34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_5112 on replicon NC_013747
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013747  Htur_5112  hypothetical protein  100 
 
 
336 aa  685    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0964659  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3044  hypothetical protein  75.52 
 
 
340 aa  542  1e-153  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3442  hypothetical protein  52.32 
 
 
338 aa  305  5.0000000000000004e-82  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.768278  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2500  hypothetical protein  41.09 
 
 
350 aa  254  1.0000000000000001e-66  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3173  hypothetical protein  34.15 
 
 
334 aa  149  5e-35  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.298047 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3432  hypothetical protein  32.39 
 
 
339 aa  133  5e-30  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1831  hypothetical protein  23.45 
 
 
339 aa  102  1e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2313  hypothetical protein  25.96 
 
 
342 aa  96.3  7e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1337  hypothetical protein  23.89 
 
 
342 aa  89  1e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2314  hypothetical protein  24.45 
 
 
338 aa  85.5  0.000000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0663  hypothetical protein  25.23 
 
 
332 aa  75.9  0.0000000000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3045  methicillin resistance protein  25.47 
 
 
335 aa  75.1  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2312  hypothetical protein  25.16 
 
 
343 aa  74.7  0.000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2169  hypothetical protein  29.94 
 
 
360 aa  68.6  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.764152  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1880  hypothetical protein  24.78 
 
 
309 aa  58.2  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2411  protein of unknown function DUF482  25.97 
 
 
372 aa  58.5  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1739  femAB family protein  24.72 
 
 
354 aa  53.9  0.000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00186266  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2216  FemAB-related protein, PEP-CTERM system- associated  26.97 
 
 
342 aa  52.8  0.000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0882  hypothetical protein  20.86 
 
 
309 aa  52  0.00002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.92764 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3053  Methicillin resistance protein  28.39 
 
 
354 aa  49.3  0.00008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000266593 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0970  hypothetical protein  27.49 
 
 
346 aa  48.5  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.534214  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1195  hypothetical protein  21.83 
 
 
355 aa  48.1  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1113  hypothetical protein  20.68 
 
 
335 aa  48.5  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.79737  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2969  hypothetical protein  25.58 
 
 
346 aa  47.8  0.0003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.852464  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5796  Methicillin resistance protein  27.22 
 
 
370 aa  47.4  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3349  hypothetical protein  27.69 
 
 
364 aa  47.4  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1294  Methicillin resistance protein  23.42 
 
 
340 aa  47.4  0.0004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.402759 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2093  Methicillin resistance protein  23.6 
 
 
346 aa  47  0.0005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.801885  normal 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3065  hypothetical protein  22.59 
 
 
348 aa  45.4  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0204721  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0739  methicillin resistance protein  30.3 
 
 
368 aa  44.7  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.274792  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4843  Methicillin resistance protein  22.35 
 
 
360 aa  43.9  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000953777  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2344  hypothetical protein  24.72 
 
 
344 aa  43.5  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1611  Methicillin resistance protein  25 
 
 
370 aa  43.1  0.007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2369  FemAB-related protein, PEP-CTERM system-associated  27.71 
 
 
368 aa  42.7  0.009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>