More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_12417 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_13207  transposase  100 
 
 
108 aa  215  2e-55  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  4.838360000000001e-28  normal  0.797381 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12113  transposase  100 
 
 
108 aa  215  2e-55  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.72555e-57  normal  0.924844 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11791  transposase  100 
 
 
108 aa  215  2e-55  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  7.324620000000001e-61  hitchhiker  0.00000385538 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11781  transposase  100 
 
 
108 aa  215  2e-55  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  6.66965e-85  hitchhiker  0.000000000569119 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12829  transposase  100 
 
 
108 aa  215  2e-55  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.40646e-19  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12380  transposase  100 
 
 
108 aa  215  2e-55  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.5215000000000001e-31  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11774  transposase  100 
 
 
108 aa  215  2e-55  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  5.9098299999999996e-43  hitchhiker  0.00000000075724 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13358  transposase  100 
 
 
108 aa  215  2e-55  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.49743e-39  normal  0.534479 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13131  transposase  100 
 
 
108 aa  215  2e-55  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.0000102607  normal  0.123533 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11807  transposase  100 
 
 
108 aa  215  2e-55  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  7.601339999999999e-45  hitchhiker  0.00672447 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11784  transposase  100 
 
 
108 aa  215  2e-55  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  4.00725e-90  hitchhiker  0.0000000133913 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11740  transposase  100 
 
 
108 aa  215  2e-55  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.53193e-56  normal  0.308652 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12377  transposase  100 
 
 
108 aa  215  2e-55  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  8.02474e-28  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12049  transposase  100 
 
 
108 aa  215  2e-55  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  1.40799e-27  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12417  transposase  100 
 
 
108 aa  215  2e-55  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.85202e-36  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11347  transposase  100 
 
 
108 aa  215  2e-55  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  3.3772600000000003e-34  normal  0.888349 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10853  transposase  100 
 
 
108 aa  215  2e-55  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.71857e-46  hitchhiker  0.0000000080045 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3482  transposase IS3/IS911 family protein  77.57 
 
 
108 aa  168  2e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0265992  hitchhiker  0.00308131 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2529  transposase IS3/IS911 family protein  77.57 
 
 
108 aa  168  2e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000311757  hitchhiker  0.00296744 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3607  transposase IS3/IS911 family protein  77.57 
 
 
108 aa  168  2e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00876611  normal  0.0408746 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2223  transposase IS3/IS911 family protein  87.36 
 
 
89 aa  155  1e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.055564  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1239  transposase IS3/IS911 family protein  74.75 
 
 
111 aa  150  5e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.412797 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1203  transposase IS3/IS911 family protein  68.57 
 
 
109 aa  145  3e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5443  transposase IS3/IS911 family protein  66.67 
 
 
108 aa  144  3e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.181407  normal 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5601  transposase IS3/IS911  66.67 
 
 
108 aa  144  5e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_6002  transposase IS3/IS911 family protein  66.67 
 
 
108 aa  144  5e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000711123 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2045  transposase IS3/IS911 family protein  78.65 
 
 
89 aa  142  1e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00952003  normal  0.01022 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5432  transposase IS3/IS911  68.27 
 
 
121 aa  142  2e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  normal  0.115544 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5829  transposase IS3/IS911 family protein  68.27 
 
 
121 aa  142  2e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.342164 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0063  transposase IS3/IS911 family protein  61.17 
 
 
109 aa  120  9e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2587  hypothetical protein  73.68 
 
 
92 aa  114  6e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000140598  hitchhiker  0.000388749 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2586  transposase IS3/IS911 family protein  55.88 
 
 
105 aa  109  1.0000000000000001e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2936  transposase IS3/IS911 family protein  56.44 
 
 
107 aa  109  1.0000000000000001e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.312037  normal  0.721078 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2458  transposase IS3/IS911 family protein  55.24 
 
 
105 aa  107  7.000000000000001e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2846  transposase IS3/IS911 family protein  55.24 
 
 
105 aa  107  7.000000000000001e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.114826 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0906  transposase IS3/IS911 family protein  55.77 
 
 
107 aa  107  7.000000000000001e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2819  transposase IS3/IS911 family protein  56.86 
 
 
107 aa  105  3e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6068  transposase DNA binding site ISRme15  52.34 
 
 
112 aa  104  4e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.382564 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5542  transposase DNA binding site ISRme15  52.34 
 
 
112 aa  104  4e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1827  transposase IS3/IS911 family protein  52.34 
 
 
109 aa  104  4e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.601714  normal  0.0105174 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0009  transposase IS3/IS911 family protein  52.34 
 
 
109 aa  104  4e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.445184  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0739  transposase IS3/IS911 family protein  52.34 
 
 
109 aa  104  4e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0235806  normal  0.101516 
 
 
-
 
NC_010518  Mrad2831_6464  transposase IS3/IS911 family protein  54.9 
 
 
108 aa  103  6e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6427  transposase IS3/IS911 family protein  54.9 
 
 
108 aa  103  6e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  0.906991 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1500  transposase IS3/IS911 family protein  53.92 
 
 
105 aa  103  8e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1610  ISAfe7, transposase orfA  52.34 
 
 
109 aa  103  8e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.20784  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1427  transposase IS3/IS911 family protein  52.34 
 
 
109 aa  103  8e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.199874  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1403  transposase IS3/IS911 family protein  53.7 
 
