20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_5788 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_5788  transglutaminase domain protein  100 
 
 		 2543 aa  4847    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2613  hypothetical protein  31.39 
 
 		 412 aa  101  2e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.382346 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1474  hypothetical protein  25.65 
 
 		 1625 aa  97.1  4e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.109086  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1537  putative transcriptional regulator  25.07 
 
 		 1672 aa  92  1e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000000286892 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0634  superfamily I DNA/RNA helicase  24.87 
 
 		 1584 aa  87.8  0.000000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3209  putative transcriptional regulator  25.07 
 
 		 1687 aa  77.8  0.000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000587168 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0197  hypothetical protein  28.96 
 
 		 1414 aa  73.2  0.00000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.356041  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2990  putative ATPase  27.29 
 
 		 1406 aa  70.5  0.0000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.12243 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4727  hypothetical protein  37.66 
 
 		 1012 aa  55.1  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07280  conserved hypothetical protein  29.38 
 
 		 1882 aa  53.5  0.00005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.955647  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA02610  conserved expressed protein  29.31 
 
 		 1731 aa  52.8  0.00009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0731  hypothetical protein  25.68 
 
 		 583 aa  51.6  0.0002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0820  hypothetical protein  30.36 
 
 		 1034 aa  51.2  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7241  hypothetical protein  30.83 
 
 		 1067 aa  50.8  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.446372  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5338  hypothetical protein  32 
 
 		 1934 aa  50.1  0.0006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.625438  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2928  hypothetical protein  32.8 
 
 		 1284 aa  49.3  0.001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3292  hypothetical protein  30.26 
 
 		 985 aa  47.4  0.004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.162566 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0748  hypothetical protein  33.08 
 
 		 1026 aa  47  0.005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0431766  normal  0.0425394 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8899  hypothetical protein  35.29 
 
 		 1043 aa  46.6  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00313  heat shock protein 90  26.26 
 
 		 634 aa  46.2  0.008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>