53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_1942 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008789  Hhal_1942  sulfur oxidation protein  100 
 
 
97 aa  197  3.9999999999999996e-50  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0036  sulphur oxidation protein SoxZ  46.53 
 
 
102 aa  94.7  3e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2222  Sulphur oxidation protein SoxZ  46.53 
 
 
102 aa  94.7  3e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.489265  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0124  Sulphur oxidation protein SoxZ  46.81 
 
 
94 aa  89.4  2e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1669  hypothetical protein  42 
 
 
103 aa  75.9  0.0000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.795304 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1682  sulfur compound chelating protein SoxZ  41.3 
 
 
95 aa  73.9  0.0000000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0565  sulfur compound chelating protein SoxZ  37 
 
 
104 aa  72.4  0.000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00000597942  normal  0.834021 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1592  Sulphur oxidation protein SoxZ  37.89 
 
 
103 aa  72.4  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.377816  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1668  Sulphur oxidation protein SoxZ  37.89 
 
 
103 aa  72.4  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2283  sulfur compound chelating protein SoxZ  36.84 
 
 
103 aa  70.9  0.000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.37544  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0144  sulphur oxidation protein SoxZ  40 
 
 
103 aa  70.1  0.000000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0602  hypothetical protein  33.33 
 
 
108 aa  65.5  0.0000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0709079  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0009  Sulphur oxidation protein SoxZ  37.21 
 
 
98 aa  64.3  0.0000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3781  sulphur oxidation protein SoxZ  37.37 
 
 
103 aa  63.9  0.0000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0695  hypothetical protein  38.95 
 
 
103 aa  63.2  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2435  sulfur compound chelating protein SoxZ  34.34 
 
 
103 aa  63.2  0.000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3422  sulfur compound chelating protein SoxZ  33.33 
 
 
103 aa  61.2  0.000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1259  Sulphur oxidation protein SoxZ  37.5 
 
 
107 aa  61.2  0.000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3045  hypothetical protein  38.3 
 
 
104 aa  61.2  0.000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1474  putative secreted protein  36.36 
 
 
258 aa  60.8  0.000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.591483  normal  0.404038 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2628  sulfur compound chelating protein SoxZ  34.74 
 
 
103 aa  61.2  0.000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.487417  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3715  hypothetical protein  32.91 
 
 
110 aa  59.7  0.00000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.104984  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3674  sulfur oxidation protein  37 
 
 
103 aa  60.1  0.00000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.792666  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1907  hypothetical protein  32.91 
 
 
110 aa  59.7  0.00000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0857144  normal  0.079007 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1924  sulfur oxidation protein SoxZ  35.48 
 
 
101 aa  59.3  0.00000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3131  sulfur compound chelating protein SoxZ  33.67 
 
 
103 aa  58.5  0.00000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0319235  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1989  sulfur compound-chelating protein SoxZ  33.33 
 
 
100 aa  57.8  0.00000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.894639  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2073  Sulphur oxidation protein SoxZ  28.12 
 
 
101 aa  57.4  0.00000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0009  Sulphur oxidation protein SoxZ  32.29 
 
 
102 aa  57.4  0.00000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.0000000324159  hitchhiker  0.00558497 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1035  Sulphur oxidation protein SoxZ  28.57 
 
 
102 aa  56.2  0.0000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.876216  normal  0.48682 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0010  Sulphur oxidation protein SoxZ  34.07 
 
 
102 aa  55.8  0.0000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.363799  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3254  sulfur compound chelating protein SoxZ  29.29 
 
 
103 aa  55.8  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.75878  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3092  sulfur compound chelating protein SoxZ  30.93 
 
 
103 aa  55.1  0.0000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.560397  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0813  Sulphur oxidation protein SoxZ  30.3 
 
 
101 aa  53.9  0.0000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000524393  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0804  sulfur oxidation protein (SoxZ)  29.59 
 
 
102 aa  53.9  0.0000007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2998  sulfur compound chelating protein SoxZ  29.21 
 
 
111 aa  51.2  0.000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000490791  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1468  Sulphur oxidation protein SoxZ  29.55 
 
 
109 aa  50.8  0.000006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00170779  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0202  sulfur compound chelating protein SoxZ  33.33 
 
 
116 aa  49.3  0.00002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0284136 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0030  sulfur oxidation protein SoxZ  30.23 
 
 
98 aa  48.5  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.938219  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3258  hypothetical protein  29.47 
 
 
103 aa  47.4  0.00006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4254  putative sulfur oxidation protein SoxZ  30.68 
 
 
109 aa  47.4  0.00008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.196263  normal  0.227449 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0064  sulphur oxidation protein SoxZ  29.21 
 
 
106 aa  45.4  0.0003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.956687 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4370  putative sulfur oxidation protein SoxZ  29.55 
 
 
109 aa  44.7  0.0004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2057  sulfur oxidation protein SoxZ  27.66 
 
 
97 aa  44.3  0.0005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000000174339  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1520  sulphur oxidation protein SoxZ  27.27 
 
 
109 aa  43.9  0.0007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.998134 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3673  sulfur compound chelating protein SoxZ  27.27 
 
 
108 aa  43.9  0.0008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.273941  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2805  putative sulphur oxidation protein  29.33 
 
 
109 aa  43.5  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.369678 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0515  Sulphur oxidation protein SoxZ  31.71 
 
 
109 aa  43.1  0.001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000277192  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4158  Sulphur oxidation protein SoxZ  28.21 
 
 
109 aa  43.1  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1269  hypothetical protein  37.97 
 
 
280 aa  43.5  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.790284  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7670  Sulphur oxidation protein SoxZ  28.92 
 
 
106 aa  43.1  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4959  Sulphur oxidation protein SoxZ  28.41 
 
 
109 aa  41.6  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.189769  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6958  sulphur oxidation protein SoxZ  25 
 
 
106 aa  40.8  0.007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0302985 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>