More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_4038 on replicon NC_013924
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013924  Nmag_4038  cytochrome bd ubiquinol oxidase subunit I  100 
 
 
475 aa  952    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0832301  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1037  cytochrome bd ubiquinol oxidase subunit I  65.63 
 
 
490 aa  589  1e-167  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.323871  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1886  cytochrome bd ubiquinol oxidase subunit I  60.93 
 
 
484 aa  565  1e-160  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.821372  normal  0.085717 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1410  cytochrome bd ubiquinol oxidase subunit I  60.94 
 
 
489 aa  544  1e-153  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4570  cytochrome bd ubiquinol oxidase subunit I  55.7 
 
 
474 aa  485  1e-136  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2420  cytochrome bd ubiquinol oxidase, subunit I  39.91 
 
 
470 aa  299  9e-80  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0237667  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1175  quinol oxidase, subunit I  38.76 
 
 
445 aa  296  4e-79  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.868577  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0596  cytochrome bd ubiquinol oxidase subunit I  39.26 
 
 
463 aa  295  9e-79  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.317837  normal  0.23611 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0930  cytochrome bd ubiquinol oxidase, subunit I  38.44 
 
 
444 aa  290  4e-77  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3573  cytochrome bd ubiquinol oxidase subunit I  38.21 
 
 
444 aa  289  7e-77  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0993209 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3837  quinol oxidase, subunit I  38.29 
 
 
457 aa  289  8e-77  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2001  cytochrome bd ubiquinol oxidase, subunit I  38.02 
 
 
473 aa  289  1e-76  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4955  cytochrome bd ubiquinol oxidase subunit I  39.26 
 
 
477 aa  287  2e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0914  cytochrome bd ubiquinol oxidase subunit I  37.97 
 
 
444 aa  288  2e-76  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0740  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit I  37.77 
 
 
468 aa  287  4e-76  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1077  cytochrome bd ubiquinol oxidase subunit I  33.94 
 
 
511 aa  286  5.999999999999999e-76  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.737699  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3307  cytochrome bd ubiquinol oxidase subunit I  37.18 
 
 
535 aa  286  5.999999999999999e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.145074 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1639  cytochrome bd ubiquinol oxidase, subunit I  37.2 
 
 
462 aa  285  8e-76  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000461914  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000807  putative Cytochrome bd2 subunit I  36.56 
 
 
462 aa  285  1.0000000000000001e-75  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2045  cytochrome bd ubiquinol oxidase, subunit I  37.53 
 
 
470 aa  285  1.0000000000000001e-75  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2163  cytochrome bd ubiquinol oxidase, subunit I  37.77 
 
 
447 aa  285  2.0000000000000002e-75  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000856883  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0175  cytochrome bd ubiquinol oxidase, subunit I  37.18 
 
 
470 aa  282  1e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.770178  normal  0.160076 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000387  putative Cytochrome bd2 subunit I  35.55 
 
 
457 aa  281  2e-74  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3376  cytochrome bd ubiquinol oxidase subunit I  38.21 
 
 
444 aa  281  2e-74  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0928  cytochrome bd ubiquinol oxidase, subunit I  38.05 
 
 
446 aa  281  2e-74  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.177592  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4066  cytochrome bd ubiquinol oxidase, subunit I  38.27 
 
 
478 aa  280  3e-74  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.487615  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0964  cytochrome bd ubiquinol oxidase, subunit I  37.83 
 
 
446 aa  279  7e-74  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.694189  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4645  cytochrome bd ubiquinol oxidase subunit I  36.85 
 
 
478 aa  279  9e-74  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.666381  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4791  cytochrome bd ubiquinol oxidase subunit I  36.89 
 
 
470 aa  279  9e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3449  cytochrome bd ubiquinol oxidase subunit I  38.21 
 
 
444 aa  278  1e-73  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5478  cytochrome bd ubiquinol oxidase, subunit I  36.89 
 
 
470 aa  278  1e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0727881  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0943  cytochrome bd ubiquinol oxidase, subunit I  38.9 
 
