More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_0176 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_0176  FeS assembly ATPase SufC  100 
 
 		 305 aa  605  9.999999999999999e-173  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2918  FeS assembly ATPase SufC  80 
 
 		 309 aa  477  1e-133  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0376  FeS assembly ATPase SufC  80.33 
 
 		 302 aa  458  9.999999999999999e-129  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.970366  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1500  FeS assembly ATPase SufC  79.34 
 
 		 302 aa  449  1e-125  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2432  FeS assembly ATPase SufC  77.7 
 
 		 302 aa  444  1e-123  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1699  FeS assembly ATPase SufC  51.82 
 
 		 257 aa  286  4e-76  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3579  FeS assembly ATPase SufC  49.16 
 
 		 261 aa  278  7e-74  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0115  FeS assembly ATPase SufC  48.83 
 
 		 261 aa  277  1e-73  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0960  FeS assembly ATPase SufC  50 
 
 		 259 aa  277  1e-73  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.531756  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5125  FeS assembly ATPase SufC  48.83 
 
 		 261 aa  277  2e-73  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0557185  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5088  FeS assembly ATPase SufC  48.83 
 
 		 261 aa  277  2e-73  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0496  FeS assembly ATPase SufC  50.66 
 
 		 253 aa  277  2e-73  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.496286  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4707  iron regulated ABC transporter, ATP-binding protein  48.83 
 
 		 261 aa  277  2e-73  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4805  FeS assembly ATPase SufC  48.83 
 
 		 261 aa  277  2e-73  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.874646  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0171  FeS assembly ATPase SufC  50.17 
 
 		 250 aa  276  3e-73  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4851  ABC transporter ATP-binding protein  48.83 
 
 		 261 aa  276  4e-73  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.846405  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4692  iron regulated ABC transporter, ATP-binding protein  48.83 
 
 		 261 aa  276  4e-73  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5217  ABC transporter ATP-binding protein  48.83 
 
 		 261 aa  276  4e-73  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5120  ABC transporter, ATP-binding protein  48.83 
 
 		 261 aa  275  7e-73  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5123  FeS assembly ATPase SufC  48.83 
 
 		 261 aa  275  7e-73  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.160876  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0859  FeS assembly ATPase SufC  50.5 
 
 		 253 aa  275  9e-73  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00902291  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0843  FeS assembly ATPase SufC  50.5 
 
 		 253 aa  275  9e-73  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.502163  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2923  FeS assembly ATPase SufC  48.33 
 
 		 259 aa  270  2e-71  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.843618  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0413  FeS assembly ATPase SufC  46.84 
 
 		 263 aa  270  2e-71  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2038  Fe-S cluster assembly ABC-type transport system, ATPase component  47 
 
 		 266 aa  269  4e-71  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04455  ABC transporter, ATP-binding protein  48.99 
 
 		 250 aa  268  5.9999999999999995e-71  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.730062  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3074  FeS assembly ATPase SufC  48.33 
 
 		 259 aa  268  5.9999999999999995e-71  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0141  ABC transporter, ATP-binding protein  49.67 
 
 		 256 aa  264  1e-69  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.772366  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0258  ABC transporter, ATP-binding protein  46.13 
 
 		 250 aa  263  2e-69  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0785  FeS assembly ATPase SufC  47.65 
 
 		 251 aa  264  2e-69  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00319351  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4168  FeS assembly ATPase SufC  48.17 
 
 		 252 aa  263  2e-69  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.141156  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0304  FeS assembly ATPase SufC  49.01 
 
 		 260 aa  263  3e-69  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.553044  normal  0.119713 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0708  FeS assembly ATPase SufC  47.71 
 
 		 260 aa  262  4e-69  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1182  FeS assembly ATPase SufC  47.14 
 
 		 248 aa  263  4e-69  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2023  FeS assembly ATPase SufC  48.68 
 
 		 254 aa  261  8e-69  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.213724  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0241  hypothetical protein  46.62 
 
 		 249 aa  261  1e-68  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.883756 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1974  ABC-type transport system for Fe-S cluster assembly, ATPase component  48.67 
 
 		 256 aa  261  1e-68  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0474  FeS assembly ATPase SufC  46.36 
 
 		 256 aa  260  2e-68  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.754758  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0986  FeS assembly ATPase SufC  49.3 
 
 		 261 aa  259  3e-68  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.105388  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0891  FeS assembly ATPase SufC  47.85 
 
 		 265 aa  259  3e-68  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0425  FeS assembly ATPase SufC  47.57 
 
 		 262 aa  258  6e-68  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0552296 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0218  ABC transporter ATP-binding protein  49.33 
 
 		 256 aa  256  3e-67  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5778  FeS assembly ATPase SufC  46.44 
 
 		 252 aa  256  5e-67  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1007  FeS assembly ATPase SufC  47.12 
 
 		 247 aa  255  5e-67  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.515464 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1861  FeS assembly ATPase SufC  46.94 
 
 		 263 aa  253  2.0000000000000002e-66  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.805804  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0637  hypothetical protein  44.93 
 
 		 250 aa  253  4.0000000000000004e-66  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0653  hypothetical protein  45.27 
 
 		 250 aa  252  5.000000000000001e-66  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0175  FeS assembly ATPase SufC  45.97 
 
 		 251 aa  252  6e-66  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.619518  hitchhiker  0.000000823487 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0977  iron-regulated ABC transporter, ATP-binding protein  44.3 
 
 		 253 aa  251  9.000000000000001e-66  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.538395  normal  0.213852 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0697  FeS assembly ATPase SufC  46.62 
 
 		 262 aa  251  1e-65  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.85326  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0385  FeS assembly ATPase SufC  46.25 
 
 		 258 aa  251  1e-65  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.686208 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3444  FeS assembly ATPase SufC  45.82 
 
