More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_1410 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013202  Hmuk_1886  cytochrome bd ubiquinol oxidase subunit I  71.4 
 
 
484 aa  682    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.821372  normal  0.085717 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1410  cytochrome bd ubiquinol oxidase subunit I  100 
 
 
489 aa  981    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1037  cytochrome bd ubiquinol oxidase subunit I  61.15 
 
 
490 aa  576  1.0000000000000001e-163  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.323871  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4038  cytochrome bd ubiquinol oxidase subunit I  60.94 
 
 
475 aa  544  1e-153  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0832301  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4570  cytochrome bd ubiquinol oxidase subunit I  50.22 
 
 
474 aa  464  1e-129  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3307  cytochrome bd ubiquinol oxidase subunit I  41.34 
 
 
535 aa  319  7e-86  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.145074 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2420  cytochrome bd ubiquinol oxidase, subunit I  40.85 
 
 
470 aa  310  4e-83  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0237667  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3573  cytochrome bd ubiquinol oxidase subunit I  41.03 
 
 
444 aa  310  4e-83  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0993209 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0914  cytochrome bd ubiquinol oxidase subunit I  40.81 
 
 
444 aa  309  9e-83  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0596  cytochrome bd ubiquinol oxidase subunit I  40.56 
 
 
463 aa  309  1.0000000000000001e-82  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.317837  normal  0.23611 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0930  cytochrome bd ubiquinol oxidase, subunit I  41.28 
 
 
444 aa  306  7e-82  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4157  cytochrome bd ubiquinol oxidase subunit I  39.82 
 
 
474 aa  305  9.000000000000001e-82  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.129966  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0175  cytochrome bd ubiquinol oxidase, subunit I  42.11 
 
 
470 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.770178  normal  0.160076 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5120  cytochrome bd ubiquinol oxidase subunit I  42.14 
 
 
465 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.204733 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4853  cytochrome bd ubiquinol oxidase subunit I  41.9 
 
 
470 aa  304  3.0000000000000004e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.887906  normal  0.189641 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000807  putative Cytochrome bd2 subunit I  39.36 
 
 
462 aa  303  5.000000000000001e-81  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3449  cytochrome bd ubiquinol oxidase subunit I  40.94 
 
 
444 aa  301  1e-80  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4791  cytochrome bd ubiquinol oxidase subunit I  41.67 
 
 
470 aa  302  1e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1175  quinol oxidase, subunit I  40.28 
 
 
445 aa  302  1e-80  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.868577  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0943  cytochrome bd ubiquinol oxidase, subunit I  39.91 
 
 
476 aa  301  2e-80  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1087  cytochrome bd ubiquinol oxidase, subunit I  39.91 
 
 
476 aa  301  2e-80  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5383  cytochrome bd ubiquinol oxidase, subunit I  41.67 
 
 
559 aa  301  2e-80  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.330151  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5478  cytochrome bd ubiquinol oxidase, subunit I  41.67 
 
 
470 aa  301  2e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0727881  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2045  cytochrome bd ubiquinol oxidase, subunit I  40.04 
 
 
470 aa  300  3e-80  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3376  cytochrome bd ubiquinol oxidase subunit I  41.16 
 
 
444 aa  300  4e-80  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0740  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit I  38.95 
 
 
468 aa  300  6e-80  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5365  cytochrome bd ubiquinol oxidase subunit I  43.81 
 
 
473 aa  299  6e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4818  cytochrome bd ubiquinol oxidase, subunit I  43.81 
 
 
473 aa  299  6e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.702735  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3837  quinol oxidase, subunit I  43.14 
 
 
457 aa  299  9e-80  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03151  putative transmembrane cytochrome bd-II oxidase (subunit I) oxidoreductase protein  41.24 
 
 
482 aa  298  2e-79  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.014009 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1228  cytochrome d ubiquinol oxidase subunit I  40.14 
 
 
479 aa  296  4e-79  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1463  cytochrome bd ubiquinol oxidase, subunit I  40.13 
 
 
479 aa  296  6e-79  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.409499  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4066  cytochrome bd ubiquinol oxidase, subunit I  40.73 
 
