10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_R0020 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013743  Htur_R0056  tRNA-Ser  100 
 
 		 81 bp  161  3e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_R0020  tRNA-Ser  100 
 
 		 81 bp  161  3e-38  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_R0019  tRNA-Ser  98.78 
 
 		 82 bp  147  5e-34  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_R0027  tRNA-Ser  96.34 
 
 		 82 bp  131  3e-29  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_R0014  tRNA-Ser  90.24 
 
 		 82 bp  91.7  2e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.593204  normal  0.16115 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1742  tRNA-Ser  100 
 
 		 90 bp  48.1  0.0003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0902657  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_R0030  tRNA-Ser  96.3 
 
 		 91 bp  46.1  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.596087  normal  0.116932 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0532  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 95 bp  44.1  0.005  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.936136  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_R0020  tRNA-Ser  90.24 
 
 		 90 bp  44.1  0.005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.437466  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_R0042  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 91 bp  44.1  0.005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.399999  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>