38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_3749 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_3749  hypothetical protein  100 
 
 
225 aa  434  1e-121  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1730  hypothetical protein  31.71 
 
 
225 aa  84.3  0.000000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.716461  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1622  hypothetical protein  30.69 
 
 
227 aa  82.4  0.000000000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04854  conserved hypothetical protein  32.34 
 
 
269 aa  82  0.000000000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4217  hypothetical protein  30.28 
 
 
247 aa  77.8  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000127918  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2107  hypothetical protein  31.31 
 
 
234 aa  75.5  0.0000000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.146647  normal  0.717396 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1758  hypothetical protein  31.25 
 
 
238 aa  72.8  0.000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.162023  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6617  hypothetical protein  33.7 
 
 
252 aa  72.8  0.000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00981466 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1977  hypothetical protein  28.16 
 
 
234 aa  71.6  0.000000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000153346  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2526  hypothetical protein  29.52 
 
 
236 aa  71.2  0.00000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.755196  normal  0.82322 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1186  hypothetical protein  27.8 
 
 
226 aa  70.9  0.00000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2257  hypothetical protein  30.84 
 
 
235 aa  70.9  0.00000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2431  hypothetical protein  30.73 
 
 
242 aa  69.3  0.00000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.344644  normal  0.298555 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1895  hypothetical protein  30.73 
 
 
242 aa  69.3  0.00000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.731685  normal  0.571697 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1861  hypothetical protein  30.73 
 
 
242 aa  68.9  0.00000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.929031  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2451  hypothetical protein  29.33 
 
 
237 aa  68.9  0.00000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1888  hypothetical protein  30.73 
 
 
242 aa  68.9  0.00000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.169279  n/a   
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_16922  predicted protein  41.57 
 
 
235 aa  67.8  0.0000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2389  hypothetical protein  29.91 
 
 
235 aa  67  0.0000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.942806 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2584  hypothetical protein  29.05 
 
 
237 aa  64.3  0.000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1937  hypothetical protein  28.12 
 
 
236 aa  62.8  0.000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2180  hypothetical protein  28.17 
 
 
235 aa  62  0.000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.842277  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2191  hypothetical protein  28.57 
 
 
233 aa  60.1  0.00000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.604647  hitchhiker  0.000928347 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5224  putative integral membrane protein  29.95 
 
 
231 aa  57.8  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.083822 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1655  hypothetical protein  33.73 
 
 
222 aa  55.1  0.0000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0155493  normal  0.785043 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6431  hypothetical protein  29.26 
 
 
237 aa  54.7  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.219719  normal  0.0234014 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5199  hypothetical protein  27.75 
 
 
239 aa  53.9  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.413479 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1852  integral membrane protein  29.19 
 
 
241 aa  53.1  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.093294  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0799  hypothetical protein  29.12 
 
 
245 aa  52.4  0.000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.877443  hitchhiker  0.0000560766 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1897  integral membrane protein  25.41 
 
 
246 aa  51.6  0.000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000381976 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2150  integral membrane protein  26.89 
 
 
248 aa  48.9  0.00006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0294  hypothetical protein  25.13 
 
 
248 aa  47.4  0.0002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.448769  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0332  putative integral membrane protein  30.43 
 
 
238 aa  46.6  0.0003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1845  hypothetical protein  28.09 
 
 
252 aa  45.8  0.0005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0137661  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2159  hypothetical protein  31.87 
 
 
222 aa  45.1  0.0009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.972909  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0853  hypothetical protein  28.57 
 
 
247 aa  45.1  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1713  hypothetical protein  25.64 
 
 
232 aa  43.5  0.002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.265027  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5365  hypothetical protein  25.84 
 
 
219 aa  43.9  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>