37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_1370 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_1370  hypothetical protein  100 
 
 
338 aa  673    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.378457 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2203  hypothetical protein  50 
 
 
342 aa  320  1.9999999999999998e-86  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.54755  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0565  hypothetical protein  49.26 
 
 
338 aa  298  9e-80  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0195  putative signal peptide protein  50.48 
 
 
329 aa  269  5.9999999999999995e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.533491  normal  0.303405 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1544  signal peptide protein  50.48 
 
 
329 aa  253  3e-66  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3024  periplasmic lipoprotein-like protein  48.28 
 
 
332 aa  249  4e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  hitchhiker  0.00846426  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3297  periplasmic lipoprotein-like protein  30.25 
 
 
353 aa  120  3e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56850  putative lipoprotein  29.75 
 
 
354 aa  119  7e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4941  putative lipoprotein  29.18 
 
 
354 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4477  lipoprotein  30.45 
 
 
354 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.24024  normal  0.364663 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0977  lipoprotein  30.11 
 
 
354 aa  116  5e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00313194 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0909  hypothetical protein  30.17 
 
 
354 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0948  periplasmic lipoprotein-like protein  30.17 
 
 
354 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02712  hypothetical protein  27.16 
 
 
345 aa  112  6e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4490  putative lipoprotein  28.49 
 
 
354 aa  106  5e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.020416 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0641  hypothetical protein  27.43 
 
 
358 aa  104  2e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0333  hypothetical protein  27.68 
 
 
374 aa  102  9e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3527  putative signal peptide protein  25.74 
 
 
377 aa  102  1e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.793517  normal  0.789193 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2559  periplasmic lipoprotein-like protein  27.6 
 
 
352 aa  100  3e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0351138  hitchhiker  0.00000000167803 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003125  iron-regulated protein A precursor  25.33 
 
 
345 aa  99.8  6e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.392653  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4313  hypothetical protein  27.54 
 
 
366 aa  98.6  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4576  hypothetical protein  28.12 
 
 
366 aa  98.2  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0477994 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2835  periplasmic lipoprotein  27.53 
 
 
344 aa  96.7  5e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.962002  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4064  putative lipoprotein  28.04 
 
 
354 aa  92  1e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.82498  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1784  putative lipoprotein  24.74 
 
 
339 aa  90.9  3e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.327643  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4368  lipoprotein, putative  28.04 
 
 
354 aa  90.9  3e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37860  hypothetical protein  26.99 
 
 
354 aa  90.5  4e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.214112  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3194  hypothetical protein  27.24 
 
 
373 aa  84.7  0.000000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.967593  normal  0.475895 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0885  putative lipoprotein  26.43 
 
 
335 aa  78.6  0.0000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.584322  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2084  hypothetical protein  25.47 
 
 
387 aa  70.9  0.00000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.868997 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1802  hypothetical protein  23.56 
 
 
389 aa  67  0.0000000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2143  periplasmic lipoprotein-like protein  23.62 
 
 
380 aa  61.6  0.00000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0403933 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0668  hypothetical protein  22.03 
 
 
378 aa  60.1  0.00000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0864322  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0805  periplasmic lipoprotein-like protein  26.05 
 
 
355 aa  58.9  0.0000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3870  Peptidase M75, Imelysin  22.74 
 
 
391 aa  58.9  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.755425  normal  0.516703 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1462  imelysin  23.9 
 
 
356 aa  58.2  0.0000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0336824  normal  0.0166245 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2721  Peptidase M75, Imelysin  24.7 
 
 
425 aa  55.5  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00128061  normal  0.730271 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>