 
478 aa  296  7e-79  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.487615  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4893  cytochrome bd ubiquinol oxidase, subunit I  40.94 
 
 
478 aa  294  2e-78  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.455192  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4955  cytochrome bd ubiquinol oxidase subunit I  39.61 
 
 
477 aa  294  2e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0964  cytochrome bd ubiquinol oxidase, subunit I  40.58 
 
 
446 aa  295  2e-78  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.694189  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4651  ubiquinol oxidase subunit I, cyanide insensitive  40.22 
 
 
478 aa  294  3e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4513  cytochrome bd ubiquinol oxidase, subunit I  40.22 
 
 
478 aa  294  3e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.307129  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4645  cytochrome bd ubiquinol oxidase subunit I  40 
 
 
478 aa  294  3e-78  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.666381  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1177  cyanide insensitive terminal oxidase  38.53 
 
 
482 aa  293  5e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2001  cytochrome bd ubiquinol oxidase, subunit I  40.22 
 
 
473 aa  292  8e-78  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13030  CioA, cyanide insensitive terminal oxidase  38.31 
 
 
488 aa  292  8e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2148  ubiquinol oxidase family protein  41.81 
 
 
553 aa  291  2e-77  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3858  hypothetical protein  39.57 
 
 
465 aa  291  2e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.84507  normal  0.940576 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1810  putative cytochrome oxidase subunit I  40.4 
 
 
471 aa  291  2e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0784206 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1787  cytochrome bd ubiquinol oxidase, subunit I  38.44 
 
 
481 aa  291  2e-77  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.757925  normal  0.268506 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4284  cytochrome bd ubiquinol oxidase, subunit I  39.49 
 
 
480 aa  290  3e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0696889  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3212  quinol oxidase subunit I QxtA  40.85 
 
 
465 aa  290  4e-77  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.94532  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3952  cytochrome bd ubiquinol oxidase, subunit I  40.85 
 
 
465 aa  290  4e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0206665  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3593  cytochrome ubiquinol oxidase subunit 1 transmembrane protein  37.69 
 
 
472 aa  289  7e-77  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11050  Cytochrome bd ubiquinol oxidase, subunit I  39.01 
 
 
476 aa  289  8e-77  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1515  cytochrome bd ubiquinol oxidase, subunit I  38.12 
 
 
507 aa  289  8e-77  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0454  cytochrome bd-II oxidase subunit 1  39.33 
 
 
467 aa  288  1e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.84306  hitchhiker  0.00000000000000419123 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2100  ubiquinol oxidase family protein  41.38 
 
 
470 aa  288  1e-76  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1835  ubiquinol oxidase family protein  41.38 
 
 
470 aa  288  1e-76  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00477233  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0335  cyanide-insensitive terminal oxidase CioA  41.38 
 
 
470 aa  288  1e-76  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.148907  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0391  cytochrome bd-II oxidase subunit 1  39.33 
 
 
467 aa  288  1e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  3.45959e-19 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0428  cyanide-insensitive terminal oxidase CioA  41.38 
 
 
470 aa  288  1e-76  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1127  ubiquinol oxidase family protein  41.38 
 
 
470 aa  288  1e-76  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.586085  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0400  cytochrome bd-II oxidase subunit 1  39.33 
 
 
467 aa  288  1e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.603816  hitchhiker  5.12206e-16 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0394  cyanide-insensitive oxidase CioA  39.33 
 
 
467 aa  288  1e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0928  cytochrome bd ubiquinol oxidase, subunit I  39.82 
 
 
446 aa  288  1e-76  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.177592  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0412  cytochrome bd-II oxidase subunit 1  39.33 
 
 
467 aa  288  1e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.534696  hitchhiker  0.0000241042 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1268  cytochrome bd ubiquinol oxidase subunit I  39.4 
 
 
464 aa  288  2e-76  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.948596 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1770  ubiquinol oxidase family protein  41.38 
 
 
617 aa  288  2e-76  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.257846  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0836  ubiquinol oxidase family protein  41.38 
 
 
592 aa  288  2e-76  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0222344  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1694  cytochrome bd ubiquinol oxidase, subunit I  38.36 
 
