 
969 bp  73.8  0.00000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0737  Integrase catalytic region  88.41 
 
 
969 bp  73.8  0.00000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0819  Integrase catalytic region  88.41 
 
 
969 bp  73.8  0.00000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1177  Integrase catalytic region  88.41 
 
 
969 bp  73.8  0.00000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1501  Integrase catalytic region  89.23 
 
 
969 bp  73.8  0.00000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1739  Integrase catalytic region  88.41 
 
 
969 bp  73.8  0.00000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0682469  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2588  Integrase catalytic region  88.41 
 
 
969 bp  73.8  0.00000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2656    88.41 
 
 
2656 bp  73.8  0.00000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2658  Integrase catalytic region  88.41 
 
 
969 bp  73.8  0.00000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2801  Integrase catalytic region  88.41 
 
 
969 bp  73.8  0.00000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0160717  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4660  Integrase catalytic region  88.41 
 
 
969 bp  73.8  0.00000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3287  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 
279 bp  69.9  0.000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2583    87.3 
 
 
3939 bp  61.9  0.0000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2043    100 
 
 
2389 bp  60  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.153153  hitchhiker  0.00767267 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2528  Integrase catalytic region  100 
 
 
906 bp  60  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000564647  hitchhiker  0.00383779 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1236  Integrase catalytic region  100 
 
 
876 bp  60  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.305005 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3483  Integrase catalytic region  100 
 
 
906 bp  60  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00971742  hitchhiker  0.00375901 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3608  Integrase catalytic region  100 
 
 
906 bp  60  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0251528  normal  0.0493713 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1309    86.36 
 
 
158 bp  60  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1216  Integrase catalytic region  92.68 
 
 
936 bp  58  0.000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4726    84.51 
 
 
3918 bp  54  0.00008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0063  transposase IS3/IS911 family protein  96.77 
 
 
330 bp  54  0.00008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06226  transposase and inactivated derivatives  96.67 
 
 
558 bp  52  0.0003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.87176  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02274  transposase and inactivated derivatives  96.67 
 
 
672 bp  52  0.0003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2669    92.11 
 
 
3924 bp  52  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00574  transposase and inactivated derivatives  96.67 
 
 
672 bp  52  0.0003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01088  transposase and inactivated derivatives  96.67 
 
 
558 bp  52  0.0003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.974261  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1217  transposase IS3/IS911 family protein  96.55 
 
 
327 bp  50.1  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11347  transposase  96.55 
 
 
327 bp  50.1  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  3.3772600000000003e-34  normal  0.888349 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11738    96.55 
 
 
1775 bp  50.1  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  6.28559e-27  normal  0.52056 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11740  transposase  96.55 
 
 
327 bp  50.1  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.53193e-56  normal  0.308652 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10853  transposase  96.55 
 
 
327 bp  50.1  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.71857e-46  hitchhiker  0.0000000080045 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11774  transposase  96.55 
 
 
327 bp  50.1  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  5.9098299999999996e-43  hitchhiker  0.00000000075724 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11781  transposase  96.55 
 
 
327 bp  50.1  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  6.66965e-85  hitchhiker  0.000000000569119 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11784  transposase  96.55 
 
 
327 bp  50.1  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  4.00725e-90  hitchhiker  0.0000000133913 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11791  transposase  96.55 
 
 
327 bp  50.1  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  7.324620000000001e-61  hitchhiker  0.00000385538 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11807  transposase  96.55 
 
 
327 bp  50.1  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  7.601339999999999e-45  hitchhiker  0.00672447 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12047    96.55 
 
 
2615 bp  50.1  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0256543  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12049  transposase  96.55 
 
 
327 bp  50.1  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  1.40799e-27  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12377  transposase  96.55 
 
 
327 bp  50.1  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  8.02474e-28  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12380  transposase  96.55 
 
 
327 bp  50.1  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.5215000000000001e-31  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1426  Integrase catalytic region  96.55 
 
 
915 bp  50.1  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0450418  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1608    96.55 
 
 
916 bp  50.1  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17790  Transposase  93.94 
 
 
321 bp  50.1  0.001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.837137  normal  0.630679 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2045  transposase IS3/IS911 family protein  96.55 
 
 
270 bp  50.1  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00952003  normal  0.01022 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2529  transposase IS3/IS911 family protein  96.55 
 
 
327 bp  50.1  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000311757  hitchhiker  0.00296744 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3482  transposase IS3/IS911 family protein  96.55 
 
 
327 bp  50.1  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0265992  hitchhiker  0.00308131 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13358  transposase  96.55 
 
 
327 bp  50.1  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.49743e-39  normal  0.534479 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3607  transposase IS3/IS911 family protein  96.55 
 
 
327 bp  50.1  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00876611  normal  0.0408746 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13207  transposase  96.55 
 
 
327 bp  50.1  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  4.838360000000001e-28  normal  0.797381 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13131  transposase  96.55 
 
 
327 bp  50.1  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.0000102607  normal  0.123533 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13130    96.55 
 
 
2027 bp  50.1  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.000997502  normal  0.0691909 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12829  transposase  96.55 
 
 
327 bp  50.1  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.40646e-19  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12417  transposase  96.55 
 
 
327 bp  50.1  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.85202e-36  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12415    96.55 
 
 
1916 bp  50.1  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000185069  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12113  transposase  96.55 
 
 
327 bp  50.1  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.72555e-57  normal  0.924844 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2586  transposase IS3/IS911 family protein  93.75 
 
 
318 bp  48.1  0.005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1500  transposase IS3/IS911 family protein  93.75 
 
 
318 bp  48.1  0.005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0064    81.25 
 
 
594 bp  48.1  0.005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>