More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_2180 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008789  Hhal_2180  methyltransferase type 12  100 
 
 
205 aa  410  1e-113  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0381  methyltransferase type 11  69.5 
 
 
213 aa  289  2e-77  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.116579 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1096  Methyltransferase type 11  61.39 
 
 
203 aa  257  7e-68  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0843  Phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  39.82 
 
 
217 aa  63.5  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0345  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  35.88 
 
 
228 aa  63.2  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.935966  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0321  Phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  40.58 
 
 
245 aa  61.6  0.000000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.943946  normal  0.235665 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0964  Phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  37.93 
 
 
217 aa  61.2  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.417338  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2020  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  25.61 
 
 
236 aa  60.8  0.00000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2433  putative methyltransferase  33.59 
 
 
348 aa  60.5  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0150817 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1267  MCP methyltransferase, CheR-type  38.32 
 
 
274 aa  60.5  0.00000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0328  hypothetical protein  35.78 
 
 
351 aa  60.1  0.00000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.621774 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2685  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  36.03 
 
 
229 aa  59.7  0.00000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.469648 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1729  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  27.85 
 
 
243 aa  59.3  0.00000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4809  Methyltransferase type 11  35.29 
 
 
229 aa  59.3  0.00000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.483616  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0458  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.77 
 
 
234 aa  58.2  0.00000008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1038  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  35.9 
 
 
244 aa  57  0.0000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3086  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase / phosphatidyl-N-methylethanolamine N-methyltransferase  33.02 
 
 
213 aa  56.2  0.0000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00198  methyltransferase  30.94 
 
 
280 aa  56.6  0.0000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.524751  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2168  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  33.96 
 
 
237 aa  55.8  0.0000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.240799  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3020  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  33.58 
 
 
249 aa  55.5  0.0000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.615191  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1808  Methyltransferase type 11  28.68 
 
 
286 aa  55.5  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1232  methyltransferase type 11  32.71 
 
 
238 aa  55.5  0.0000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.976917  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0018  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase / phosphatidyl-N-methylethanolamine N-methyltransferase  25.43 
 
 
204 aa  55.1  0.0000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000241496  hitchhiker  0.00000138707 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1148  methyltransferase type 11  34.06 
 
 
215 aa  55.1  0.0000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1530  3-demethylubiquinone-9 3-O-methyltransferase  33.12 
 
 
237 aa  54.7  0.0000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02158  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.77 
 
 
240 aa  54.3  0.000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1427  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  32.77 
 
 
240 aa  54.3  0.000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000505917  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3207  Methyltransferase type 11  31.86 
 
 
284 aa  54.7  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.52078 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02117  hypothetical protein  32.77 
 
 
240 aa  54.3  0.000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1104  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.23 
 
 
239 aa  54.3  0.000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.580904  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2383  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.77 
 
 
240 aa  54.3  0.000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.679426  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1845  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.82 
 
 
234 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00431464  normal  0.756459 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1396  Methyltransferase type 11  31.16 
 
 
190 aa  54.7  0.000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.482862  normal  0.887166 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2372  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.77 
 
 
240 aa  54.3  0.000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2527  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.77 
 
 
240 aa  54.3  0.000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3366  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.77 
 
 
240 aa  54.3  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.923438  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7237  methyltransferase type 11  40.74 
 
 
269 aa  54.3  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0859301  normal  0.799948 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2607  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.77 
 
 
240 aa  54.3  0.000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1419  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.77 
 
 
240 aa  54.3  0.000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000287901 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2332  methyltransferase type 11  32.39 
 
 
279 aa  53.5  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.214932 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0328  Methyltransferase type 11  27.27 
 
 
283 aa  53.5  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0335  Methyltransferase type 11  26.67 
 
 
283 aa  53.5  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2845  methyltransferase type 11  30.65 
 
 
348 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.292154 
 
 
-
 
NC_003296  RS04686  methyltransferase protein  32.54 
 
 
274 aa  53.1  0.000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3270  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  35.34 
 
 
241 aa  53.1  0.000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0514123  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0391  methyltransferase type 11  33.6 
 
 
278 aa  52.8  0.000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1317  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  27.95 
 
 
229 aa  52.4  0.000004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000124117  hitchhiker  3.42912e-24 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2081  Methyltransferase type 12  29.36 
 
 
242 aa  52.4  0.000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000517184  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1589  Methyltransferase type 11  28.79 
 
 
209 aa  52.8  0.000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1039  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.19 
 
 
241 aa  52  0.000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00379  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  35.96 
 
 
239 aa  52  0.000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.296609  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2124  methyltransferase type 11  29.03 
 
