More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_1234 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_1234  protein of unknown function DUF21  100 
 
 
453 aa  873    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.981961  normal  0.106715 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1222  protein of unknown function DUF21  62.06 
 
 
439 aa  457  1e-127  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.250523  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09590  CBS domain-containing protein  56.33 
 
 
443 aa  436  1e-121  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.328849 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1954  hypothetical protein  55.12 
 
 
574 aa  434  1e-120  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0113455  normal  0.562335 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2999  hypothetical protein  53.47 
 
 
503 aa  423  1e-117  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.280207  normal  0.727721 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2378  protein of unknown function DUF21  54.59 
 
 
443 aa  419  1e-116  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000393714 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2484  protein of unknown function DUF21  55.66 
 
 
442 aa  417  9.999999999999999e-116  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2643  hypothetical protein  54.29 
 
 
445 aa  414  1e-114  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3662  hypothetical protein  53.02 
 
 
453 aa  410  1e-113  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5344  protein of unknown function DUF21  54.19 
 
 
444 aa  407  1.0000000000000001e-112  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.308769  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5679  protein of unknown function DUF21  54.15 
 
 
450 aa  404  1e-111  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.372603  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0063  protein of unknown function DUF21  52.79 
 
 
452 aa  398  1e-109  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22510  CBS domain-containing protein  50.12 
 
 
438 aa  381  1e-104  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0516538  normal  0.801852 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2962  protein of unknown function DUF21  50.49 
 
 
486 aa  382  1e-104  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.387429  hitchhiker  0.00195258 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2764  protein of unknown function DUF21  49.24 
 
 
461 aa  380  1e-104  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.357691  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1722  protein of unknown function DUF21  48.58 
 
 
460 aa  371  1e-101  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.564871  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31520  CBS domain-containing protein  47.69 
 
 
455 aa  370  1e-101  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2720  hypothetical protein  51.11 
 
 
451 aa  370  1e-101  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0508  protein of unknown function DUF21  53.29 
 
 
451 aa  363  3e-99  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2371  protein of unknown function DUF21  45.5 
 
 
490 aa  363  3e-99  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.304604 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07750  CBS domain-containing protein  52.57 
 
 
438 aa  359  4e-98  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2317  protein of unknown function DUF21  48.51 
 
 
450 aa  357  3.9999999999999996e-97  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3094  hypothetical protein  48.35 
 
 
451 aa  355  6.999999999999999e-97  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.292492  normal  0.43311 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3364  hypothetical protein  47.17 
 
 
457 aa  352  5.9999999999999994e-96  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2814  hypothetical protein  49.2 
 
 
471 aa  348  1e-94  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2858  hypothetical protein  49.2 
 
 
471 aa  348  1e-94  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.860129  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2841  hypothetical protein  49.2 
 
 
470 aa  348  1e-94  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.245306  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0914  hypothetical protein  50.67 
 
 
474 aa  336  5e-91  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.447806  normal  0.0678288 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6404  hypothetical protein  45.31 
 
 
452 aa  336  5.999999999999999e-91  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11870  hypothetical protein  46.14 
 
 
455 aa  326  6e-88  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0136182  normal  0.440152 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0047  hypothetical protein  40.94 
 
 
520 aa  272  8.000000000000001e-72  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1409  hypothetical protein  41.29 
 
 
452 aa  261  3e-68  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.464754 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1368  hypothetical protein  41.54 
 
 
452 aa  257  3e-67  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000999119 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4665  protein of unknown function DUF21  38.6 
 
 
441 aa  251  2e-65  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6909  hypothetical protein  37.76 
 
 
451 aa  248  2e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.97846  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24020  CBS domain-containing protein  38.8 
 
 
451 aa  244  3e-63  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.94366 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5779  protein of unknown function DUF21  42.16 
 
 
468 aa  242  7.999999999999999e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2179  protein of unknown function DUF21  36.7 
 
 
431 aa  231  1e-59  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1801  CBS domain containing protein  50.63 
 
 
339 aa  228  1e-58  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.205512  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3477  hypothetical protein  37.05 
 
 
458 aa  227  3e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3544  protein of unknown function DUF21  31.37 
 
 
446 aa  227  3e-58  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3540  hypothetical protein  37.05 
 
 
458 aa  227  3e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.228644  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3490  hypothetical protein  37.05 
 
 
458 aa  226  5.0000000000000005e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0119  protein of unknown function DUF21  40.05 
 
 
486 aa  225  1e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.458192  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3277  protein of unknown function DUF21  32.94 
 
 
437 aa  223  4e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000233033  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1763  hypothetical protein  31.04 
 
 
446 aa  217  2.9999999999999998e-55  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0455  conserved hypothetical protein, putative efflux protein (DUF21 domain protein)  29.9 
 
 
456 aa  216  5e-55  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.844865  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1705  pyruvate-ferredoxin oxidoreductase  28.37 
 
