More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_3998 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_3998  ribosomal protein L16  100 
 
 		 138 aa  275  2e-73  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.377378  normal  0.869429 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1860  50S ribosomal protein L16  65.19 
 
 		 141 aa  187  5e-47  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0761083  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01240  50S ribosomal protein L16  61.48 
 
 		 144 aa  181  3e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.844455  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0849  ribosomal protein L16  62.69 
 
 		 144 aa  179  9.000000000000001e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1843  ribosomal protein L16  62.77 
 
 		 137 aa  177  4e-44  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000707867  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2612  50S ribosomal protein L16  62.22 
 
 		 141 aa  176  7e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000705593  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3321  50S ribosomal protein L16  59.12 
 
 		 140 aa  176  9e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000147904 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0940  50S ribosomal protein L16  59.12 
 
 		 140 aa  176  9e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00197835  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0633  50S ribosomal protein L16  61.48 
 
 		 140 aa  176  9e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000966771  hitchhiker  0.00000000446584 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0201  50S ribosomal protein L16  58.52 
 
 		 144 aa  174  3e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.126239  normal  0.143837 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2704  ribosomal protein L16  60.58 
 
 		 145 aa  174  4e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.589348  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0874  50S ribosomal protein L16  58.39 
 
 		 144 aa  173  5e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000946353  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0715  50S ribosomal protein L16  60 
 
 		 137 aa  174  5e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.77301  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1562  50S ribosomal protein L16  60.14 
 
 		 138 aa  173  6e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2900  ribosomal protein L16  61.48 
 
 		 141 aa  173  9e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2850  50S ribosomal protein L16  60 
 
 		 140 aa  172  1.9999999999999998e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.867321  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0960  50S ribosomal protein L16  57.66 
 
 		 142 aa  172  1.9999999999999998e-42  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000390826  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0405  ribosomal protein L16  59.12 
 
 		 145 aa  171  1.9999999999999998e-42  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0066  50S ribosomal protein L16  59.26 
 
 		 141 aa  171  2.9999999999999996e-42  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0038879  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1918  50S ribosomal protein L16  63.43 
 
 		 138 aa  171  2.9999999999999996e-42  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.573905 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2910  50S ribosomal protein L16  59.26 
 
 		 145 aa  171  3.9999999999999995e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1074  50S ribosomal protein L16  57.78 
 
 		 140 aa  170  5e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000319005  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1738  50S ribosomal protein L16  58.52 
 
 		 147 aa  170  5e-42  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000521329  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2326  50S ribosomal protein L16  58.52 
 
 		 144 aa  170  5.999999999999999e-42  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000195214  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3710  50S ribosomal protein L16  57.78 
 
 		 139 aa  170  6.999999999999999e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3136  50S ribosomal protein L16  58.52 
 
 		 139 aa  170  6.999999999999999e-42  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1868  50S ribosomal protein L16  58.52 
 
 		 141 aa  170  7.999999999999999e-42  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1353  50S ribosomal protein L16  59.7 
 
 		 140 aa  169  7.999999999999999e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.298146  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2074  50S ribosomal protein L16  58.52 
 
 		 141 aa  170  7.999999999999999e-42  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0136024  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1387  50S ribosomal protein L16  57.66 
 
 		 142 aa  169  7.999999999999999e-42  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000734854  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1697  50S ribosomal protein L16  58.52 
 
 		 141 aa  170  7.999999999999999e-42  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.000686182  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1299  50S ribosomal protein L16  57.66 
 
 		 142 aa  169  7.999999999999999e-42  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000108479  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1517  ribosomal protein L16  57.78 
 
 		 151 aa  169  1e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.592014  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1299  50S ribosomal protein L16  57.04 
 
 		 140 aa  169  1e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.210849  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3428  ribosomal protein L16  58.52 
 
 		 138 aa  169  1e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.773709  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0687  50S ribosomal protein L16  59.7 
 
 		 140 aa  169  1e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.129729  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0330  ribosomal protein L16  58.21 
 
 		 137 aa  169  2e-41  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000439211  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2453  50S ribosomal protein L16  58.96 
 
 		 144 aa  167  3e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.219362 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0765  50S ribosomal protein L16  59.26 
 
 		 145 aa  167  4e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000000894235  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1233  50S ribosomal protein L16  57.04 
 
 		 139 aa  167  5e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000804114 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1961  ribosomal protein L16  57.78 
 
 		 141 aa  167  6e-41  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.564853  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17090  50S ribosomal protein L16  58.52 
 
 		 138 aa  167  6e-41  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00239118  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0283  50S ribosomal protein L16  60.74 
 
 		 138 aa  166  7e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000000045602  normal  0.0248702 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0698  50S ribosomal protein L16  55.8 
 
 		 142 aa  166  7e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000251243  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0274  50S ribosomal protein L16  60.74 
 
 		 138 aa  166  7e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000119561  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3751  ribosomal protein L16  58.52 
 
 		 138 aa  166  9e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.596484  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2311  50S ribosomal protein L16  56.2 
 
 		 144 aa  166  9e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000000620596  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3005  50S ribosomal protein L16  57.78 
 
 		 137 aa  166  9e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.840277  hitchhiker  0.00634453 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2270  50S ribosomal protein L16  56.2 
 
 		 144 aa  166  9e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000763654  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0334  50S ribosomal protein L16  58.96 
 
 		 138 aa  166  1e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0307948  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1844  50S ribosomal protein L16  58.96 
 
