19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_2280 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013422  Hneap_2280  Sporulation domain protein  100 
 
 
499 aa  997    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0389  sporulation domain-containing protein  32.71 
 
 
526 aa  67  0.0000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5774  hypothetical protein  36.36 
 
 
548 aa  64.7  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.785975  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66580  hypothetical protein  36.36 
 
 
551 aa  63.9  0.000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.922086  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45230  hypothetical protein  37.36 
 
 
550 aa  63.5  0.000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5077  sporulation domain protein  29.59 
 
 
529 aa  62.4  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.560536  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4950  sporulation domain-containing protein  29.59 
 
 
533 aa  62.8  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.663917  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0549  sporulation domain-containing protein  35.11 
 
 
533 aa  60.1  0.00000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.528502  normal  0.783944 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0410  hypothetical protein  32.29 
 
 
540 aa  58.9  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5125  hypothetical protein  32.98 
 
 
541 aa  58.5  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.890867  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2724  putative cell division protein  25.66 
 
 
505 aa  55.8  0.000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0340  hypothetical protein  25.29 
 
 
349 aa  51.6  0.00003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5127  sporulation domain-containing protein  29.21 
 
 
534 aa  50.8  0.00005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.840723  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4115  sporulation domain-containing protein  27.96 
 
 
521 aa  47.4  0.0006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000146904 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0640  putative lipoprotein, may be involved in cell division  27.88 
 
 
185 aa  47  0.0009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0255277  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00026  hypothetical protein  28.04 
 
 
497 aa  46.2  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1527  hypothetical protein  22.48 
 
 
323 aa  44.7  0.004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.123632  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4603  hypothetical protein  26.19 
 
 
340 aa  43.5  0.009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000306505  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1095  collagen adhesion protein  32.79 
 
 
2272 aa  43.1  0.01  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>