More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_6119 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_6119  uridylate kinase  100 
 
 
251 aa  508  1e-143  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.837699  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1665  uridylate kinase  56.72 
 
 
247 aa  295  4e-79  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1845  uridylate kinase  56.72 
 
 
247 aa  295  4e-79  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0560073 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1797  uridylate kinase  56.72 
 
 
247 aa  295  4e-79  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1870  uridylate kinase  56.72 
 
 
247 aa  295  5e-79  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1612  uridylate kinase  56.72 
 
 
247 aa  295  5e-79  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1919  uridylate kinase  56.3 
 
 
247 aa  294  8e-79  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1647  uridylate kinase  57.51 
 
 
247 aa  294  1e-78  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.874259  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1808  uridylate kinase  56.3 
 
 
247 aa  294  1e-78  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3532  uridylate kinase  56.3 
 
 
247 aa  293  2e-78  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4268  uridylate kinase  55.33 
 
 
259 aa  288  6e-77  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0793924  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1663  uridylate kinase  55.79 
 
 
247 aa  288  8e-77  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1414  uridylate kinase  46.19 
 
 
249 aa  222  3e-57  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.305711 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0707  uridylate kinase  45.38 
 
 
274 aa  217  1e-55  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00000695592  unclonable  0.0000000228976 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01129  uridylate kinase  46.64 
 
 
240 aa  217  1e-55  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.162741  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0803  uridylate kinase  43.28 
 
 
241 aa  217  1e-55  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000000782599  hitchhiker  0.00000000000212773 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1197  uridylate kinase  44.96 
 
 
241 aa  216  2.9999999999999998e-55  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.000608645  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2011  uridylate kinase  45.99 
 
 
239 aa  216  4e-55  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0332  uridylate kinase  44.54 
 
 
243 aa  214  7e-55  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1263  uridylate kinase  44.96 
 
 
242 aa  214  8e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.456307 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0368  uridylate kinase  44.54 
 
 
243 aa  214  9e-55  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1588  uridylate kinase  46.43 
 
 
250 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.10521  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3707  uridylate kinase  44.77 
 
 
240 aa  213  1.9999999999999998e-54  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0190689  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10930  uridylate kinase  44.12 
 
 
240 aa  212  4.9999999999999996e-54  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0253389  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1274  uridylate kinase  45.73 
 
 
239 aa  211  7.999999999999999e-54  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.315976  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1464  uridylate kinase  44.07 
 
 
246 aa  210  1e-53  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.360774  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1162  uridylate kinase  45.38 
 
 
241 aa  210  2e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.899352 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1808  uridylate kinase  43.98 
 
 
241 aa  210  2e-53  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1446  uridylate kinase  45.38 
 
 
241 aa  210  2e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0296877  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0646  uridylate kinase  47.86 
 
 
238 aa  209  2e-53  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000000289065  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3993  uridylate kinase  43.64 
 
 
244 aa  209  3e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.927712  normal  0.379983 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23620  uridylate kinase  47.44 
 
 
238 aa  209  5e-53  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.240792 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1493  uridylate kinase  43.28 
 
 
243 aa  208  5e-53  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.452684  normal  0.743387 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0575  uridylate kinase  44.21 
 
 
236 aa  208  6e-53  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000374821  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2029  uridylate kinase  43.64 
 
 
237 aa  208  7e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2153  uridylate kinase  43.64 
 
 
246 aa  208  8e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0215  uridylate kinase  41.77 
 
 
238 aa  207  9e-53  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2505  uridylate kinase  49.57 
 
 
265 aa  207  1e-52  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.234958 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2435  uridylate kinase  43.83 
 
 
237 aa  207  1e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0771842  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1513  uridylate kinase  43.1 
 
 
242 aa  207  1e-52  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00553503  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3257  uridylate kinase  43.83 
 
 
237 aa  207  1e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1362  uridylate kinase  43.22 
 
 
246 aa  207  1e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00482599 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1553  uridylate kinase  43.83 
 
 
237 aa  207  1e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2581  uridylate kinase  43.83 
 
 
237 aa  207  1e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2705  uridylate kinase  43.22 
 
 
246 aa  207  1e-52  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.836917  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2491  uridylate kinase  43.83 
 
 
237 aa  207  1e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2054  uridylate kinase  43.83 
 
 
286 aa  207  1e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1528  uridylate kinase  43.75 
 
 
238 aa  207  1e-52  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000286053  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1326  uridylate kinase  43.83 
 
 
237 aa  207  1e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.280205  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07670  uridylate kinase  46.58 
 
