More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HS_0253 on replicon NC_008309
Organism: Haemophilus somnus 129PT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008309  HS_0253  arginine transporter permease subunit ArtQ  100 
 
 
223 aa  448  1e-125  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00505088  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1022  arginine transporter permease subunit ArtQ  54.7 
 
 
238 aa  248  4e-65  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.563398 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2469  arginine transporter permease subunit ArtQ  54.7 
 
 
238 aa  248  5e-65  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.391563  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00867  arginine transporter subunit  54.7 
 
 
238 aa  248  7e-65  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.202852  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2780  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  54.7 
 
 
238 aa  248  7e-65  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00967955  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0890  arginine transporter permease subunit ArtQ  54.7 
 
 
238 aa  248  7e-65  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.125832  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0935  arginine transporter permease subunit ArtQ  54.7 
 
 
238 aa  248  7e-65  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2734  arginine transporter permease subunit ArtQ  54.7 
 
 
238 aa  248  7e-65  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0586836  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0966  arginine transporter permease subunit ArtQ  54.7 
 
 
238 aa  248  7e-65  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00873  hypothetical protein  54.7 
 
 
238 aa  248  7e-65  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.202246  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0993  arginine transporter permease subunit ArtQ  53.16 
 
 
238 aa  242  3e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.908225  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1043  arginine transporter permease subunit ArtQ  53.16 
 
 
238 aa  242  3e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.163661  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0961  arginine transporter permease subunit ArtQ  53.16 
 
 
238 aa  242  3e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1024  arginine transporter permease subunit ArtQ  53.16 
 
 
238 aa  242  3e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0926  arginine transporter permease subunit ArtQ  53.16 
 
 
238 aa  242  3e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.412131  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1378  arginine transporter permease subunit ArtQ  52.99 
 
 
238 aa  241  5e-63  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1654  arginine transporter permease subunit ArtQ  53.71 
 
 
246 aa  238  5.999999999999999e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.571683 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2627  arginine transporter permease subunit ArtQ  51.9 
 
 
238 aa  235  5.0000000000000005e-61  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.204375  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1581  arginine transporter permease subunit ArtQ  51.9 
 
 
238 aa  235  5.0000000000000005e-61  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2712  arginine transporter permease subunit ArtQ  51.9 
 
 
238 aa  235  5.0000000000000005e-61  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1700  arginine transporter permease subunit ArtQ  54.47 
 
 
238 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0374298  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1966  arginine transporter permease subunit ArtQ  52.97 
 
 
238 aa  228  5e-59  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.681186  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2378  arginine transporter permease subunit ArtQ  54.47 
 
 
238 aa  217  1e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.677527  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001574  arginine ABC transporter permease protein ArtQ  52.22 
 
 
229 aa  216  2e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.552599  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05530  arginine transporter permease subunit ArtQ  52.22 
 
 
229 aa  216  2e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2278  arginine transporter permease subunit ArtQ  54.66 
 
 
238 aa  214  9e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0699  arginine transporter permease subunit ArtQ  54.8 
 
 
229 aa  204  7e-52  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.127181  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0592  arginine ABC transporter, permease protein  43.26 
 
 
221 aa  186  3e-46  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0258675  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1593  arginine transport system permease protein  43.26 
 
 
221 aa  186  3e-46  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.216044  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0325  arginine ABC transporter, permease protein  44.54 
 
 
231 aa  175  4e-43  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1114  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  43.6 
 
 
229 aa  174  9.999999999999999e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.384644  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0310  amino acid ABC transporter permease  43.53 
 
 
231 aa  162  3e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000193986  normal  0.741245 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2236  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  42.44 
 
 
240 aa  157  2e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4137  amino acid ABC transporter, permease protein  38.46 
 
 
237 aa  155  6e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2290  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  38.86 
 
 
268 aa  155  6e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.142141  normal  0.98078 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3875  amino acid ABC transporter permease  39.72 
 
 
242 aa  154  9e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.426238 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2057  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  38.86 
 
 
268 aa  154  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.28022  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1589  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  38.86 
 
 
267 aa  154  1e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0953  amino acid ABC transporter, permease protein  41.46 
 
 
240 aa  152  4e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.578847  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0325  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  37.85 
 
 
216 aa  152  5e-36  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0343  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  37.38 
 
 
216 aa  151  5.9999999999999996e-36  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1563  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  40.38 
 
 
237 aa  151  8e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.086799  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0297  ABC basic amino acid transporter, inner membrane subunit  39.91 
 
 
244 aa  149  2e-35  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2073  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  39.91 
 
 
246 aa  149  3e-35  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4271  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  39.19 
 
 
231 aa  149  4e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000000112521 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4913  amino acid ABC transporter permease  42.13 
 
 
231 aa  148  7e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1209  amino acid ABC transporter permease  40.93 
 
 
242 aa  148  8e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.638371 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0328  amino acid ABC transporter permease  39.45 
 