 
476 aa  277  2e-73  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1087  cytochrome bd ubiquinol oxidase, subunit I  38.9 
 
 
476 aa  277  2e-73  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5383  cytochrome bd ubiquinol oxidase, subunit I  36.89 
 
 
559 aa  278  2e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.330151  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4651  ubiquinol oxidase subunit I, cyanide insensitive  36.64 
 
 
478 aa  277  3e-73  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4513  cytochrome bd ubiquinol oxidase, subunit I  36.64 
 
 
478 aa  277  3e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.307129  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4157  cytochrome bd ubiquinol oxidase subunit I  36.34 
 
 
474 aa  277  4e-73  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.129966  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1228  cytochrome d ubiquinol oxidase subunit I  34.77 
 
 
479 aa  276  4e-73  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4284  cytochrome bd ubiquinol oxidase, subunit I  38.75 
 
 
480 aa  276  6e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0696889  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3730  cytochrome bd ubiquinol oxidase, subunit I  39.53 
 
 
446 aa  275  1.0000000000000001e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.577823  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5232  cytochrome bd ubiquinol oxidase subunit I  36.84 
 
 
453 aa  274  2.0000000000000002e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.534541 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3091  cytochrome d ubiquinol oxidase subunit I  36.79 
 
 
444 aa  273  4.0000000000000004e-72  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000134482  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1268  cytochrome bd ubiquinol oxidase subunit I  37.76 
 
 
464 aa  273  6e-72  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.948596 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5365  cytochrome bd ubiquinol oxidase subunit I  36.44 
 
 
473 aa  273  6e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4818  cytochrome bd ubiquinol oxidase, subunit I  36.44 
 
 
473 aa  273  6e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.702735  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1966  cytochrome D ubiquinol oxidase subunit I  38.44 
 
 
481 aa  273  6e-72  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.234936  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03483  quinol oxidase, subunit I  36.49 
 
 
457 aa  273  7e-72  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1874  cytochrome oxidase, subunit I  38.44 
 
 
481 aa  272  8.000000000000001e-72  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1167  cytochrome bd ubiquinol oxidase, subunit I  38.37 
 
 
448 aa  272  8.000000000000001e-72  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000118063  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2859  cytochrome bd ubiquinol oxidase subunit I  37.18 
 
 
466 aa  272  1e-71  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.664602 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11050  Cytochrome bd ubiquinol oxidase, subunit I  36.48 
 
 
476 aa  271  1e-71  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1640  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit I  36.58 
 
 
450 aa  271  2e-71  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.592672  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1250  cytochrome bd ubiquinol oxidase subunit I  37 
 
 
482 aa  271  2e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3212  quinol oxidase subunit I QxtA  39.11 
 
 
465 aa  270  2.9999999999999997e-71  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.94532  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2148  ubiquinol oxidase family protein  36.67 
 
 
553 aa  271  2.9999999999999997e-71  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1787  cytochrome bd ubiquinol oxidase, subunit I  36.9 
 
 
481 aa  270  2.9999999999999997e-71  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.757925  normal  0.268506 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4893  cytochrome bd ubiquinol oxidase, subunit I  36.96 
 
 
478 aa  270  4e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.455192  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3952  cytochrome bd ubiquinol oxidase, subunit I  39.11 
 
 
465 aa  270  4e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0206665  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0467  cytochrome bd ubiquinol oxidase subunit I  35.16 
 
 
514 aa  270  5e-71  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.455582  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0494  cytochrome bd ubiquinol oxidase, subunit I  35.24 
 
 
470 aa  270  5e-71  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.896027  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4853  cytochrome bd ubiquinol oxidase subunit I  38.9 
 
 
470 aa  270  5e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.887906  normal  0.189641 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2573  cytochrome D ubiquinol oxidase subunit  35.32 
 
 
460 aa  269  7e-71  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1930  cytochrome bd ubiquinol oxidase, subunit I  36.58 
 
 
450 aa  269  8e-71  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000222762  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1463  cytochrome bd ubiquinol oxidase, subunit I  36.56 
 
