29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_4872 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_4872  hypothetical protein  100 
 
 
344 aa  697    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0644082  normal  0.0526328 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1557  hypothetical protein  78.47 
 
 
343 aa  540  9.999999999999999e-153  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0943658 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4553  hypothetical protein  50.66 
 
 
371 aa  276  4e-73  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4226  lipase class 2  34.48 
 
 
342 aa  46.2  0.0007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.522667  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0639  lipase  35.21 
 
 
364 aa  46.2  0.0008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.267456  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3809  triacylglycerol lipase  35.71 
 
 
364 aa  46.2  0.0009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.474224  normal  0.903187 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3612  triacylglycerol lipase  35.71 
 
 
364 aa  45.4  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3293  triacylglycerol lipase  35.71 
 
 
364 aa  45.8  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.435156 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2505  lipase  28.46 
 
 
360 aa  44.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5359  lipase  27.27 
 
 
309 aa  45.1  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0298655  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2366  lipase  28.46 
 
 
360 aa  44.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1807  lipase precursor  28.46 
 
 
341 aa  45.1  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0820  lipase precursor  28.46 
 
 
364 aa  45.1  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.3583  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3915  triacylglycerol lipase  35.71 
 
 
364 aa  45.4  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.531822  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4451  triacylglycerol lipase  35.71 
 
 
364 aa  45.4  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC01450  triacylglycerol lipase, putative  39.24 
 
 
561 aa  44.3  0.003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.686849  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0359  hypothetical protein  47.62 
 
 
342 aa  44.7  0.003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0498932 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3056  PGAP1 family protein  37.68 
 
 
487 aa  43.9  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3594  PGAP1 family protein  33.33 
 
 
449 aa  43.9  0.004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2173  triacylglycerol lipase  34.29 
 
 
364 aa  43.5  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0162824  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0462  alpha/beta hydrolase fold  35.14 
 
 
377 aa  43.9  0.005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.030432  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0739  Triacylglycerol lipase  36.36 
 
 
332 aa  43.1  0.006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.946355 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4668  triacylglycerol lipase  32.86 
 
 
364 aa  43.1  0.007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.184422  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4221  putative lipase transmembrane protein  31 
 
 
304 aa  43.1  0.007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.617519  normal  0.95925 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0332  PGAP1-like  27.1 
 
 
487 aa  42.7  0.008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0809  Triacylglycerol lipase  36.36 
 
 
332 aa  43.1  0.008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0610177  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63620  lipase LipC  25.58 
 
 
309 aa  42.7  0.008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_78871  predicted protein  38.57 
 
 
114 aa  42.7  0.009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.956921 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3161  lipase, class 2  31.58 
 
 
281 aa  42.7  0.01  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0217102 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>