 
239 aa  206  2e-52  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000164144  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23590  uridylate kinase  48.12 
 
 
249 aa  206  2e-52  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.192648 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0659  uridylate kinase  43.28 
 
 
238 aa  206  3e-52  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2460  uridylate kinase  44.05 
 
 
249 aa  206  3e-52  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.930006  hitchhiker  0.000425697 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1259  uridylate kinase  43.22 
 
 
237 aa  206  4e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.370411  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0405  uridylate kinase  42.31 
 
 
235 aa  206  4e-52  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.899064  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6060  uridylate kinase  43.22 
 
 
237 aa  206  4e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2017  uridylate kinase  43.22 
 
 
237 aa  206  4e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2037  uridylate kinase  43.22 
 
 
237 aa  206  4e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.865842  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5327  uridylate kinase  43.22 
 
 
237 aa  205  5e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0388616  normal  0.289961 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0580  uridylate kinase  44.49 
 
 
255 aa  205  7e-52  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1006  uridylate kinase  48.71 
 
 
252 aa  205  7e-52  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0628  uridylate kinase  44.77 
 
 
242 aa  205  7e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.440032 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2292  uridylate kinase  42.02 
 
 
238 aa  205  7e-52  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.41797  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1780  uridylate kinase  43.35 
 
 
245 aa  205  7e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0686  uridylate kinase  42.02 
 
 
240 aa  204  8e-52  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000013678  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1486  uridylate kinase  46.55 
 
 
251 aa  204  1e-51  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.891753  normal  0.659941 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0426  uridylate kinase  42.74 
 
 
239 aa  204  1e-51  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.777884  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0078  uridylate kinase  41.03 
 
 
236 aa  204  1e-51  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000395488  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1280  uridylate kinase  43.35 
 
 
236 aa  203  2e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.23079 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1919  uridylate kinase  42.8 
 
 
237 aa  203  2e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.302064 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1344  uridylate kinase  43.35 
 
 
236 aa  203  2e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0291388  normal  0.514352 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1782  uridylate kinase  43.59 
 
 
234 aa  203  2e-51  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000038351  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1487  uridylate kinase  44.4 
 
 
240 aa  203  2e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0028883 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0574  uridylate kinase  42.31 
 
 
235 aa  203  2e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1143  uridylate kinase  43.7 
 
 
240 aa  203  2e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000986718  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2050  uridylate kinase  42.8 
 
 
237 aa  203  2e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0977  uridylate kinase  43.75 
 
 
243 aa  203  2e-51  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00111069  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1369  uridylate kinase  46.81 
 
 
245 aa  203  2e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.237197  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1744  uridylate kinase  42.44 
 
 
238 aa  203  3e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1879  uridylate kinase  43.35 
 
 
236 aa  202  3e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.422558  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0066  uridylate kinase  43.93 
 
 
242 aa  202  3e-51  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.815822  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1437  uridylate kinase  43.35 
 
 
258 aa  202  3e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.439884  hitchhiker  0.000435544 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2754  uridylate kinase  43.98 
 
 
240 aa  202  3e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0474  uridylate kinase  42.44 
 
 
245 aa  203  3e-51  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.166023  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2008  uridylate kinase  42.31 
 
 
236 aa  202  3e-51  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3241  uridylate kinase  44.92 
 
 
237 aa  203  3e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2378  uridylate kinase  43.7 
 
 
239 aa  202  3e-51  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3731  uridylate kinase  44.44 
 
 
239 aa  202  4e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000303912  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0610  uridylate kinase  41.1 
 
 
243 aa  202  4e-51  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.139301  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1417  uridylate kinase  46.78 
 
 
253 aa  202  4e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.436862 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0302  uridylate kinase  43.4 
 
 
251 aa  202  4e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0291  uridylate kinase  43.4 
 
 
251 aa  202  4e-51  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0280  uridylate kinase  43.4 
 
 
251 aa  202  4e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1543  uridylate kinase  41.1 
 
 
243 aa  202  4e-51  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1452  uridylate kinase  44.92 
 
 
246 aa  202  4e-51  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.314507  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1406  uridylate kinase  42.92 
 
 
236 aa  202  5e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3211  uridylate kinase  43.51 
 
 
242 aa  202  5e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000567635  hitchhiker  0.000000005396 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1336  uridylate kinase  42.92 
 
 
237 aa  202  5e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.399857  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1421  uridylate kinase  42.74 
 
 
244 aa  202  5e-51  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0926362  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2546  uridylate kinase  44.44 
 
 
242 aa  202  6e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>