37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_2294 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_2294  hypothetical protein  100 
 
 
744 aa  1513    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2292  hypothetical protein  88.31 
 
 
744 aa  1248    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.32606  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4774  hypothetical protein  58.72 
 
 
634 aa  201  5e-50  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.1009  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2036  hypothetical protein  27.59 
 
 
804 aa  178  4e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.362684 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4377  hypothetical protein  69.63 
 
 
799 aa  156  1e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.332328  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4266  17 kDa surface antigen  59.48 
 
 
448 aa  147  5e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.123059 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5399  hypothetical protein  60.42 
 
 
453 aa  144  5e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.0000193647  normal  0.787894 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1807  hypothetical protein  57.55 
 
 
362 aa  140  7e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.131489 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1990  hypothetical protein  65.6 
 
 
306 aa  136  9.999999999999999e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.7133  normal  0.438059 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4534  hypothetical protein  67.23 
 
 
323 aa  120  9.999999999999999e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.737343  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0710  hypothetical protein  54.68 
 
 
368 aa  103  2e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.287871  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2166  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  38.66 
 
 
954 aa  87  0.000000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.16902  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2638  hypothetical protein  37.64 
 
 
642 aa  64.3  0.000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.950991  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0933  hypothetical protein  36.91 
 
 
239 aa  58.2  0.0000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.280943 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0541  hypothetical protein  24.07 
 
 
423 aa  56.6  0.000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1896  hypothetical protein  35.76 
 
 
258 aa  55.1  0.000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00163345  normal  0.0496265 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0565  hypothetical protein  23.7 
 
 
423 aa  55.1  0.000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2937  Annexin repeat protein  35.32 
 
 
922 aa  54.7  0.000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.193914  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2831  hypothetical protein  32 
 
 
1219 aa  52.8  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.112741  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1858  hypothetical protein  35.54 
 
 
569 aa  49.3  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3059  hypothetical protein  32.86 
 
 
1081 aa  49.7  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.893943 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4398  hypothetical protein  41.57 
 
 
723 aa  50.1  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.290136  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0825  hypothetical protein  36.54 
 
 
909 aa  48.5  0.0004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.944822  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1771  hypothetical protein  51.79 
 
 
197 aa  48.5  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3601  hypothetical protein  34.23 
 
 
1058 aa  48.1  0.0006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000186379 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0663  hypothetical protein  31.82 
 
 
1126 aa  47.8  0.0008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00858372  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6000  hypothetical protein  38.66 
 
 
409 aa  46.2  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.706534 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0689  hypothetical protein  35.54 
 
 
1137 aa  46.6  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0826  hypothetical protein  33.52 
 
 
896 aa  46.6  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.337826  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2649  hypothetical protein  36.36 
 
 
620 aa  46.6  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0121345  hitchhiker  0.00491611 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1887  hypothetical protein  40.51 
 
 
184 aa  45.4  0.004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00443478  normal  0.0909013 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5241  hypothetical protein  35.45 
 
 
1319 aa  45.4  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000238802  unclonable  0.00000000000023069 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1026  hypothetical protein  32.17 
 
 
582 aa  45.1  0.005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0733  hypothetical protein  27.27 
 
 
1523 aa  44.7  0.006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.26335  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3813  hypothetical protein  37.5 
 
 
224 aa  44.7  0.007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.36363  normal  0.356444 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3166  hypothetical protein  32.56 
 
 
1333 aa  44.7  0.007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  unclonable  0.0000161537  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5238  hypothetical protein  41.43 
 
 
503 aa  44.3  0.009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0161001  hitchhiker  0.000000000167014 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>