37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_4292 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_4292  hypothetical protein  100 
 
 
473 aa  946    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.591797  normal  0.223034 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5169  hypothetical protein  45.62 
 
 
704 aa  139  1e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.882011  normal  0.19488 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2590  cytochrome c peroxidase family protein, putative  41.18 
 
 
773 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.959599  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1673  hypothetical protein  46.51 
 
 
681 aa  116  1.0000000000000001e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.617878 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5043  Di-heme cytochrome c peroxidase  38.04 
 
 
440 aa  59.3  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.772632  normal  0.822477 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2642  di-haem cytochrome c peroxidase  28.91 
 
 
409 aa  57.4  0.0000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4466  di-haem cytochrome c peroxidase  40.24 
 
 
427 aa  55.8  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4868  di-haem cytochrome c peroxidase  41.54 
 
 
424 aa  55.1  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1600  Cytochrome-c peroxidase  42.42 
 
 
357 aa  52.4  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.282012 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5805  Cytochrome-c peroxidase  38.71 
 
 
571 aa  52  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.181797 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0026  Cytochrome-c peroxidase  26.32 
 
 
521 aa  50.8  0.00005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1545  Cytochrome-c peroxidase  25.36 
 
 
384 aa  50.4  0.00006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.16368  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0019  Cytochrome-c peroxidase  42.65 
 
 
345 aa  50.4  0.00006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0345  cytochrome c peroxidase family protein  41.94 
 
 
343 aa  50.1  0.00008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3091  di-haem cytochrome c peroxidase  39.39 
 
 
346 aa  50.1  0.00008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0020  Di-haem cytochrome c peroxidase  39.71 
 
 
345 aa  50.1  0.00008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4658  Cytochrome-c peroxidase  26.54 
 
 
768 aa  50.1  0.00009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.264501  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2766  cytochrome-c peroxidase  37.31 
 
 
431 aa  48.5  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.783041  normal  0.878036 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2813  cytochrome c551 peroxidase  36.36 
 
 
345 aa  47.4  0.0005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.259536  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2680  Cytochrome-c peroxidase  38.33 
 
 
594 aa  47.4  0.0006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.714697 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60700  cytochrome c551 peroxidase precursor  38.24 
 
 
346 aa  47  0.0007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1091  Cytochrome-c peroxidase  32.08 
 
 
459 aa  46.2  0.001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00000159552  hitchhiker  0.0000000000000391154 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1263  cytochrome c peroxidase  35.29 
 
 
358 aa  45.8  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4161  Cytochrome-c peroxidase  41.46 
 
 
598 aa  45.1  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0171649  normal  0.0843454 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0047  cytochrome c551 peroxidase  37.88 
 
 
304 aa  45.1  0.003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1316  cytochrome-c peroxidase  36.36 
 
 
346 aa  45.1  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000633381  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0285  Cytochrome-c peroxidase  39.71 
 
 
473 aa  45.1  0.003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.906916  normal  0.908563 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0203  cytochrome-c peroxidase  32.84 
 
 
346 aa  44.7  0.004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.908377  normal  0.102484 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5227  cytochrome c551 peroxidase precursor  36.76 
 
 
346 aa  44.7  0.004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2381  Cytochrome-c peroxidase  36.23 
 
 
616 aa  44.3  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.298438  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0564  Cytochrome-c peroxidase  35.29 
 
 
607 aa  44.3  0.005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.390743  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7510  putative di-haem cytochrome c peroxidase  30.77 
 
 
358 aa  43.9  0.006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.733811  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0372  cytochrome-c peroxidase  36.36 
 
 
349 aa  43.9  0.006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.393962  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0020  cytochrome c551 peroxidase  36.36 
 
 
304 aa  43.5  0.007  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4328  Cytochrome-c peroxidase  40.32 
 
 
398 aa  43.5  0.008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.314374  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1789  cytochrome-c peroxidase  27.5 
 
 
348 aa  43.1  0.009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0088  cytochrome c551 peroxidase  23.19 
 
 
306 aa  43.1  0.01  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>