 
106 aa  102  1e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.261774  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0381  transposase IS3/IS911 family protein  53.7 
 
 
106 aa  102  1e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4623  transposase IS3/IS911 family protein  53.7 
 
 
106 aa  102  1e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0223543  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3905  transposase IS3/IS911 family protein  54.9 
 
 
107 aa  102  1e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.86052  normal  0.925618 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4236  transposase IS3/IS911 family protein  53.7 
 
 
106 aa  102  1e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4081  transposase IS3/IS911 family protein  53.7 
 
 
106 aa  102  1e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1894  transposase IS3/IS911 family protein  53.7 
 
 
106 aa  102  1e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.310472  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0742  transposase IS3/IS911 family protein  53.7 
 
 
106 aa  102  1e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3254  transposase IS3/IS911 family protein  53.85 
 
 
107 aa  102  2e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6733  transposase IS3/IS911 family protein  54.9 
 
 
108 aa  102  2e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.975909  normal  0.0498418 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9899  hypothetical protein  47.27 
 
 
109 aa  102  3e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3845  transposase IS3/IS911 family protein  48.54 
 
 
107 aa  101  3e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.9013  normal  0.358266 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9837  transposase protein  47.27 
 
 
109 aa  102  3e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5123  transposase IS3/IS911  54.9 
 
 
107 aa  101  4e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.166362 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5203  transposase IS3/IS911  54.9 
 
 
107 aa  101  4e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.296974  normal  0.946293 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1217  transposase IS3/IS911 family protein  54.21 
 
 
108 aa  101  4e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1895  ISMca3, transposase, OrfA  56 
 
 
107 aa  100  6e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.827912  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0366  transposase IS3/IS911 family protein  50.96 
 
 
105 aa  100  9e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2657  transposase IS3/IS911 family protein  50.96 
 
 
105 aa  100  9e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0818  transposase IS3/IS911 family protein  50.96 
 
 
105 aa  100  9e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0365  transposase IS3/IS911 family protein  50.96 
 
 
105 aa  100  9e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0713  transposase IS3/IS911 family protein  50.96 
 
 
105 aa  100  9e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1740  transposase IS3/IS911 family protein  50.96 
 
 
105 aa  100  9e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.698666  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1174  transposase IS3/IS911 family protein  50.96 
 
 
105 aa  100  9e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1178  transposase IS3/IS911 family protein  50.96 
 
 
105 aa  100  9e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4659  transposase IS3/IS911 family protein  50.96 
 
 
105 aa  100  9e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2800  transposase IS3/IS911 family protein  50.96 
 
 
105 aa  100  9e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0137371  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2668  transposase IS3/IS911 family protein  50.96 
 
 
105 aa  100  9e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2587  transposase IS3/IS911 family protein  50.96 
 
 
105 aa  100  9e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.771833  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3737  transposase IS3/IS911 family protein  52.43 
 
 
110 aa  99  2e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3706  transposase IS3/IS911 family protein  52.43 
 
 
110 aa  99  2e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4729  transposase IS3/IS911 family protein  50 
 
 
105 aa  98.6  2e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1140  transposase IS3/IS911 family protein  52.88 
 
 
107 aa  99  2e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.816485  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4952  transposase IS3/IS911 family protein  54 
 
 
108 aa  99  2e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1223  transposase IS3/IS911 family protein  56.86 
 
 
108 aa  97.1  8e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.16285  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1221  transposase IS3/IS911 family protein  56.86 
 
 
108 aa  97.1  8e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.774632  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1573  transposase IS3/IS911  48.6 
 
 
109 aa  96.7  9e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2119  transposase IS3/IS911  48.6 
 
 
109 aa  96.7  9e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3161  transposase IS3/IS911 family protein  48.54 
 
 
107 aa  96.7  1e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.465896  normal  0.307305 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1304  IS629, transposase orfA  54.46 
 
 
108 aa  95.9  2e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.679412 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1380  IS629, transposase orfA  54.46 
 
 
108 aa  95.9  2e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0740626 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2679  IS629, transposase orfA  54.46 
 
 
108 aa  95.9  2e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0539496  normal  0.023589 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2447  transposase IS3/IS911 family protein  55.88 
 
 
108 aa  95.9  2e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000211632  hitchhiker  0.00944163 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17790  Transposase  46.53 
 
 
106 aa  94.4  4e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.837137  normal  0.630679 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8266  hypothetical protein  45.45 
 
 
109 aa  94.4  4e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1617  transposase IS3/IS911 family protein  47.17 
 
 
107 aa  94  6e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3562  transposase IS3/IS911 family protein  47.17 
 
 
107 aa  94  6e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.107559  normal  0.12566 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5654  transposase IS3/IS911 family protein  50.52 
 
 
104 aa  94  7e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.238743  normal 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5988  transposase IS3/IS911 family protein  50.52 
 
 
104 aa  94  7e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000845611 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0929  transposase IS3/IS911  49.5 
 
 
127 aa  93.2  1e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2593  transposase IS3/IS911  49.5 
 
 
114 aa  93.2  1e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.214558  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4706  transposase IS3/IS911 family protein  51.96 
 
 
108 aa  92.8  1e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0600  Fis family transcriptional regulator  49.5 
 
 
114 aa  93.2  1e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.981407  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>