More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_2175 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013202  Hmuk_0692  adenylosuccinate synthetase  71 
 
 
467 aa  660    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.174623 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2175  adenylosuccinate synthetase  100 
 
 
464 aa  925    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3218  Adenylosuccinate synthase  71.37 
 
 
461 aa  684    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.159483  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1057  Adenylosuccinate synthase  75.43 
 
 
454 aa  706    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0047  adenylosuccinate synthetase  71.34 
 
 
462 aa  665    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1323  adenylosuccinate synthetase  63.98 
 
 
451 aa  581  1e-164  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.120017 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1818  adenylosuccinate synthetase  43.07 
 
 
430 aa  362  6e-99  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0200825  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1913  adenylosuccinate synthetase  41.77 
 
 
430 aa  362  1e-98  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3012  adenylosuccinate synthetase  43.67 
 
 
427 aa  360  3e-98  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0951897  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3093  adenylosuccinate synthetase  41.52 
 
 
424 aa  356  5.999999999999999e-97  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000909449  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2536  adenylosuccinate synthetase  43.41 
 
 
427 aa  355  6.999999999999999e-97  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0017  adenylosuccinate synthetase  43.45 
 
 
427 aa  355  6.999999999999999e-97  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.000177457  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0017  adenylosuccinate synthetase  43.45 
 
 
427 aa  355  6.999999999999999e-97  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2909  Adenylosuccinate synthetase  41.3 
 
 
429 aa  353  4e-96  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000270112  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0010  adenylosuccinate synthetase  41.29 
 
 
427 aa  353  5e-96  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000465701  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4927  Adenylosuccinate synthase  40.22 
 
 
427 aa  353  5e-96  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000089661  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3539  adenylosuccinate synthetase  42.58 
 
 
428 aa  352  5.9999999999999994e-96  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2309  adenylosuccinate synthetase  42.03 
 
 
427 aa  350  2e-95  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0139427  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2354  adenylosuccinate synthetase  41.09 
 
 
426 aa  350  2e-95  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0316685  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4007  adenylosuccinate synthetase  41.94 
 
 
429 aa  350  3e-95  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000037837  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3300  adenylosuccinate synthetase  42.15 
 
 
428 aa  350  4e-95  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000123723  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1460  adenylosuccinate synthetase  41.81 
 
 
427 aa  350  4e-95  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.57165  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1271  adenylosuccinate synthetase  42.61 
 
 
429 aa  349  6e-95  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.231459  normal  0.288086 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3410  adenylosuccinate synthetase  41.72 
 
 
428 aa  348  1e-94  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5320  adenylosuccinate synthetase  43.23 
 
 
429 aa  346  6e-94  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000159422  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5148  adenylosuccinate synthetase  43.23 
 
 
429 aa  346  6e-94  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  1.87247e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5716  adenylosuccinate synthetase  43.23 
 
 
429 aa  346  6e-94  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000188586  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5577  adenylosuccinate synthetase  43.23 
 
 
429 aa  346  6e-94  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.85689e-26 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5915  adenylosuccinate synthetase  43.79 
 
 
439 aa  346  7e-94  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0390  adenylosuccinate synthetase  40.95 
 
 
429 aa  345  8.999999999999999e-94  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000000168216  decreased coverage  0.00000000000000193534 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2029  adenylosuccinate synthetase  41.2 
 
 
429 aa  342  7e-93  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00381049  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0203  adenylosuccinate synthetase  42.15 
 
 
427 aa  341  2e-92  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2207  adenylosuccinate synthetase  41.24 
 
 
430 aa  340  2.9999999999999998e-92  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08920  adenylosuccinate synthetase  43.01 
 
 
432 aa  340  2.9999999999999998e-92  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3260  adenylosuccinate synthetase  40.47 
 
 
430 aa  340  4e-92  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0574684  hitchhiker  0.00000000000114461 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2390  adenylosuccinate synthetase  40.26 
 
 
434 aa  339  5.9999999999999996e-92  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0203  adenylosuccinate synthetase  41.54 
 
 
431 aa  338  9.999999999999999e-92  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  8.773480000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2196  adenylosuccinate synthetase  41.14 
 
 
434 aa  337  1.9999999999999998e-91  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1667  adenylosuccinate synthetase  41.11 
 
 
439 aa  337  1.9999999999999998e-91  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2409  adenylosuccinate synthetase  39.14 
 
 
444 aa  337  1.9999999999999998e-91  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0382051  normal  0.0691331 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4368  adenylosuccinate synthetase  41.47 
 
 
427 aa  337  2.9999999999999997e-91  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.335736  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0069  adenylosuccinate synthetase  41.29 
 
 
432 aa  336  5.999999999999999e-91  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000215485  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2053  adenylosuccinate synthetase  39.57 
 
 
447 aa  334  2e-90  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07421  adenylosuccinate synthetase  41.2 
 
 
439 aa  333  3e-90  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2419  adenylosuccinate synthetase  39.61 
 
 
424 aa  333  3e-90  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000351382  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3308  adenylosuccinate synthetase  39.83 
 
 
433 aa  332  6e-90  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00120298  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0518  adenylosuccinate synthetase  38.97 
 
 
430 aa  332  9e-90  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.289891  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0271  adenylosuccinate synthetase  41.7 
 
 
427 aa  331  1e-89  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1816  adenylosuccinate synthetase  39.31 
 
 
434 aa  332  1e-89  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0322  adenylosuccinate synthetase  39.82 
 
 
434 aa  332  1e-89  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0211  adenylosuccinate synthetase  41 
 
