38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_0779 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013174  Jden_0779  addiction module antitoxin  100 
 
 
70 aa  142  2e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2100  plasmid stabilization system  50.88 
 
 
85 aa  70.9  0.000000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.60445 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3300  addiction module antitoxin  51.43 
 
 
87 aa  70.1  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.991321  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0823  plasmid stabilization system  49.12 
 
 
87 aa  66.2  0.0000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.305872  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3715  addiction module toxin, RelE/StbE family  56.86 
 
 
89 aa  62.4  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0773  plasmid stabilization system  50.98 
 
 
84 aa  60.8  0.000000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1039  addiction module antitoxin  47.17 
 
 
85 aa  58.5  0.00000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.584776  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2497  plasmid stabilization system protein  44.07 
 
 
87 aa  53.5  0.0000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.812855 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2645  plasmid stabilization system  48.21 
 
 
84 aa  53.9  0.0000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0214244 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0985  addiction module toxin, RelE/StbE family  49.06 
 
 
85 aa  53.1  0.000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2099  addiction module antitoxin  44.64 
 
 
85 aa  52  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0782  plasmid stabilization system  33.33 
 
 
85 aa  50.8  0.000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00543713  normal  0.858319 
 
 
-
 
NC_013735  Slin_7033  addiction module toxin, RelE/StbE family  34.38 
 
 
92 aa  50.1  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.705501  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1442  hypothetical protein  41.51 
 
 
59 aa  48.5  0.00003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0362351 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1966  addiction module toxin, RelE/StbE  43.75 
 
 
85 aa  47  0.00009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0245113  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1978  hypothetical protein  35.82 
 
 
85 aa  47  0.0001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0628  addiction module toxin, RelE/StbE family  48.39 
 
 
85 aa  45.8  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.692097  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3992  plasmid stabilization system  45.1 
 
 
87 aa  45.1  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0288858  normal  0.818838 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1635  addiction module antitoxin  40.35 
 
 
84 aa  44.3  0.0005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.537799  hitchhiker  0.001685 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1483  addiction module toxin, RelE/StbE family  34.55 
 
 
86 aa  43.5  0.001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0031992  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3192  plasmid stabilization system  45.83 
 
 
86 aa  43.5  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1956  plasmid stabilization system protein  44.12 
 
 
70 aa  43.1  0.001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000296244  n/a   
 
 
 
NC_007796  Mhun_1873  addiction module toxin, RelE/StbE  37.5 
 
 
92 aa  42.7  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.331501  normal 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4314  addiction module antitoxin  33.33 
 
 
95 aa  42.7  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.100162  hitchhiker  0.0025912 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1376  addiction module antitoxin  47.17 
 
 
86 aa  42  0.003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0603  plasmid stabilization system  51.22 
 
 
103 aa  42  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.837316  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1787  hypothetical protein  39.62 
 
 
69 aa  42  0.003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1021  RelE protein  43.9 
 
 
83 aa  42  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0735  hypothetical protein  32.84 
 
 
85 aa  42  0.003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000118152  n/a   
 
 
-
 
NC_007515  Gmet_A3569  addiction module toxin, RelE/StbE  48.57 
 
 
90 aa  41.6  0.004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000172224  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3231  hypothetical protein  40 
 
 
88 aa  41.2  0.005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.73498  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1338  addiction module toxin, RelE/StbE family  48.08 
 
 
86 aa  41.2  0.005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3688  addiction module antitoxin  32.26 
 
 
95 aa  40.8  0.006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.125211  normal  0.144102 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4185  addiction module toxin, RelE/StbE family  33.33 
 
 
95 aa  40.8  0.007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1625  addiction module toxin, RelE/StbE family  50 
 
 
90 aa  40.8  0.007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00126224  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4716  addiction module toxin RelE  33.33 
 
 
96 aa  40.4  0.008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1617  addiction module antitoxin  42.86 
 
 
92 aa  40.4  0.008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000591233  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0155  plasmid stabilization system protein  37.04 
 
 
77 aa  40.4  0.008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.123434 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>