75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_1898 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013422  Hneap_1898  import inner membrane translocase subunit Tim44  100 
 
 		 295 aa  597  1e-170  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.859506  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0214  import inner membrane translocase, subunit Tim44  39.74 
 
 		 306 aa  182  5.0000000000000004e-45  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.525387  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5517  hypothetical protein  37.63 
 
 		 280 aa  166  5e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3047  import inner membrane translocase, subunit Tim44  41.84 
 
 		 272 aa  166  5.9999999999999996e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5646  import inner membrane translocase, subunit Tim44  38.63 
 
 		 292 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0169336 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0990  import inner membrane translocase, subunit Tim44  41.2 
 
 		 295 aa  159  5e-38  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72930  hypothetical protein  38.41 
 
 		 285 aa  155  6e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5066  import inner membrane translocase, subunit Tim44  36.43 
 
 		 281 aa  154  1e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6329  hypothetical protein  37.72 
 
 		 281 aa  151  1e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0375  import inner membrane translocase subunit Tim44  34.26 
 
 		 331 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.473985 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00430  Tim44-like domain protein  36.15 
 
 		 284 aa  144  2e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.924994  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5353  hypothetical protein  41.2 
 
 		 284 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.116139  normal  0.479711 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4117  import inner membrane translocase subunit Tim44  37.21 
 
 		 287 aa  141  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4517  import inner membrane translocase, subunit Tim44  40.14 
 
 		 284 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3925  import inner membrane translocase subunit Tim44  37.21 
 
 		 287 aa  140  3e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4024  import inner membrane translocase subunit Tim44  36.54 
 
 		 287 aa  138  1e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.149443  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0650  import inner membrane translocase subunit Tim44  33.23 
 
 		 330 aa  137  2e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.983868 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4001  import inner membrane translocase subunit Tim44  36.88 
 
 		 287 aa  137  2e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2782  import inner membrane translocase, subunit Tim44  33.54 
 
 		 344 aa  137  2e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2649  import inner membrane translocase subunit Tim44  33.54 
 
 		 344 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.331938  normal  0.299083 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0554  Tim44-like domain-contain protein  34.76 
 
 		 340 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3607  import inner membrane translocase, subunit Tim44  37.97 
 
 		 291 aa  133  3.9999999999999996e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5131  import inner membrane translocase subunit Tim44  41.4 
 
 		 284 aa  132  9e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.499992  normal  0.12698 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2731  import inner membrane translocase, subunit Tim44  32.54 
 
 		 343 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.767216  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2119  import inner membrane translocase, subunit Tim44  32.54 
 
 		 343 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.434025  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4049  hypothetical protein  30.72 
 
 		 330 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.631655 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2758  import inner membrane translocase subunit Tim44  32.54 
 
 		 343 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.778073  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0187  hypothetical protein  34.36 
 
 		 323 aa  129  6e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2399  hypothetical protein  34.36 
 
 		 323 aa  129  6e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0668  Tim44-like domain-containing protein  34.56 
 
 		 324 aa  129  6e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2759  hypothetical protein  34.36 
 
 		 323 aa  129  6e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0845  transmembrane protein  34.36 
 
 		 323 aa  129  6e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.376855  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2319  hypothetical protein  34.36 
 
 		 323 aa  129  6e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0684  Tim44-like domain-containing protein  34.97 
 
 		 323 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6058  putative transporter  31.86 
 
 		 344 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0568  import inner membrane translocase subunit Tim44  33.64 
 
 		 340 aa  125  7e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.312734  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5261  import inner membrane translocase, subunit Tim44  41.55 
 
 		 297 aa  124  2e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5402  import inner membrane translocase subunit Tim44  40.85 
 
 		 284 aa  123  4e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0843666 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4035  import inner membrane translocase, subunit Tim44  35.27 
 
 		 288 aa  121  9.999999999999999e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4340  hypothetical protein  37.02 
 
 		 291 aa  119  7.999999999999999e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0432  import inner membrane translocase, subunit Tim44  36.4 
 
 		 327 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0303  import inner membrane translocase subunit Tim44  34.19 
 
 		 283 aa  117  3e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000256366  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2548  hypothetical protein  32.87 
 
 		 270 aa  115  6.9999999999999995e-25  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3119  hypothetical protein  35.85 
 
 		 295 aa  115  7.999999999999999e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.448764 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2676  hypothetical protein  32.87 
 
 		 270 aa  114  1.0000000000000001e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3229  import inner membrane translocase subunit Tim44  34.33 
 
 		 289 aa  114  3e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000053282  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2096  hypothetical protein  32.99 
 
 		 318 aa  113  5e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0739383  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1004  putative transport protein  33.78 
 
 		 316 aa  112  5e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0218  import inner membrane translocase subunit Tim44  36.21 
 
 		 294 aa  112  7.000000000000001e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0372  import inner membrane translocase, subunit Tim44  33.49 
 
 		 329 aa  107  2e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.18784  normal  0.460564 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1550  hypothetical protein  32.68 
 
 		 291 aa  107  2e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0535221  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2780  hypothetical protein  32.99 
 
 		 273 aa  104  2e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.300996 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0773  hypothetical protein  35 
 
 		 301 aa  104  2e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2065  import inner membrane translocase subunit Tim44  32.08 
 
 		 320 aa  100  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0100272 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004023  hypothetical protein  31.6 
 
 		 290 aa  99.4  6e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000578853  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1601  import inner membrane translocase subunit Tim44  34.54 
 
 		 303 aa  98.2  1e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1896  import inner membrane translocase, subunit Tim44  28.66 
 
 		 303 aa  96.7  4e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0839059  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01439  hypothetical protein  32.64 
 
 		 290 aa  93.6  3e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1256  hypothetical protein  32.2 
 
 		 204 aa  91.7  2e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1110  import inner membrane translocase subunit Tim44  28.05 
 
 		 298 aa  91.3  2e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.354142  normal  0.0303721 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0782  import inner membrane translocase, subunit Tim44  30.18 
 
 		 330 aa  90.1  4e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2523  import inner membrane translocase subunit Tim44  30.08 
 
 		 333 aa  89.4  6e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0253878 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2861  import inner membrane translocase subunit Tim44  30.6 
 
 		 308 aa  86.7  4e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5460  import inner membrane translocase subunit Tim44  36.13 
 
 		 338 aa  86.3  5e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.258661  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0861  import inner membrane translocase, subunit Tim44  36.8 
 
 		 333 aa  85.9  7e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0675238 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1292  import inner membrane translocase, subunit Tim44  29.87 
 
 		 318 aa  85.5  9e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.268135  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1319  import inner membrane translocase, subunit Tim44  29.51 
 
 		 321 aa  85.1  0.000000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000259831  hitchhiker  0.00890559 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0538  import inner membrane translocase, subunit Tim44  29.9 
 
 		 311 aa  85.1  0.000000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3643  import inner membrane translocase, subunit Tim44  37.3 
 
 		 343 aa  83.2  0.000000000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.115775  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1736  import inner membrane translocase subunit Tim44  30.74 
 
 		 308 aa  83.2  0.000000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.0000113621  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2192  hypothetical protein  29.62 
 
 		 311 aa  77  0.0000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.398942 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2207  import inner membrane translocase subunit Tim44  27.74 
 
 		 329 aa  49.7  0.00006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4395  hypothetical protein  31.43 
 
 		 146 aa  48.5  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.28787  normal  0.262018 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0482  import inner membrane translocase, subunit Tim44  26.32 
 
 		 331 aa  45.4  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.110353  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0544  import inner membrane translocase subunit Tim44  25 
 
 		 295 aa  44.3  0.002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>