20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_4465 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009972  Haur_4465  O-antigen polymerase  100 
 
 		 479 aa  930    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000989096  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4391  O-antigen polymerase  47.49 
 
 		 494 aa  354  2e-96  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.6355  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0654  O-antigen polymerase  49.36 
 
 		 480 aa  352  8.999999999999999e-96  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00317709 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0733  O-antigen polymerase  48.75 
 
 		 485 aa  345  7e-94  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.480414  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3537  membrane protein PslJ  26.46 
 
 		 471 aa  63.2  0.000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0975897  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4116  O-antigen polymerase  26.52 
 
 		 540 aa  53.1  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0014553  hitchhiker  0.00000561153 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4494  hypothetical protein  27.13 
 
 		 447 aa  51.6  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00401546  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3309  hypothetical protein  23.89 
 
 		 471 aa  50.1  0.00008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.110006  normal  0.406179 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35630  hypothetical protein  28.19 
 
 		 478 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.173114  hitchhiker  0.0000000277726 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3001  hypothetical protein  28.19 
 
 		 478 aa  48.9  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.407435  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0314  O-antigen polymerase  25.22 
 
 		 397 aa  47  0.0009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2674  O-antigen polymerase  29.03 
 
 		 592 aa  45.8  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2645  O-antigen polymerase  29.03 
 
 		 592 aa  45.8  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0103  O-antigen polymerase  24.42 
 
 		 492 aa  45.4  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2034  O-antigen polymerase  29.03 
 
 		 592 aa  45.8  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0657  O-antigen polymerase  27.96 
 
 		 593 aa  44.3  0.004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4864  inorganic carbon transporter  25.84 
 
 		 467 aa  44.3  0.005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.867776  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0392  O-antigen polymerase  26.67 
 
 		 398 aa  43.9  0.006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.000178586  normal  0.74185 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2724  hypothetical protein  24.46 
 
 		 508 aa  43.5  0.007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.484456  normal  0.659262 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3078  O-antigen polymerase  28.19 
 
 		 500 aa  43.5  0.008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>