41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_3104 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_3104  hypothetical protein  100 
 
 
85 aa  178  2e-44  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0633963  normal  0.35406 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5224  hypothetical protein  36.59 
 
 
148 aa  57.4  0.00000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0931  hypothetical protein  33.33 
 
 
140 aa  53.9  0.0000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0455  hypothetical protein  33.33 
 
 
212 aa  51.2  0.000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0915  protein of unknown function DUF1486  30 
 
 
138 aa  50.4  0.000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.282506  normal  0.0578966 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5540  protein of unknown function DUF1486  32.91 
 
 
138 aa  50.4  0.000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1261  protein of unknown function DUF1486  36.07 
 
 
182 aa  49.7  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00537261  normal  0.341449 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0474  hypothetical protein  32.5 
 
 
212 aa  48.5  0.00003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0316  protein of unknown function DUF1486  37.93 
 
 
138 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4925  hypothetical protein  36 
 
 
137 aa  48.1  0.00004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.773252  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2666  protein of unknown function DUF1486  33.9 
 
 
142 aa  47.8  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5286  hypothetical protein  31.71 
 
 
137 aa  47.8  0.00006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4914  hypothetical protein  36 
 
 
137 aa  47.4  0.00006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.208327  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1354  hypothetical protein  32.79 
 
 
185 aa  47.4  0.00007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1394  hypothetical protein  32.79 
 
 
185 aa  47.4  0.00007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.984832  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4678  protein of unknown function DUF1486  31.25 
 
 
141 aa  47.4  0.00008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000675641 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3693  hypothetical protein  33.72 
 
 
214 aa  46.6  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0952  protein of unknown function DUF1486  35.82 
 
 
149 aa  46.2  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0666254  decreased coverage  0.00444563 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1469  hypothetical protein  31.15 
 
 
185 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0987  hypothetical protein  31.15 
 
 
185 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.983826  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2545  protein of unknown function DUF1486  28.92 
 
 
139 aa  45.1  0.0003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4152  hypothetical protein  30.86 
 
 
214 aa  45.4  0.0003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1447  hypothetical protein  31.15 
 
 
185 aa  45.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0560331  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5397  hypothetical protein  32.79 
 
 
187 aa  45.1  0.0004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.255025  normal  0.733155 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3974  hypothetical protein  30.67 
 
 
131 aa  44.7  0.0004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1710  hypothetical protein  30.38 
 
 
142 aa  44.7  0.0004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.518536  normal  0.0462427 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2604  hypothetical protein  31.15 
 
 
186 aa  44.3  0.0005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26760  predicted ester cyclase  28.92 
 
 
140 aa  44.3  0.0006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.683774  normal  0.316469 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2394  protein of unknown function DUF1486  30.86 
 
 
180 aa  43.5  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2801  protein of unknown function DUF1486  31.25 
 
 
181 aa  42.7  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.19615  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1646  protein of unknown function DUF1486  26.58 
 
 
152 aa  42.4  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.081161  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1719  protein of unknown function DUF1486  26.58 
 
 
152 aa  42.4  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5626  protein of unknown function DUF1486  28.4 
 
 
147 aa  42.4  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1624  hypothetical protein  25.3 
 
 
151 aa  42.4  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000580657 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2975  hypothetical protein  24.36 
 
 
152 aa  42  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.903707  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2638  hypothetical protein  29.11 
 
 
174 aa  41.6  0.004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0675425  normal  0.0108071 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4651  hypothetical protein  25.64 
 
 
186 aa  41.6  0.004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.712908 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0932  putative lipoprotein  32.79 
 
 
179 aa  40.4  0.009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.6654500000000002e-29 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0996  protein of unknown function DUF1486  35.48 
 
 
173 aa  40.4  0.009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3371  hypothetical protein  26.51 
 
 
133 aa  40  0.01  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.032421  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0746  hypothetical protein  32.79 
 
 
182 aa  40  0.01  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00470157  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>