 
348 aa  52  0.000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0899557  normal  0.31011 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4578  Phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  26.18 
 
 
218 aa  51.6  0.000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.30493  normal  0.829265 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3212  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.77 
 
 
239 aa  51.2  0.000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.812098  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0910  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  34.75 
 
 
247 aa  51.6  0.000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4465  Phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  26.18 
 
 
218 aa  50.8  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.174082  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0660  methyltransferase type 11  32.17 
 
 
303 aa  50.8  0.00001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3961  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  32.76 
 
 
212 aa  50.8  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1663  methyltransferase type 11  29.14 
 
 
243 aa  51.2  0.00001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.639645  normal  0.0934074 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6211  phosphatidyl-N-methylethanolamine N-methyltransferase  32.87 
 
 
225 aa  50.8  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2712  putative phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  28.9 
 
 
226 aa  51.2  0.00001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.870029  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0826  methyltransferase type 11  26.92 
 
 
224 aa  50.8  0.00001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.457177  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4097  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  26.18 
 
 
218 aa  50.8  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.116223 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4832  methyltransferase type 11  28.28 
 
 
287 aa  50.4  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0563647  normal  0.0172807 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2333  methyltransferase  32.67 
 
 
209 aa  50.4  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0767046  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1311  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  33.05 
 
 
242 aa  50.1  0.00002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.310574  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6880  Methyltransferase type 12  28.05 
 
 
353 aa  50.1  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.541401  normal  0.545312 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2768  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  33.05 
 
 
242 aa  50.1  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.167435  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4668  UbiE/COQ5 methyltransferase  32.56 
 
 
205 aa  50.4  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1408  membrane-associated protein  26.42 
 
 
213 aa  50.1  0.00002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2444  methyltransferase type 11  27.27 
 
 
280 aa  50.4  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2847  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  33.05 
 
 
242 aa  50.1  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.170371  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1001  methyltransferase type 11  35.88 
 
 
237 aa  50.1  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5715  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  27.87 
 
 
269 aa  50.1  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.991449  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02731  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.25 
 
 
235 aa  50.1  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2800  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.77 
 
 
242 aa  50.1  0.00002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.241472 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23220  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.56 
 
 
232 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0574161  hitchhiker  0.00443225 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1958  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.19 
 
 
232 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.937117  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4002  Methyltransferase type 11  28.33 
 
 
238 aa  50.4  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.708878  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2926  transcriptional regulator ArsR family  33.98 
 
 
341 aa  49.7  0.00003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.276584  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003110  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.25 
 
 
242 aa  49.7  0.00003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.35235  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4865  Methyltransferase type 11  35.09 
 
 
218 aa  49.7  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.743669  normal  0.127304 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1078  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  27.21 
 
 
330 aa  50.1  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.823717 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6747  Methyltransferase type 11  29.65 
 
 
286 aa  49.3  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0721  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase / phosphatidyl-N-methylethanolamine N-methyltransferase  31.9 
 
 
204 aa  49.7  0.00003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.635481  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0744  Methyltransferase type 11  22.22 
 
 
248 aa  49.7  0.00003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0330334  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0217  UbiE/COQ5 methyltransferase  27.85 
 
 
255 aa  49.7  0.00003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0805678  normal  0.734054 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0834  UbiE/COQ5 methyltransferase  28.72 
 
 
237 aa  49.7  0.00003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.293263  normal  0.0185746 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0944  hypothetical protein  29.33 
 
 
242 aa  49.7  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.162173  normal  0.410696 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2710  demethylmenaquinone methyltransferase  25.3 
 
 
243 aa  49.7  0.00003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2173  methyltransferase type 11  27.94 
 
 
328 aa  49.7  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0853287 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0492  phosphatidyl-N-methylethanolamine N-methyltransferase / phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  31.43 
 
 
232 aa  49.7  0.00003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.578084 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2332  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  34.67 
 
 
245 aa  49.7  0.00003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1561  Methyltransferase type 11  34.85 
 
 
283 aa  50.1  0.00003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.160915  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0039  ArsR family transcriptional regulator  31.35 
 
 
309 aa  49.7  0.00003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2376  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  31.9 
 
 
204 aa  49.7  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.282292 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2503  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.09 
 
 
242 aa  49.3  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2516  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.09 
 
 
242 aa  49.3  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.158942  normal  0.172126 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1576  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.62 
 
 
229 aa  49.3  0.00004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0819441  unclonable  0.000000165496 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2461  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.09 
 
 
242 aa  49.3  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.88889  normal  0.0528077 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>