 
427 aa  331  1e-89  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.398163 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2144  adenylosuccinate synthase  41.76 
 
 
430 aa  330  4e-89  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2132  adenylosuccinate synthetase  41.67 
 
 
427 aa  329  6e-89  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000468413  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05331  adenylosuccinate synthetase  38.54 
 
 
436 aa  329  7e-89  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1126  adenylosuccinate synthetase  41.59 
 
 
436 aa  329  7e-89  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00711413  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0565  adenylosuccinate synthetase  39.61 
 
 
432 aa  329  8e-89  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.22549e-25 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0552  adenylosuccinate synthetase  39.19 
 
 
432 aa  328  8e-89  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000130749  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5164  adenylosuccinate synthetase  43.44 
 
 
429 aa  328  9e-89  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000038286  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0522  adenylosuccinate synthetase  40.78 
 
 
429 aa  328  9e-89  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5617  adenylosuccinate synthetase  43.23 
 
 
429 aa  328  1.0000000000000001e-88  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000421439  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2598  adenylosuccinate synthetase  43.01 
 
 
432 aa  328  1.0000000000000001e-88  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.0051551  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0213  adenylosuccinate synthetase  39.82 
 
 
434 aa  328  1.0000000000000001e-88  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.816026  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0176  adenylosuccinate synthetase  40.35 
 
 
427 aa  328  1.0000000000000001e-88  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0507  adenylosuccinate synthetase  38.49 
 
 
436 aa  328  1.0000000000000001e-88  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05631  adenylosuccinate synthetase  38.33 
 
 
436 aa  328  1.0000000000000001e-88  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1347  adenylosuccinate synthetase  40.52 
 
 
428 aa  328  1.0000000000000001e-88  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05071  adenylosuccinate synthetase  39.35 
 
 
437 aa  328  1.0000000000000001e-88  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.22054  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5594  adenylosuccinate synthetase  43.23 
 
 
429 aa  327  2.0000000000000001e-88  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000767866  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2691  adenylosuccinate synthetase  43.01 
 
 
432 aa  328  2.0000000000000001e-88  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.321196  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3524  adenylosuccinate synthetase  38.71 
 
 
444 aa  328  2.0000000000000001e-88  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0691  adenylosuccinate synthetase  40.26 
 
 
439 aa  328  2.0000000000000001e-88  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1265  adenylosuccinate synthetase  43.01 
 
 
432 aa  328  2.0000000000000001e-88  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0163864  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5655  adenylosuccinate synthetase  43.23 
 
 
429 aa  328  2.0000000000000001e-88  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000753015  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4635  adenylosuccinate synthetase  42.36 
 
 
427 aa  327  2.0000000000000001e-88  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.595604  normal  0.413258 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5260  adenylosuccinate synthetase  43.01 
 
 
429 aa  328  2.0000000000000001e-88  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000740199  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0735  adenylosuccinate synthetase  38.92 
 
 
447 aa  328  2.0000000000000001e-88  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.772152 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0706  adenylosuccinate synthetase  38.92 
 
 
447 aa  327  2.0000000000000001e-88  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0662  adenylosuccinate synthetase  38.76 
 
 
431 aa  327  3e-88  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.681047  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0046  adenylosuccinate synthetase  40.48 
 
 
426 aa  327  4.0000000000000003e-88  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.268676  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0139  adenylosuccinate synthetase  41.87 
 
 
429 aa  327  4.0000000000000003e-88  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000561019 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0667  adenylosuccinate synthetase  40.6 
 
 
429 aa  326  6e-88  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0389  Adenylosuccinate synthase  40.61 
 
 
427 aa  325  7e-88  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.899335  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0133  adenylosuccinate synthase  41.56 
 
 
807 aa  325  8.000000000000001e-88  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.279104  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2963  adenylosuccinate synthetase  41.61 
 
 
428 aa  325  8.000000000000001e-88  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.17225  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1627  adenylosuccinate synthetase  40.64 
 
 
533 aa  325  1e-87  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5341  adenylosuccinate synthetase  42.8 
 
 
429 aa  324  2e-87  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000698384  hitchhiker  0.0000000000916292 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2616  adenylosuccinate synthetase  40.26 
 
 
432 aa  324  2e-87  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.199466  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0330  adenylosuccinate synthetase  39.65 
 
 
428 aa  325  2e-87  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2031  adenylosuccinate synthetase  38.73 
 
 
435 aa  324  2e-87  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0290835 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3251  adenylosuccinate synthetase  39.19 
 
 
430 aa  323  3e-87  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.220385  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3282  adenylosuccinate synthetase  37.63 
 
 
437 aa  324  3e-87  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00809393  normal  0.019729 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3138  adenylosuccinate synthetase  41.52 
 
 
430 aa  323  4e-87  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.32892  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1231  adenylosuccinate synthetase  40.64 
 
 
429 aa  323  4e-87  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2262  adenylosuccinate synthetase  38.51 
 
 
429 aa  323  5e-87  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0914846 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0115  adenylosuccinate synthase  40.17 
 
 
433 aa  322  6e-87  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1683  adenylosuccinate synthetase  40.64 
 
 
429 aa  322  8e-87  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.469628  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3635  adenylosuccinate synthetase  40.96 
 
 
429 aa  322  9.999999999999999e-87  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.336244 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2958  adenylosuccinate synthetase  40.31 
 
 
428 aa  322  9.999999999999999e-87  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05701  adenylosuccinate synthetase  38.71 
 
 
436 aa  321  1.9999999999999998e-86  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0524  adenylosuccinate synthetase  37.28 
 
 
432 aa  321  1.9999999999999998e-86  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>