27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_0221 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_0221  polysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 		 421 aa  802    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4418  polysaccharide biosynthesis protein  43.81 
 
 		 438 aa  262  1e-68  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0498  polysaccharide biosynthesis protein  41.15 
 
 		 449 aa  253  5.000000000000001e-66  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3265  polysaccharide biosynthesis protein  34.2 
 
 		 411 aa  242  7e-63  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5393  polysaccharide biosynthesis protein  31.04 
 
 		 417 aa  228  2e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.376644  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3640  polysaccharide biosynthesis protein  41.75 
 
 		 440 aa  223  4.9999999999999996e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.866884  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0837  polysaccharide biosynthesis protein  37.14 
 
 		 460 aa  214  1.9999999999999998e-54  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.920136 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18700  membrane protein involved in the export of O-antigen and teichoic acid  34.85 
 
 		 426 aa  163  6e-39  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4010  hypothetical protein  26.14 
 
 		 420 aa  145  1e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0999  polysaccharide biosynthesis protein  24.94 
 
 		 416 aa  94  4e-18  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1443  polysaccharides export protein  21.39 
 
 		 419 aa  88.2  3e-16  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.466456  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2144  O-antigen and teichoic acid-like export protein  30.08 
 
 		 387 aa  85.5  0.000000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0804  polysaccharide biosynthesis protein  20.92 
 
 		 405 aa  78.2  0.0000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0415  polysaccharide biosynthesis protein  21.93 
 
 		 531 aa  72.8  0.00000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000406947 
 
 
-
 
NC_007489  RSP_7378  capsular polysaccharide biosynthesis protein, putative  24.84 
 
 		 399 aa  71.2  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.117503  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2032  polysaccharide biosynthesis protein  24.61 
 
 		 408 aa  65.9  0.000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0688157  hitchhiker  0.000748168 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0665  polysaccharide biosynthesis protein  22.06 
 
 		 426 aa  61.2  0.00000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0975  polysaccharide biosynthesis protein  23.15 
 
 		 434 aa  60.1  0.00000007  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.341019  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02470  membrane protein involved in the export of O-antigen and teichoic acid  21.59 
 
 		 591 aa  57.4  0.0000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.919412  normal  0.0509107 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1311  polysaccharide biosynthesis protein  17.63 
 
 		 477 aa  52.8  0.00001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0457  polysaccharide biosynthesis protein  24.11 
 
 		 488 aa  52.4  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3073  polysaccharide biosynthesis protein  27.75 
 
 		 491 aa  51.2  0.00003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1495  polysaccharide biosynthesis protein  25.75 
 
 		 503 aa  50.1  0.00008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.994963  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4228  polysaccharide biosynthesis protein  25.9 
 
 		 486 aa  47  0.0007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0386207 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1424  polysaccharide biosynthesis protein  24.43 
 
 		 444 aa  46.2  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1236  polysaccharide biosynthesis protein  31.18 
 
 		 482 aa  45.4  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.286439 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1071  polysaccharide biosynthesis protein  22.4 
 
 		 489 aa  44.3  0.004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>