 
479 aa  269  8e-71  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.409499  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13030  CioA, cyanide insensitive terminal oxidase  34.9 
 
 
488 aa  269  8e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS03151  putative transmembrane cytochrome bd-II oxidase (subunit I) oxidoreductase protein  37.32 
 
 
482 aa  269  1e-70  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.014009 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3787  cytochrome bd ubiquinol oxidase subunit I  39.53 
 
 
446 aa  268  1e-70  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.353174  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1177  cyanide insensitive terminal oxidase  34.9 
 
 
482 aa  268  1e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3858  hypothetical protein  40.05 
 
 
465 aa  268  1e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.84507  normal  0.940576 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2688  cytochrome bd-II oxidase subunit 1  36.88 
 
 
464 aa  268  1e-70  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0249782  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4282  cytochrome bd ubiquinol oxidase, subunit I  37.86 
 
 
479 aa  268  2e-70  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.586205  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0787  cytochrome bd ubiquinol oxidase subunit I  37.07 
 
 
478 aa  268  2e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3871  cytochrome bd ubiquinol oxidase subunit I  39.3 
 
 
446 aa  268  2e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1127  ubiquinol oxidase family protein  36.89 
 
 
470 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.586085  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4648  cyanide-insensitive terminal oxidase CioA  38.11 
 
 
479 aa  267  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1835  ubiquinol oxidase family protein  36.89 
 
 
470 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00477233  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2100  ubiquinol oxidase family protein  36.89 
 
 
470 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0335  cyanide-insensitive terminal oxidase CioA  36.89 
 
 
470 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.148907  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0428  cyanide-insensitive terminal oxidase CioA  36.89 
 
 
470 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2021  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit I  33.9 
 
 
467 aa  267  4e-70  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.4498  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0836  ubiquinol oxidase family protein  36.89 
 
 
592 aa  266  4e-70  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0222344  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2042  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit I  33.9 
 
 
467 aa  266  4e-70  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0996454  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3153  cytochrome bd ubiquinol oxidase subunit I  35 
 
 
466 aa  266  5.999999999999999e-70  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1770  ubiquinol oxidase family protein  36.89 
 
 
617 aa  266  5.999999999999999e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.257846  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3386  cytochrome bd ubiquinol oxidase, subunit I  35.71 
 
 
471 aa  266  5.999999999999999e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1760  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit I  33.69 
 
 
467 aa  266  7e-70  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1803  cytochrome d ubiquinol oxidase subunit I  33.69 
 
 
467 aa  265  1e-69  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1777  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit I  33.69 
 
 
467 aa  265  1e-69  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.367755  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1515  cytochrome bd ubiquinol oxidase, subunit I  34.38 
 
 
507 aa  265  1e-69  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1208  cytochrome bd ubiquinol oxidase subunit I  37.53 
 
 
448 aa  265  1e-69  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000278283  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1943  cytochrome d ubiquinol oxidase subunit I  33.69 
 
 
467 aa  265  1e-69  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1978  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit I  33.69 
 
 
467 aa  265  1e-69  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.517890000000001e-18 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3118  cytochrome d ubiquinol oxidase subunit I  35.68 
 
 
480 aa  264  2e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1694  cytochrome bd ubiquinol oxidase, subunit I  36.34 
 
 
497 aa  265  2e-69  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.199449  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3385  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit I  33.48 
 
 
467 aa  264  2e-69  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.877242  hitchhiker  0.000000000343287 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0416  cytochrome bd ubiquinol oxidase, subunit I  37.56 
 
 
468 aa  265  2e-69  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.155315 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1943  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit I  33.48 
 
 
467 aa  264  2e-69  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4879  cytochrome bd ubiquinol oxidase, subunit I  35.8 
 
 
461 aa  264  3e-69  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3593  cytochrome ubiquinol oxidase subunit 1 transmembrane protein  37.74 
 
 
472 aa  264  3e-69  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4010  cytochrome bd ubiquinol oxidase, subunit I  38.17 
 
 
467 aa  264  3e-69  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>