37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_0407 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013743  Htur_0407  hypothetical protein  100 
 
 
118 aa  237  5e-62  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2610  hypothetical protein  51.79 
 
 
115 aa  110  5e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  hitchhiker  0.00563905  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1516  transcriptional regulator, ArsR family  49.54 
 
 
115 aa  108  2.0000000000000002e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.599896 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3421  hypothetical protein  44.83 
 
 
119 aa  103  6e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1221  hypothetical protein  45.61 
 
 
117 aa  101  4e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3365  hypothetical protein  46.36 
 
 
115 aa  95.5  2e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.753512  normal 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5142  hypothetical protein  44.55 
 
 
116 aa  93.6  8e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3278  transcriptional regulator, ArsR family  46.36 
 
 
114 aa  91.3  4e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1872  transcription regulator  37.96 
 
 
116 aa  82  0.000000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0352712 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0723  transcriptional regulator, ArsR family  39.25 
 
 
116 aa  78.2  0.00000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.532728  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1053  hypothetical protein  34.23 
 
 
119 aa  77.4  0.00000000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.256423  normal  0.612882 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3712  hypothetical protein  33.05 
 
 
131 aa  77.4  0.00000000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.598339  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4287  putative transcriptional regulator, AsnC family  35.34 
 
 
132 aa  75.9  0.0000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.132275  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0641  transcription regulator  36.61 
 
 
114 aa  73.6  0.0000000000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0559  transcription regulator  36.11 
 
 
116 aa  72.8  0.000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.4185 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3007  hypothetical protein  39.22 
 
 
110 aa  71.2  0.000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0952791  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5175  hypothetical protein  37.11 
 
 
110 aa  68.6  0.00000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.937206  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1920  putative transcriptional regulator  33.64 
 
 
116 aa  67.8  0.00000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1445  transcriptional regulator, ArsR family  32.41 
 
 
116 aa  65.5  0.0000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.481445  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0786  transcriptional regulator, ArsR family  31.18 
 
 
107 aa  62.4  0.000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.965961 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0690  hypothetical protein  34 
 
 
128 aa  55.8  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1750  transcriptional regulator, ArsR family  29.03 
 
 
159 aa  56.2  0.0000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1741  hypothetical protein  31.46 
 
 
139 aa  52  0.000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3906  transcription regulator  32.35 
 
 
122 aa  50.1  0.00001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.637377  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5206  hypothetical protein  28.3 
 
 
121 aa  50.1  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0736  hypothetical protein  34.88 
 
 
125 aa  48.9  0.00003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3591  hypothetical protein  27.93 
 
 
125 aa  48.9  0.00003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0319  transcription regulator  35 
 
 
129 aa  47.8  0.00005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.185486  normal  0.0870731 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0442  regulatory protein ArsR  22.92 
 
 
112 aa  47.4  0.00006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1979  hypothetical protein  29.46 
 
 
125 aa  46.6  0.0001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.219481  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1662  hypothetical protein  25.23 
 
 
125 aa  45.4  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.293702  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1236  hypothetical protein  25.47 
 
 
151 aa  44.7  0.0004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2686  hypothetical protein  27.19 
 
 
119 aa  44.7  0.0004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.463238  normal  0.104568 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1969  hypothetical protein  32.53 
 
 
131 aa  43.1  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.88465  normal  0.0475375 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0320  transcriptional regulator, TrmB  36 
 
 
127 aa  42  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0147  hypothetical protein  27.27 
 
 
119 aa  40.8  0.007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0877  putative transcriptional regulator  27.38 
 
 
110 aa  40  0.01  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.199532 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>