 
497 aa  288  2e-76  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.199449  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2573  cytochrome D ubiquinol oxidase subunit  39.37 
 
 
460 aa  286  4e-76  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03483  quinol oxidase, subunit I  40.7 
 
 
457 aa  286  5e-76  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4670  cytochrome bd ubiquinol oxidase, subunit I  39.49 
 
 
468 aa  286  5e-76  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.402337  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0416  cytochrome bd ubiquinol oxidase, subunit I  39.15 
 
 
468 aa  286  5.999999999999999e-76  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.155315 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0092  cytochrome bd ubiquinol oxidase, subunit I  39.13 
 
 
469 aa  286  7e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4010  cytochrome bd ubiquinol oxidase, subunit I  40.96 
 
 
467 aa  285  1.0000000000000001e-75  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1250  cytochrome bd ubiquinol oxidase subunit I  37.67 
 
 
482 aa  284  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000387  putative Cytochrome bd2 subunit I  39.11 
 
 
457 aa  285  2.0000000000000002e-75  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3386  cytochrome bd ubiquinol oxidase, subunit I  39.63 
 
 
471 aa  284  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5232  cytochrome bd ubiquinol oxidase subunit I  37.94 
 
 
453 aa  283  4.0000000000000003e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.534541 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3130  cytochrome bd ubiquinol oxidase, subunit I  38.71 
 
 
467 aa  283  5.000000000000001e-75  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.176017 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0787  cytochrome bd ubiquinol oxidase subunit I  39.78 
 
 
478 aa  283  6.000000000000001e-75  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4101  cytochrome bd ubiquinol oxidase, subunit I  38.74 
 
 
483 aa  283  6.000000000000001e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.142601  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3288  cytochrome bd ubiquinol oxidase subunit I  38.55 
 
 
462 aa  283  6.000000000000001e-75  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3118  cytochrome d ubiquinol oxidase subunit I  39.45 
 
 
480 aa  282  7.000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3153  cytochrome bd ubiquinol oxidase subunit I  39.43 
 
 
466 aa  282  9e-75  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2859  cytochrome bd ubiquinol oxidase subunit I  39.21 
 
 
466 aa  281  1e-74  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.664602 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3927  cytochrome bd ubiquinol oxidase subunit I  40.9 
 
 
465 aa  282  1e-74  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4117  cytochrome bd ubiquinol oxidase, subunit I  40.63 
 
 
466 aa  281  1e-74  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2529  cytochrome bd ubiquinol oxidase subunit I  37.72 
 
 
471 aa  282  1e-74  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.895258  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1472  cytochrome bd ubiquinol oxidase subunit I  39.82 
 
 
466 aa  281  2e-74  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.412208 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0494  cytochrome bd ubiquinol oxidase, subunit I  39.13 
 
 
470 aa  281  2e-74  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.896027  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1966  cytochrome D ubiquinol oxidase subunit I  39.81 
 
 
481 aa  280  3e-74  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.234936  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5279  cytochrome bd ubiquinol oxidase subunit I  39.26 
 
 
468 aa  280  3e-74  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.332035  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0746  cytochrome bd ubiquinol oxidase, subunit I  38.74 
 
 
479 aa  280  4e-74  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.265352  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1874  cytochrome oxidase, subunit I  39.81 
 
 
481 aa  280  4e-74  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5511  cytochrome bd ubiquinol oxidase subunit I  37.61 
 
 
475 aa  280  5e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.260472 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1533  cytochrome bd ubiquinol oxidase subunit I  40.1 
 
 
465 aa  279  6e-74  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0786665  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1639  cytochrome bd ubiquinol oxidase, subunit I  37.12 
 
 
462 aa  279  7e-74  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000461914  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2163  cytochrome bd ubiquinol oxidase, subunit I  39.56 
 
 
447 aa  278  1e-73  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000856883  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00095  putative transmembrane cytochrome bd-ii oxidase (subunit i) oxidoreductase protein  39.63 
 
 
441 aa  278  2e-73  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2649  cytochrome bd ubiquinol oxidase subunit I  39.38 
 
 
436 aa  278  2e-73  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000262773  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5724  hypothetical protein  38.57 
 
 
462 aa  277  2e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.20304  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>