23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_2481 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_2481  secreted protein  100 
 
 
217 aa  446  1.0000000000000001e-124  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00290  hypothetical protein  48.17 
 
 
311 aa  194  1e-48  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.787751 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8881  hypothetical protein  46.08 
 
 
231 aa  190  2e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0765  secreted protein  47.25 
 
 
295 aa  186  2e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0077  hypothetical protein  45.21 
 
 
335 aa  177  1e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0783  secreted protein  45.12 
 
 
272 aa  166  2.9999999999999998e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.358394  normal  0.147269 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2913  secreted protein  41.01 
 
 
293 aa  150  1e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4746  hypothetical protein  42.66 
 
 
275 aa  149  3e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.525812  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1789  secreted protein  43.14 
 
 
248 aa  148  6e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.546813  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4890  hypothetical protein  38.46 
 
 
300 aa  145  7.0000000000000006e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4891  hypothetical protein  37.87 
 
 
291 aa  140  1.9999999999999998e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2531  TM1410 hypothetical-related protein  41.09 
 
 
275 aa  84.7  0.000000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0125598  normal  0.844499 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2434  TM1410 hypothetical-related protein  34.33 
 
 
296 aa  78.2  0.00000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00342831  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4700  TM1410 hypothetical-related protein  34.78 
 
 
290 aa  68.6  0.00000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.267519  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3224  hypothetical protein  35.56 
 
 
299 aa  66.2  0.0000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0681  endo alpha-1,4 polygalactosaminidase precusor  31.47 
 
 
268 aa  64.3  0.000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3631  hypothetical protein  31.33 
 
 
275 aa  63.5  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1840  hypothetical protein  34.88 
 
 
277 aa  60.1  0.00000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2438  hypothetical protein  32.81 
 
 
482 aa  58.5  0.00000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.349941  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08154  conserved hypothetical protein  30.43 
 
 
336 aa  55.1  0.0000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.809637 
 
 
-
 
NC_006692  CNG01530  endo alpha-1,4 polygalactosaminidase precusor, putative  30.46 
 
 
359 aa  52.4  0.000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1078  TM1410 hypothetical-related protein  34.82 
 
 
279 aa  48.9  0.00005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.494543 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3951  hypothetical protein  26.56 
 
 
338 aa  47.4  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>