14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_0258 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008709  Ping_0258  phospholipase  100 
 
 
474 aa  983    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.124755  normal  0.562583 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1568  phospholipase  44.89 
 
 
474 aa  401  9.999999999999999e-111  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1422  phospholipase  44.47 
 
 
474 aa  400  9.999999999999999e-111  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3314  phospholipase  43.71 
 
 
449 aa  379  1e-104  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0316  phospholipase  44.19 
 
 
447 aa  346  4e-94  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.86661  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0271  phospholipase  42.06 
 
 
449 aa  345  7e-94  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.447815  hitchhiker  0.0000326013 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0751  hypothetical protein  26.04 
 
 
492 aa  108  1e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.870291 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2232  hypothetical protein  28.93 
 
 
443 aa  102  1e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26190  hypothetical protein  30.09 
 
 
443 aa  99.4  1e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.701455 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3837  hypothetical protein  25.61 
 
 
455 aa  82.4  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3056  PGAP1 family protein  30.89 
 
 
487 aa  48.1  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3354  acetyltransferases and hydrolases with the alpha/beta hydrolase fold-like  29.53 
 
 
241 aa  47  0.0008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1159  hypothetical protein  50 
 
 
254 aa  43.9  0.006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1164  hypothetical protein  50 
 
 
254 aa  43.9  0.007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>