55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_R0014 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_R0014  tRNA-Ser  100 
 
 		 82 bp  163  8.000000000000001e-39  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.593204  normal  0.16115 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_R0027  tRNA-Ser  90.24 
 
 		 82 bp  99.6  1e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_R0020  tRNA-Ser  90.24 
 
 		 81 bp  91.7  2e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_R0056  tRNA-Ser  90.24 
 
 		 81 bp  91.7  2e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_R0019  tRNA-Ser  89.02 
 
 		 82 bp  91.7  2e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0532  tRNA-Ser  93.18 
 
 		 95 bp  58  0.0000003  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.936136  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_tRNA6  tRNA-Ser  92.5 
 
 		 90 bp  50.1  0.00008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0471  tRNA-Ser  92.5 
 
 		 92 bp  50.1  0.00008  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_R0040  tRNA-Ser  92.5 
 
 		 91 bp  50.1  0.00008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_R0059  tRNA-Ser  92.5 
 
 		 90 bp  50.1  0.00008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  hitchhiker  0.00925485  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_R0023  tRNA-Ser  92.5 
 
 		 90 bp  50.1  0.00008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.928958  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_R0069  tRNA-Ser  92.5 
 
 		 90 bp  50.1  0.00008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.234081 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_R0015  tRNA-Ser  92.5 
 
 		 90 bp  50.1  0.00008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.530597 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_R0051    92.5 
 
 		 90 bp  50.1  0.00008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1742  tRNA-Ser  100 
 
 		 90 bp  48.1  0.0003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0902657  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_R0015  tRNA-Arg  100 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0015  tRNA-Ser  92.11 
 
 		 90 bp  46.1  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0008  tRNA-Ser  92.11 
 
 		 90 bp  46.1  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.289156  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_R0008  tRNA-Arg  100 
 
 		 78 bp  46.1  0.001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0040  tRNA-Ser  92.11 
 
 		 90 bp  46.1  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.140248 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0014  tRNA-Ser  92.11 
 
 		 90 bp  46.1  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.359735  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0016  tRNA-Ser  92.11 
 
 		 91 bp  46.1  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_R0016  tRNA-Ser  92.11 
 
 		 90 bp  46.1  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.266045  normal  0.745909 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_R0057  tRNA-Ser  92.11 
 
 		 90 bp  46.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_R0064  tRNA-Ser  92.11 
 
 		 90 bp  46.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0017  tRNA-Ser  92.11 
 
 		 90 bp  46.1  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0033  tRNA-Ser  92.11 
 
 		 90 bp  46.1  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.56325  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_R0025  tRNA-Ser  92.11 
 
 		 90 bp  46.1  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00148437  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4596  tRNA-Ser  92.11 
 
 		 90 bp  46.1  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_R0062  tRNA-Ser  92.11 
 
 		 90 bp  46.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.633699 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_t07713  tRNA-Ser  92.11 
 
 		 88 bp  46.1  0.001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_R0010  tRNA-Ser  100 
 
 		 92 bp  46.1  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000388656  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRAt11  tRNA-Ser  92.11 
 
 		 90 bp  46.1  0.001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.644598  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_R0030  tRNA-Ser  96.3 
 
 		 91 bp  46.1  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.596087  normal  0.116932 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_4314  tRNA-Ser  92.11 
 
 		 90 bp  46.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.650713  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_R0017  tRNA-Ser  92.11 
 
 		 90 bp  46.1  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.576804  normal  0.691356 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_R0025  tRNA-Ser  92.11 
 
 		 90 bp  46.1  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.217878  normal  0.142788 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0067  tRNA-Ser  92.11 
 
 		 90 bp  46.1  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0006  tRNA-Ser  92.11 
 
 		 90 bp  46.1  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_R0017  tRNA-Ser  92.11 
 
 		 90 bp  46.1  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00284743  normal  0.30406 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0911  tRNA-Ser  92.11 
 
 		 90 bp  46.1  0.001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.531015  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_R0034  tRNA-Ser  92.11 
 
 		 90 bp  46.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_R0025  tRNA-Ser  92.11 
 
 		 90 bp  46.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1009  tRNA-Ser  92.11 
 
 		 92 bp  46.1  0.001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_R0045  tRNA-Arg  100 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.824149  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0060  tRNA-Ser  92.11 
 
 		 90 bp  46.1  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0027  tRNA-Ser  92.11 
 
 		 90 bp  46.1  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.5818  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_6042  tRNA-Ser  92.11 
 
 		 90 bp  46.1  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.516287  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_R0042  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 91 bp  44.1  0.005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.399999  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0569  tRNA-Met  100 
 
 		 79 bp  44.1  0.005  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0308  tRNA-Ser  100 
 
 		 90 bp  44.1  0.005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0039  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.788311  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0035  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_R0020  tRNA-Ser  90.24 
 
 		 90 bp  44.1  0.005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.437466  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_R0007  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 88 bp  44.1  0.005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0117115  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>