22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_2571 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013202  Hmuk_2571  hypothetical protein  100 
 
 
208 aa  424  1e-118  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.35222 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2974  hypothetical protein  53.17 
 
 
217 aa  222  3e-57  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.598698  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0610  hypothetical protein  53.52 
 
 
215 aa  218  7e-56  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0471148  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2097  hypothetical protein  48.76 
 
 
210 aa  182  3e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0633  hypothetical protein  47.78 
 
 
221 aa  182  4.0000000000000006e-45  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.831356  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1992  hypothetical protein  35.2 
 
 
211 aa  113  2.0000000000000002e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.770462  normal  0.123925 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3342  Uracil-DNA glycosylase superfamily  29.76 
 
 
216 aa  88.6  7e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.747141  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1578  Uracil-DNA glycosylase-like protein  28.78 
 
 
220 aa  81.3  0.00000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2639  Uracil-DNA glycosylase superfamily  31.19 
 
 
208 aa  77  0.0000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0183  Uracil-DNA glycosylase superfamily  28.43 
 
 
210 aa  72  0.000000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.589955  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0318  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  27.22 
 
 
193 aa  58.2  0.00000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.100378  normal  0.0408737 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3700  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  28.82 
 
 
193 aa  56.2  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0248  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  25.44 
 
 
192 aa  52.8  0.000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.548408  normal  0.366992 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3631  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  32.73 
 
 
226 aa  46.6  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5994  Uracil-DNA glycosylase superfamily  27.22 
 
 
546 aa  46.2  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.263417 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3772  Uracil-DNA glycosylase superfamily  32.48 
 
 
226 aa  45.8  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.817518  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3689  Uracil-DNA glycosylase superfamily protein  32.74 
 
 
226 aa  45.1  0.0009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2784  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  25.77 
 
 
211 aa  43.1  0.003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0335572 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0736  putative uracil-DNA glycosylase  30.97 
 
 
224 aa  43.1  0.003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0372  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  27.01 
 
 
294 aa  42.4  0.005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000046016 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1564  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  28.95 
 
 
228 aa  42  0.007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.14365  hitchhiker  0.00784209 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2636  Uracil-DNA glycosylase superfamily  41.38 
 
 
221 aa  41.6  0.009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>