More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_1724 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013174  Jden_1724  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  100 
 
 
330 aa  655    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.150194  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10420  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  57.37 
 
 
334 aa  311  9e-84  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.331856  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2411  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  50.88 
 
 
339 aa  264  1e-69  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.68052  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1103  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  47.75 
 
 
326 aa  248  7e-65  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0277485  hitchhiker  0.00248079 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1347  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  49.11 
 
 
336 aa  241  2e-62  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.684281  normal  0.495905 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2464  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  45.54 
 
 
316 aa  224  2e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000261274 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0594  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  42.24 
 
 
313 aa  222  4.9999999999999996e-57  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3680  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  44.21 
 
 
330 aa  218  1e-55  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2741  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  43.17 
 
 
317 aa  212  5.999999999999999e-54  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1816  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  41.72 
 
 
317 aa  210  3e-53  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.378347  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0639  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  40.57 
 
 
321 aa  204  1e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0658  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  41.09 
 
 
320 aa  201  1.9999999999999998e-50  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.647471  normal  0.560292 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0257  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  40.87 
 
 
314 aa  199  5e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.589105  normal  0.147331 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2845  electron transfer flavoprotein subunit alpha  39.26 
 
 
317 aa  198  1.0000000000000001e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8113  electron transfer flavoprotein alpha subunit  41.01 
 
 
317 aa  198  1.0000000000000001e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.733777 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1075  electron transfer flavoprotein alpha subunit  38.55 
 
 
320 aa  193  3e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09610  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  38.32 
 
 
317 aa  193  4e-48  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0631029  normal  0.104642 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2916  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  38.37 
 
 
318 aa  191  2e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.113103  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4091  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  39.27 
 
 
320 aa  189  5e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1211  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  41.59 
 
 
319 aa  186  5e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13044  electron transfer flavoprotein alpha subunit fixB  39.26 
 
 
318 aa  186  7e-46  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00188433  hitchhiker  0.00116016 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2355  Electron transfer flavoprotein subunit alpha  39.69 
 
 
315 aa  185  9e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3658  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  39.76 
 
 
320 aa  185  1.0000000000000001e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1104  electron transfer flavoprotein alpha subunit  41.28 
 
 
319 aa  181  2e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.217236  normal  0.0210631 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3259  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  35.89 
 
 
317 aa  179  8e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1851  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  39.57 
 
 
318 aa  177  3e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.404972  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1871  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  39.57 
 
 
318 aa  177  3e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.118776  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1917  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  39.57 
 
 
318 aa  177  3e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0811412  normal  0.638543 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4258  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  40.18 
 
 
318 aa  175  9.999999999999999e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28250  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  38.34 
 
 
319 aa  174  1.9999999999999998e-42  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3574  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  39.51 
 
 
316 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00172694  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1298  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  38.27 
 
 
316 aa  174  2.9999999999999996e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2861  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  35.71 
 
 
329 aa  172  7.999999999999999e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2100  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  39.26 
 
 
318 aa  171  2e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3647  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  35.71 
 
 
329 aa  170  4e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0685  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  38.54 
 
 
321 aa  165  8e-40  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.999571 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1439  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  38.65 
 
 
322 aa  162  6e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0369672  normal  0.926882 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6050  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  38.04 
 
 
319 aa  162  9e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0697  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  32.71 
 
 
317 aa  159  6e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3165  electron transfer flavoprotein alpha subunit  42.06 
 
 
317 aa  159  7e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0053  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  41.99 
 
 
320 aa  158  2e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0065  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  41.99 
 
 
320 aa  157  2e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.777154  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0049  electron transfer flavoprotein alpha and beta subunits  40.87 
 
 
321 aa  156  5.0000000000000005e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0050  electron transfer flavoprotein alpha and beta subunits  38.87 
 
 
320 aa  154  2.9999999999999998e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.69565 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2132  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  33.44 
 
 
436 aa  149  7e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000989021 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1484  electron transfer flavoprotein alpha subunit  30.95 
 
 
397 aa  148  1.0000000000000001e-34  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.11518  normal  0.562863 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1040  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  37.39 
 
 
322 aa  147  2.0000000000000003e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.577604  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1435  electron transfer flavoprotein fixB (alpha subunit)  33.83 
 
 
367 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000130268  normal  0.0153048 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001582  electron transfer flavoprotein alpha subunit  37.35 
 
