58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B0155 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B0155  plasmid stabilization system protein  100 
 
 
77 aa  152  1e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.123434 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5382  addiction module antitoxin  93.42 
 
 
93 aa  144  4.0000000000000006e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.584673 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4836  addiction module antitoxin  92.11 
 
 
93 aa  142  2e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5358  plasmid stabilization system protein  88.89 
 
 
72 aa  130  5e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5502  plasmid stabilization system protein  88.89 
 
 
72 aa  130  5e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.518192  normal 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3688  addiction module antitoxin  69.74 
 
 
95 aa  113  7.999999999999999e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.125211  normal  0.144102 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3785  stability protein StbE  65.79 
 
 
96 aa  105  3e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011204  SeD_B0115  putative stability protein StbE  67.12 
 
 
93 aa  105  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.000821269  normal  0.655848 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0890  stability protein StbE, putative  64.47 
 
 
93 aa  103  7e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1012  addiction module toxin, RelE/StbE family  64.47 
 
 
93 aa  103  7e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.247568  hitchhiker  0.000000000573461 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2258  addiction module toxin, RelE/StbE family  61.84 
 
 
95 aa  96.3  1e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.000000000447442  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1619  putative stability protein StbE  60 
 
 
94 aa  95.5  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.476443  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1655  putative stability protein StbE  56.58 
 
 
94 aa  95.9  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1721  putative stability protein StbE  58.57 
 
 
94 aa  94.7  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.165239  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0319  addiction module toxin, RelE/StbE family  61.43 
 
 
95 aa  94.4  5e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0691287  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4769  plasmid stabilization system protein  92 
 
 
50 aa  94.4  5e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4546  addiction module antitoxin  61.84 
 
 
95 aa  92.4  2e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.747035  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4716  addiction module toxin RelE  63.01 
 
 
96 aa  92  2e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0794  hypothetical protein  61.43 
 
 
96 aa  92  2e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.385271  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0018  toxin RelE  60.53 
 
 
95 aa  91.3  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2079  addiction module toxin, RelE/StbE family  60.53 
 
 
95 aa  91.3  4e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00218718  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2072  addiction module antitoxin  60.53 
 
 
95 aa  91.3  4e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2439  RelE protein  59.21 
 
 
96 aa  90.5  7e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0193835  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0708  addiction module toxin, RelE/StbE family  57.89 
 
 
94 aa  88.6  3e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1469  putative plasmid stabilisation system protein  56.58 
 
 
94 aa  88.6  3e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.165331  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4185  addiction module toxin, RelE/StbE family  56.58 
 
 
95 aa  88.2  3e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1588  hypothetical protein  69.64 
 
 
85 aa  87.8  4e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0823  hypothetical protein  56.94 
 
 
96 aa  87.4  6e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.382841  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3849  addiction module antitoxin  55.26 
 
 
103 aa  85.5  2e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000246767 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2227  addiction module antitoxin  55.26 
 
 
94 aa  85.9  2e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0239944  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0435  addiction module antitoxin  60.53 
 
 
94 aa  85.9  2e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4314  addiction module antitoxin  53.95 
 
 
95 aa  85.1  3e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.100162  hitchhiker  0.0025912 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0089  hypothetical protein  53.25 
 
 
95 aa  82.4  0.000000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.735538  n/a   
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4397  addiction module antitoxin  56.58 
 
 
94 aa  81.3  0.000000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  normal  0.935834 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4647  addiction module antitoxin  56.58 
 
 
94 aa  81.3  0.000000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4332  addiction module toxin, RelE/StbE family  56.58 
 
 
94 aa  81.3  0.000000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4469  addiction module toxin, RelE/StbE family  56.58 
 
 
94 aa  81.3  0.000000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.505994  normal  0.573834 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1208  plasmid stabilization system protein  61.19 
 
 
81 aa  78.6  0.00000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3376  addiction module antitoxin  57.14 
 
 
88 aa  75.1  0.0000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4830  putative stability protein StbE  61.84 
 
 
94 aa  75.1  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3833  plasmid stabilization system protein  59.21 
 
 
96 aa  74.3  0.0000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2746  addiction module toxin, RelE/StbE family  53.25 
 
 
106 aa  72  0.000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4701  putative stability protein StbE  63.16 
 
 
94 aa  70.9  0.000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.86483 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5387  stability cassette protein, putative  59.21 
 
 
96 aa  69.7  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4796  putative stability protein StbE  61.84 
 
 
94 aa  69.3  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44980  Cytotoxin, RelE protein  55.26 
 
 
93 aa  68.2  0.00000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1073  addiction module toxin, RelE/StbE family  45.45 
 
 
114 aa  68.6  0.00000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.588523  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1758  addiction module toxin, RelE/StbE family  45.45 
 
 
114 aa  68.6  0.00000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.532041  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4851  putative stability protein StbE  61.84 
 
 
94 aa  67.8  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0244  addiction module toxin, RelE/StbE family  45.45 
 
 
109 aa  58.5  0.00000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4264  hypothetical protein  64.44 
 
 
49 aa  58.2  0.00000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4228  hypothetical protein  63.64 
 
 
49 aa  56.6  0.0000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1119  addiction module toxin, RelE/StbE  63.64 
 
 
95 aa  55.8  0.0000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.197659  normal  0.189109 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1266  hypothetical protein  60 
 
 
95 aa  53.9  0.0000006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0704408  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00613  putative relE protein  50 
 
 
97 aa  53.5  0.000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.164171  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1997  addiction module antitoxin  61.11 
 
 
37 aa  44.7  0.0005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.67699  normal  0.618648 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3603  prevent-host-death family protein  37.68 
 
 
176 aa  41.6  0.003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0779  addiction module antitoxin  37.04 
 
 
70 aa  40.4  0.007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>