 
244 aa  148  8e-35  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5892  ABC transporter permease  41.23 
 
 
231 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.311155  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4929  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  46.02 
 
 
231 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0205937  hitchhiker  0.0000000789331 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2252  amino acid ABC transporter permease  40.54 
 
 
232 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68080  ABC transporter permease  41.23 
 
 
231 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.382503  normal  0.0204508 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0281  polar amino acid ABC transporter inner membrane subunit  43.04 
 
 
230 aa  146  3e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0627068  hitchhiker  0.000164452 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0304  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  45.98 
 
 
230 aa  145  3e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0016104  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0299  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  45.98 
 
 
230 aa  145  3e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0837568  normal  0.0626241 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2065  ABC transporter membrane spanning protein (amino acid)  37.75 
 
 
267 aa  145  6e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5359  amino acid ABC transporter, permease protein  40.89 
 
 
231 aa  144  1e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2560  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  36 
 
 
230 aa  142  5e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.645171  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0597  amino acid ABC transporter, permease protein  41.67 
 
 
240 aa  141  9.999999999999999e-33  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0884053  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4840  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  34.56 
 
 
225 aa  139  3e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.545995  normal  0.251621 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4285  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  34.56 
 
 
225 aa  138  7e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0276895  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2915  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  39.43 
 
 
229 aa  137  1e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.149871 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3570  amino acid ABC transporter permease  35.98 
 
 
229 aa  136  2e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.906452  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003971  arginine/ornithine ABC transporter permease protein AotQ  35.19 
 
 
246 aa  136  3.0000000000000003e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1827  arginine/ornithine ABC transporter, permease protein  35.98 
 
 
229 aa  135  4e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.883387  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6801  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  34.56 
 
 
225 aa  135  4e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.793236  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2809  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  38.32 
 
 
239 aa  134  8e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.309944  normal  0.926456 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4291  amino acid ABC transporter permease  35.05 
 
 
229 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01551  ABC transporter permease protein  34.47 
 
 
246 aa  134  1.9999999999999998e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3594  polar amino acid ABC transporter inner membrane subunit  37.21 
 
 
239 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2322  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  37.21 
 
 
239 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.893058  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2178  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  37.21 
 
 
239 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.142027  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0336  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  36.44 
 
 
234 aa  131  7.999999999999999e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1093  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  35.62 
 
 
229 aa  131  9e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.436853  normal  0.0653327 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1045  polar amino acid ABC transporter inner membrane subunit  35.07 
 
 
216 aa  130  1.0000000000000001e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1923  amino acid ABC transporter permease/periplasmic protein  31.68 
 
 
714 aa  131  1.0000000000000001e-29  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.132292  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5843  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  37.5 
 
 
223 aa  130  2.0000000000000002e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1959  arginine/ornithine periplasmic binding protein-dependent transporter, inner membrane component  33.62 
 
 
246 aa  130  2.0000000000000002e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.450154  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2567  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  32.16 
 
 
229 aa  129  5.0000000000000004e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.386415  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0469  ectoine/hydroxyectoine ABC transporter, permease protein EhuC  32.86 
 
 
216 aa  129  5.0000000000000004e-29  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3886  amino acid ABC transporter permease  33.49 
 
 
501 aa  128  6e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1054  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  33.49 
 
 
253 aa  128  6e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.712414  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1057  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  33.49 
 
 
229 aa  128  7.000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3132  amino acid ABC transporter permease  35.51 
 
 
222 aa  128  7.000000000000001e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.9281  normal  0.0247415 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2880  arginine/ornithine transport system permease protein  40.48 
 
 
229 aa  128  7.000000000000001e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0976589  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2129  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  33.02 
 
 
260 aa  128  7.000000000000001e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.356557  normal  0.354244 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4287  ABC polar amino acid transporter, inner membrane subunit  32.13 
 
 
229 aa  128  8.000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0716  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  34.6 
 
 
216 aa  128  9.000000000000001e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.267737  normal  0.0337978 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3774  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  33.79 
 
 
229 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.134573  hitchhiker  0.00153221 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2853  histidine transport system permease protein  32.56 
 
 
229 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3990  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  34.25 
 
 
229 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.456811 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2791  histidine ABC transporter, permease protein HisQ  32.56 
 
 
229 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.249098  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0696  amino acid ABC transporter permease  32.55 
 
 
229 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.156874  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1453  amino acid ABC transporter, permease protein  34.13 
 
 
260 aa  126  2.0000000000000002e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000402633  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2732  amino acid ABC transporter, permease protein  32.56 
 
 
229 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1175  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  32.55 
 
 
229 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0777  polar amino acid ABC transporter inner membrane protein  29.95 
 
 
218 aa  126  3e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.554294  normal  0.559459 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4485  polar amino acid ABC transporter inner membrane subunit  34.25 
 
 
229 aa  125  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5165  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  38.89 
 
 
232 aa  125  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1430  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  34.25 
 
 
229 aa  125  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0905208  normal  0.971438 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>