 
321 aa  147  3e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1501  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  31.45 
 
 
442 aa  145  1e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2715  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  30.29 
 
 
439 aa  144  3e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.777462 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0411  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  34.06 
 
 
325 aa  142  8e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0831  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  31.82 
 
 
325 aa  142  9.999999999999999e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2625  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  30.15 
 
 
325 aa  141  1.9999999999999998e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000950552  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1607  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  28.27 
 
 
399 aa  140  3e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0684  electron transfer flavoprotein subunit alpha  31.82 
 
 
443 aa  140  3e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0329544  normal  0.845757 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000408  electron transfer flavoprotein alpha subunit  34.89 
 
 
308 aa  140  3e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0571  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  29.79 
 
 
443 aa  139  6e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.871139  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1699  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  34.57 
 
 
326 aa  139  6e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.440081  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1212  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  28.7 
 
 
441 aa  139  7e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.72306  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4534  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  31.06 
 
 
328 aa  139  7e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0891717  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1358  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  32.75 
 
 
452 aa  139  7e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2927  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  32.75 
 
 
452 aa  139  7e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3222  electron transfer flavoprotein alpha subunit  31.34 
 
 
325 aa  139  7.999999999999999e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2257  electron transfer flavoprotein subunit alpha  30.86 
 
 
442 aa  138  1e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00336089  hitchhiker  0.0000000000804212 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2415  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  30.56 
 
 
441 aa  138  1e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2796  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  30.36 
 
 
340 aa  138  2e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1354  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  31.79 
 
 
334 aa  137  2e-31  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00167442  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2066  electron transfer flavoprotein subunit alpha  29.88 
 
 
448 aa  137  2e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2314  electron transfer flavoprotein beta-subunit  31.89 
 
 
371 aa  137  2e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.261239  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2134  electron transfer flavoprotein alpha subunit  35.29 
 
 
317 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0583  electron transfer flavoprotein alpha subunit  28.99 
 
 
341 aa  136  4e-31  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7738  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  30.7 
 
 
374 aa  136  4e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0342501  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1369  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  31.23 
 
 
374 aa  136  5e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0430  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  46.25 
 
 
327 aa  136  5e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.169777  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2086  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  33.64 
 
 
436 aa  136  6.0000000000000005e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1990  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  37.55 
 
 
311 aa  135  7.000000000000001e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1446  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  36.52 
 
 
307 aa  135  8e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0198023  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0163  electron transfer flavoprotein alpha subunit  35.11 
 
 
317 aa  135  8e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4350  electron transfer flavoprotein alpha subunit  30.91 
 
 
325 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.233822  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0300  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  34.65 
 
 
315 aa  135  9.999999999999999e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006686  CND05770  ETF1-related  32.53 
 
 
346 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.182105  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1470  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  37.13 
 
 
313 aa  134  1.9999999999999998e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0862538  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1857  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  36.39 
 
 
330 aa  134  3e-30  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.519797  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0327  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  51.15 
 
 
323 aa  133  5e-30  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000160988  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0584  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  34.81 
 
 
311 aa  132  6e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.292903  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1063  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  34.81 
 
 
311 aa  132  6e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.760076  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0605  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  31.21 
 
 
325 aa  132  6.999999999999999e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16420  Electron transfer flavoprotein, alpha subunit  39.27 
 
 
309 aa  132  6.999999999999999e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0845524  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1022  electron transfer flavoprotein alpha subunit  34.81 
 
 
311 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3235  electron transfer flavoprotein alpha subunit  37.83 
 
 
307 aa  132  9e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.320471 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4418  electron transfer flavoprotein subunit alpha  30.91 
 
 
325 aa  132  9e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4257  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  30.91 
 
 
325 aa  132  9e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4759  electron transfer flavoprotein subunit alpha  30.91 
 
 
325 aa  132  9e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4634  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  30.91 
 
 
325 aa  132  9e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1373  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  33.44 
 
 
399 aa  132  9e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.255821  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4649  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  30.45 
 
 
325 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4269  electron transfer flavoprotein, alpha subunit (alpha-ETF)  30.45 
 
 
325 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2786  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  32.39 
 
 
447 aa  131  1.0000000000000001e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0764  Electron transfer flavoprotein subunit alpha  36.89 
 
 
313 aa  132  1.0000000000000001e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>