 		 139 aa  166  1e-40  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.242343  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0504  50S ribosomal protein L16  58.96 
 
 		 138 aa  166  1e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.110652  hitchhiker  0.000000000243822 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0222  50S ribosomal protein L16  61.48 
 
 		 144 aa  166  1e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000752115  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2148  50S ribosomal protein L16  59.7 
 
 		 138 aa  166  1e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0586575  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04050  LSU ribosomal protein L16P  59.26 
 
 		 139 aa  166  1e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0866  50S ribosomal protein L16  59.7 
 
 		 137 aa  165  2e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2566  50S ribosomal protein L16  55.97 
 
 		 141 aa  165  2e-40  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0634  ribosomal protein L16  57.04 
 
 		 139 aa  165  2e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.953159  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0594  ribosomal protein L16  56.3 
 
 		 139 aa  165  2e-40  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.158135  normal  0.764393 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2681  50S ribosomal protein L16  59.7 
 
 		 138 aa  165  2e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.428051  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1939  50S ribosomal protein L16  61.94 
 
 		 138 aa  165  2e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0114  50S ribosomal protein L16  57.78 
 
 		 141 aa  165  2e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2652  ribosomal protein L16  57.78 
 
 		 138 aa  165  2e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3017  50S ribosomal protein L16  57.78 
 
 		 151 aa  165  2e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00890597  hitchhiker  0.0081871 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1278  ribosomal protein L16  58.52 
 
 		 140 aa  165  2e-40  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0118  50S ribosomal protein L16  56.2 
 
 		 144 aa  165  2e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0312557  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0041  50S ribosomal protein L16  58.52 
 
 		 141 aa  165  2e-40  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.123597  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0210  50S ribosomal protein L16  59.7 
 
 		 138 aa  165  2e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.334527 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0296  50S ribosomal protein L16  58.21 
 
 		 139 aa  164  2.9999999999999998e-40  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0334  50S ribosomal protein L16  60 
 
 		 138 aa  164  2.9999999999999998e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000896805  normal  0.0198335 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3454  50S ribosomal protein L16  60 
 
 		 138 aa  164  2.9999999999999998e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000000581922  decreased coverage  0.00396929 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2811  50S ribosomal protein L16  58.96 
 
 		 143 aa  164  2.9999999999999998e-40  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.647814  normal  0.456586 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2752  50S ribosomal protein L16  60 
 
 		 138 aa  164  2.9999999999999998e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00000962733  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0355  50S ribosomal protein L16  60 
 
 		 138 aa  164  2.9999999999999998e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000176857  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2222  50S ribosomal protein L16  57.46 
 
 		 139 aa  164  2.9999999999999998e-40  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000000157972  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0726  50S ribosomal protein L16  59.7 
 
 		 137 aa  164  2.9999999999999998e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00162053  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2025  50S ribosomal protein L16  60.45 
 
 		 138 aa  164  4e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.755365  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4314  ribosomal protein L16  56.93 
 
 		 139 aa  164  4e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.827484  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23740  LSU ribosomal protein L16P  54.07 
 
 		 139 aa  164  4e-40  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0335503  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1940  50S ribosomal protein L16  60.45 
 
 		 138 aa  164  4e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2365  50S ribosomal protein L16  60.45 
 
 		 137 aa  164  5e-40  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.309525  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0293  50S ribosomal protein L16  58.52 
 
 		 141 aa  164  5e-40  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0021896  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1131  50S ribosomal protein L16  56.2 
 
 		 142 aa  164  5e-40  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000508747  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2225  50S ribosomal protein L16  58.09 
 
 		 142 aa  163  5.9999999999999996e-40  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.877159  normal  0.84916 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0263  50S ribosomal protein L16  59.7 
 
 		 138 aa  163  5.9999999999999996e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.290955  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1671  50S ribosomal protein L16  58.21 
 
 		 137 aa  163  5.9999999999999996e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0460624  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3637  50S ribosomal protein L16  60 
 
 		 138 aa  163  6.9999999999999995e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000627073  hitchhiker  0.0000000000181124 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0429  50S ribosomal protein L16  57.04 
 
 		 145 aa  163  6.9999999999999995e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0009964  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0433  50S ribosomal protein L16  60.45 
 
 		 137 aa  163  6.9999999999999995e-40  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000574852  hitchhiker  0.0000247561 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0321  50S ribosomal protein L16  60 
 
 		 138 aa  163  6.9999999999999995e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000904365  decreased coverage  0.00244098 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2680  50S ribosomal protein L16  56.3 
 
 		 138 aa  163  6.9999999999999995e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1931  50S ribosomal protein L16  59.26 
 
 		 138 aa  163  8e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000000246201  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3436  50S ribosomal protein L16  58.52 
 
 		 138 aa  163  8e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.109776  normal  0.197856 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3797  50S ribosomal protein L16  59.26 
 
 		 138 aa  163  8e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3769  50S ribosomal protein L16  59.26 
 
 		 138 aa  163  8e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000165417  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3485  50S ribosomal protein L16  59.26 
 
 		 138 aa  163  8e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00369776  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3061  50S ribosomal protein L16  59.26 
 
 		 138 aa  163  8e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000117854  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29670  LSU ribosomal protein L16P  55.56 
 
 		 139 aa  163  8e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.810934  normal  0.371793 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3739  50S ribosomal protein L16  59.26 
 
 		 138 aa  163  8e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000550662  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0190  50S ribosomal protein L16  60.61 
 
 		 140 aa  163  8e-40  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.307321 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>