34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_1269 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013743  Htur_1269  Curlin associated repeat protein  100 
 
 
245 aa  464  9.999999999999999e-131  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1516  curlin-associated protein  34.74 
 
 
552 aa  62.4  0.000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.977405  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2172  curlin-associated protein  35.71 
 
 
170 aa  59.3  0.00000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.650786  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4724  hypothetical protein  25.29 
 
 
470 aa  58.5  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2604  Curlin associated repeat protein  38.71 
 
 
151 aa  56.6  0.0000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01045  hypothetical protein  38.71 
 
 
151 aa  56.6  0.0000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2558  curlin minor subunit  38.71 
 
 
151 aa  56.6  0.0000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.361683 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1160  curlin minor subunit  38.71 
 
 
151 aa  56.6  0.0000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.48235  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01038  curlin nucleator protein, minor subunit in curli complex  38.71 
 
 
151 aa  56.6  0.0000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1557  curlin minor subunit  39.78 
 
 
151 aa  55.8  0.0000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.350896  normal  0.586693 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4677  Curlin associated repeat protein  26.64 
 
 
392 aa  55.8  0.0000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.119342  normal  0.286934 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1161  curlin minor subunit  38.71 
 
 
160 aa  55.8  0.0000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.627916  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1421  curlin minor subunit  38.71 
 
 
160 aa  55.8  0.0000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.256433 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2090  curlin minor subunit  38.71 
 
 
160 aa  55.1  0.000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.230335 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1514  curlin-associated protein  31.72 
 
 
517 aa  54.3  0.000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1725  curlin-associated protein  32.33 
 
 
183 aa  53.9  0.000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0532195  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1254  curlin minor subunit  37.63 
 
 
151 aa  53.1  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.575884 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2955  curlin-associated protein  32.95 
 
 
481 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0863246  normal  0.318983 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1997  curlin associated  33.33 
 
 
154 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.465016  normal  0.0225177 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0376  curlin-associated protein  33.19 
 
 
564 aa  49.7  0.00004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4726  Curlin associated repeat protein  27.62 
 
 
415 aa  49.7  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0924  curlin associated  36.89 
 
 
144 aa  48.5  0.00009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.370381  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3235  curlin-associated protein  31.96 
 
 
627 aa  47.4  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1996  curlin associated  30.09 
 
 
483 aa  47  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.425748  normal  0.0257346 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2364  curlin-associated protein  30.72 
 
 
498 aa  45.4  0.0009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0877  curlin-associated protein  34.94 
 
 
139 aa  45.1  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0842  curlin-associated protein  34.94 
 
 
139 aa  45.1  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2864  curlin associated precursor, CsgA like  33.93 
 
 
314 aa  44.3  0.002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.792578  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1816  curlin-associated protein  31.25 
 
 
183 aa  44.3  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6064  Curlin associated repeat protein  27.62 
 
 
453 aa  43.9  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2550  curlin-associated protein  30.72 
 
 
481 aa  42.7  0.005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.895792  normal  0.0129391 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3413  curlin-associated protein  28.64 
 
 
502 aa  42.7  0.006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.602514  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1877  Curlin associated repeat protein  22.55 
 
 
441 aa  42.4  0.007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.246502  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2947  hypothetical protein  32.46 
 
 
500 aa  42  0.009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.424974  normal  0.148892 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>