 
446 aa  215  9.999999999999999e-55  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1685  CBS  36.91 
 
 
462 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2595  hypothetical protein  32.95 
 
 
476 aa  214  1.9999999999999998e-54  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0389  hypothetical protein  36.41 
 
 
438 aa  214  1.9999999999999998e-54  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3860  hypothetical protein  35.73 
 
 
453 aa  214  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.188072  normal  0.0935065 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4410  protein of unknown function DUF21  33.26 
 
 
444 aa  213  7e-54  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.938013  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2004  hypothetical protein  32.45 
 
 
431 aa  212  1e-53  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0445  protein of unknown function DUF21  37.41 
 
 
451 aa  211  2e-53  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0534885  normal  0.0812429 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3370  CBS domain protein  30.05 
 
 
442 aa  209  6e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0644  magnesium and cobalt efflux protein CorC  27.44 
 
 
442 aa  209  9e-53  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3392  CBS domain-containing protein  30.05 
 
 
442 aa  209  1e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1855  CBS domain protein  30.05 
 
 
442 aa  209  1e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3156  hypothetical protein  29.81 
 
 
442 aa  207  2e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3066  hypothetical protein  30.05 
 
 
442 aa  208  2e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.928407  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3396  CBS domain protein  29.81 
 
 
442 aa  208  2e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3391  CBS domain protein  29.81 
 
 
442 aa  207  2e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1941  protein of unknown function DUF21  34.83 
 
 
460 aa  208  2e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.164047  normal  0.0989418 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3172  CBS domain-containing protein  29.58 
 
 
442 aa  206  5e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.903732  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1588  protein of unknown function DUF21  34.11 
 
 
443 aa  206  6e-52  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0176  transporter, putative  28.17 
 
 
428 aa  206  6e-52  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0252  protein of unknown function DUF21  28.92 
 
 
434 aa  206  7e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000514588  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3422  CBS domain-containing protein  29.48 
 
 
435 aa  205  1e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1072  hypothetical protein  33.25 
 
 
442 aa  205  1e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.638225  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2683  CBS domain-containing protein  36.45 
 
 
455 aa  205  1e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.522065  normal  0.368276 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4066  protein of unknown function DUF21  30.68 
 
 
438 aa  204  2e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.659836  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0247  protein of unknown function DUF21  32.53 
 
 
446 aa  204  3e-51  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1409  hemolysin-like protein  34.1 
 
 
447 aa  203  5e-51  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0519  hypothetical protein  31 
 
 
432 aa  202  7e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3095  hypothetical protein  29.34 
 
 
440 aa  202  8e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0877278  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0646  magnesium and cobalt efflux protein CorC  31.4 
 
 
432 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0238417  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2134  CBS domain-containing protein  29.79 
 
 
451 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0519  hypothetical protein  31 
 
 
432 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2072  magnesium and cobalt efflux protein  29.79 
 
 
451 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0473612  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2288  CBS domain-containing protein  29.79 
 
 
451 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.779019  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02510  CBS domain-containing protein  34.94 
 
 
470 aa  202  9.999999999999999e-51  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2313  CBS domain protein  29.29 
 
 
443 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0521  protein of unknown function DUF21  31.51 
 
 
448 aa  201  1.9999999999999998e-50  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0703  protein of unknown function DUF21  30.79 
 
 
477 aa  201  1.9999999999999998e-50  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.401824 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0664  CBS domain protein  31 
 
 
432 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.7650000000000002e-36 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2296  protein of unknown function DUF21  32.38 
 
 
433 aa  201  3e-50  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.23749  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2397  CBS domain protein  29.86 
 
 
443 aa  201  3e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3055  CBS domain protein  29.62 
 
 
443 aa  200  3.9999999999999996e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0525  hypothetical protein  29.41 
 
 
441 aa  200  5e-50  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.806161  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0522  hypothetical protein  31.16 
 
 
432 aa  199  6e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0735  CBS domain protein  30.93 
 
 
432 aa  199  7.999999999999999e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4692  magnesium and cobalt efflux protein CorC  31.07 
 
 
425 aa  199  9e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.200662  hitchhiker  0.0000000000000291685 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0760  protein of unknown function DUF21  32.87 
 
 
437 aa  198  1.0000000000000001e-49  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.332278 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05880  CBS domain-containing protein  36.27 
 
 
478 aa  198  2.0000000000000003e-49  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.927545 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2793  protein of unknown function DUF21  36.82 
 
 
464 aa  198  2.0000000000000003e-49  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1875  hemolysin-like protein  28 
 
 
435 aa  197  3e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0753435  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2160  CBS domain protein  28 
 
 
435 aa  197  3e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00238227  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2092  CBS domain protein  28 
 
 
435 aa  197  3e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2767  hypothetical protein  32.63 
 
 
434 aa  197  3e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>