18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_3056 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_3056  PGAP1 family protein  100 
 
 
487 aa  998    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0200  hypothetical protein  28.44 
 
 
1268 aa  138  3.0000000000000003e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.01392  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4676  hypothetical protein  29.12 
 
 
471 aa  102  2e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0108  hypothetical protein  28.22 
 
 
1878 aa  99.4  1e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0589  hypothetical protein  26.39 
 
 
1921 aa  93.6  7e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1230  hypothetical protein  27.97 
 
 
1831 aa  91.7  3e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1200  hypothetical protein  27.6 
 
 
2159 aa  79.3  0.0000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.932976 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1049  hypothetical protein  26.02 
 
 
1460 aa  75.5  0.000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.523001  normal  0.173427 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0101  hypothetical protein  28.98 
 
 
1937 aa  60.5  0.00000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.485173 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3618  hypothetical protein  30.73 
 
 
1805 aa  58.2  0.0000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.461669  hitchhiker  0.00340564 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1159  hypothetical protein  27.27 
 
 
254 aa  48.9  0.0002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0258  phospholipase  30.89 
 
 
474 aa  48.1  0.0004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.124755  normal  0.562583 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1164  hypothetical protein  28.77 
 
 
254 aa  47.4  0.0005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0332  PGAP1-like  23.05 
 
 
487 aa  45.4  0.002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0873  esterase/lipase/thioesterase family protein  25.89 
 
 
273 aa  45.4  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00991005  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3773  PGAP1 family protein  25.78 
 
 
393 aa  45.1  0.003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.117367  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0189  PGAP1 family protein  23.08 
 
 
784 aa  43.9  0.007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4872  hypothetical protein  37.68 
 
 
344 aa  43.9  0.007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0644082  normal  0.0526328 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>