 		 260 aa  251  1e-65  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0371851  hitchhiker  0.0000000668282 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5984  ABC transporter  49.66 
 
 		 257 aa  250  2e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.509721  normal  0.150188 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1234  FeS assembly ATPase SufC  45.3 
 
 		 250 aa  249  3e-65  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00811  ABC transporter, ATP binding component  45.58 
 
 		 260 aa  249  3e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4730  FeS assembly ATPase SufC  46.31 
 
 		 256 aa  249  4e-65  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0074  FeS assembly ATPase SufC  45.58 
 
 		 261 aa  249  5e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11510  Iron-regulated ABC transporter ATPase subunit SufC  46.78 
 
 		 254 aa  249  6e-65  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.012943  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0797  FeS assembly ATPase SufC  44.98 
 
 		 261 aa  248  7e-65  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.554265  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2360  FeS assembly ATPase SufC  47.77 
 
 		 252 aa  248  9e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.750079  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2489  FeS assembly ATPase SufC  45.95 
 
 		 258 aa  247  2e-64  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3966  FeS assembly ATPase SufC  46.39 
 
 		 251 aa  247  2e-64  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.304884  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1969  FeS assembly ATPase SufC  48.14 
 
 		 249 aa  247  2e-64  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.356716 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2743  FeS assembly ATPase SufC  46.64 
 
 		 252 aa  246  3e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.858995  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0991  FeS assembly ATPase SufC  45.42 
 
 		 254 aa  246  3e-64  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2227  FeS assembly ATPase SufC  47.37 
 
 		 255 aa  246  3e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000208508  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2337  FeS assembly ATPase SufC  47.64 
 
 		 252 aa  246  3e-64  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.740373 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0538  FeS assembly ATPase SufC  45.36 
 
 		 250 aa  246  4e-64  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.703052  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01361  ABC transporter, ATP binding component  44.55 
 
 		 263 aa  246  4e-64  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.16399  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2281  FeS assembly ATPase SufC  46.78 
 
 		 262 aa  245  4.9999999999999997e-64  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.143432 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2572  FeS assembly ATPase SufC  44.7 
 
 		 273 aa  245  6.999999999999999e-64  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.023273  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1236  FeS assembly ATPase SufC  46.1 
 
 		 246 aa  245  6.999999999999999e-64  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1435  FeS assembly ATPase SufC  44.22 
 
 		 263 aa  245  8e-64  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.157604  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5398  FeS assembly ATPase SufC  44.59 
 
 		 257 aa  245  8e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3039  FeS assembly ATPase SufC  44.19 
 
 		 255 aa  244  9e-64  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0647641 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2359  FeS assembly ATPase SufC  47.42 
 
 		 251 aa  244  9.999999999999999e-64  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0744397 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3152  FeS assembly ATPase SufC  45.24 
 
 		 253 aa  244  9.999999999999999e-64  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0929379  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0604  Fe-S cluster assembly ABC transporter ATPase  46.96 
 
 		 259 aa  243  1.9999999999999999e-63  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.164231  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3080  FeS assembly ATPase SufC  46.8 
 
 		 257 aa  244  1.9999999999999999e-63  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.190526  normal  0.204267 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2992  FeS assembly ATPase SufC  47.1 
 
 		 252 aa  243  3e-63  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0584869 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1507  FeS assembly ATPase SufC  44.07 
 
 		 264 aa  243  3e-63  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.274467  normal  0.26759 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00841  ABC transporter, ATP binding component  45.24 
 
 		 261 aa  243  3e-63  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.520041  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1736  Iron-regulated ABC transporter ATPase subunit SufC  46.1 
 
 		 261 aa  243  3.9999999999999997e-63  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0197  FeS assembly ATPase SufC  45.92 
 
 		 247 aa  243  3.9999999999999997e-63  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0416  FeS assembly ATPase SufC  44.41 
 
 		 256 aa  243  3.9999999999999997e-63  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5930  ABC transporter associated with Fe-S cluster assembly, ATP binding protein  46 
 
 		 253 aa  242  3.9999999999999997e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0427  FeS assembly ATPase SufC  44.41 
 
 		 256 aa  243  3.9999999999999997e-63  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2067  FeS assembly ATPase SufC  45.1 
 
 		 267 aa  242  5e-63  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.962142  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2385  FeS assembly ATPase SufC  45.64 
 
 		 257 aa  242  6e-63  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0576904  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1674  FeS assembly ATPase SufC  46.28 
 
 		 252 aa  242  6e-63  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.305783  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1984  Iron-regulated ABC transporter ATPase subunit SufC  46.13 
 
 		 253 aa  241  7e-63  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.192658  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1447  ATP-dependent transporter  45.24 
 
 		 244 aa  242  7e-63  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.629714  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1514  FeS assembly ATPase SufC  45.24 
 
 		 244 aa  242  7e-63  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3967  hypothetical protein  46.94 
 
 		 250 aa  242  7e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.147805  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1317  FeS assembly ATPase SufC  47.62 
 
 		 254 aa  241  7.999999999999999e-63  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00252118  normal  0.400998 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2266  FeS assembly ATPase SufC  46.1 
 
 		 252 aa  241  7.999999999999999e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.164806 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00831  ABC transporter, ATP binding component  44.56 
 
 		 261 aa  241  9e-63  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.664589  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13370  Iron-regulated ABC transporter ATPase subunit SufC  45.54 
 
 		 253 aa  241  1e-62  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0871806  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0671  FeS assembly ATPase SufC  45.7 
 
 		 247 aa  241  1e-62  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.814843  normal  0.342394 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3675  FeS assembly ATPase SufC  44.63 
 
 		 256 aa  241  1e-62  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.426294  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>