78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HMPREF0424_0646 on replicon NC_013721
Organism: Gardnerella vaginalis 409-05



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010816  BLD_0669  putative hydrolse  72.71 
 
 		 447 aa  655    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.272037  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0646  hydrolase, alpha/beta domain protein  100 
 
 		 460 aa  952    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.291247 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6521  alpha/beta hydrolase fold protein  45.52 
 
 		 432 aa  390  1e-107  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.17034 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06790  prolyl aminopeptidase 2  47.88 
 
 		 441 aa  382  1e-105  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4714  alpha/beta hydrolase fold protein  45.25 
 
 		 439 aa  355  1e-96  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4559  prolyl aminopeptidase 2  44.32 
 
 		 421 aa  353  2.9999999999999997e-96  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.371108  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2460  alpha/beta hydrolase fold  41.25 
 
 		 453 aa  348  1e-94  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7145  alpha/beta hydrolase fold protein  42.63 
 
 		 423 aa  331  2e-89  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.152071 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001130  putative prolyl aminopeptidase  38.53 
 
 		 431 aa  306  5.0000000000000004e-82  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.047339  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0134  alpha/beta hydrolase fold protein  43.34 
 
 		 420 aa  302  8.000000000000001e-81  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2021  putative proline iminopeptidase  40.95 
 
 		 419 aa  302  9e-81  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.198655 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2227  alpha/beta hydrolase fold  37.44 
 
 		 429 aa  286  5.999999999999999e-76  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3689  putative prolyl aminopeptidase  39.66 
 
 		 430 aa  283  4.0000000000000003e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.798401  normal  0.360636 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2735  alpha/beta hydrolase fold  36.38 
 
 		 429 aa  283  5.000000000000001e-75  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2828  alpha/beta hydrolase fold  36.38 
 
 		 429 aa  283  5.000000000000001e-75  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0236539 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3055  proline iminopeptidase  36.3 
 
 		 424 aa  283  6.000000000000001e-75  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2752  alpha/beta hydrolase fold  36.38 
 
 		 429 aa  282  7.000000000000001e-75  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1624  alpha/beta hydrolase fold protein  36.16 
 
 		 429 aa  281  2e-74  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.610603  normal  0.321544 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2270  alpha/beta hydrolase fold  36.38 
 
 		 429 aa  281  2e-74  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.201892 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1634  alpha/beta hydrolase fold  35.43 
 
 		 433 aa  277  2e-73  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.16021  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0398  alpha/beta hydrolase fold protein  41 
 
 		 428 aa  277  3e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.167053  normal  0.0238108 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2429  alpha/beta hydrolase fold  36.53 
 
 		 429 aa  277  3e-73  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1492  prolyl aminopeptidase 2  35.94 
 
 		 429 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2143  alpha/beta hydrolase fold  36.69 
 
 		 439 aa  274  3e-72  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.22944  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1410  alpha/beta hydrolase fold  37.67 
 
 		 454 aa  273  4.0000000000000004e-72  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1661  alpha/beta hydrolase fold  35.27 
 
 		 429 aa  269  7e-71  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.485679  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1434  prolyl aminopeptidase 2  35.49 
 
 		 429 aa  269  1e-70  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1499  prolyl aminopeptidase 2  35.27 
 
 		 429 aa  268  2e-70  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2072  alpha/beta hydrolase fold  37.7 
 
 		 463 aa  264  2e-69  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.612042  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3642  alpha/beta hydrolase fold protein  37.53 
 
 		 412 aa  264  3e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2955  alpha/beta hydrolase fold  34.89 
 
 		 431 aa  259  7e-68  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1813  alpha/beta hydrolase fold protein  37.47 
 
 		 439 aa  256  7e-67  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000430652 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3903  alpha/beta hydrolase fold  37.9 
 
 		 426 aa  250  3e-65  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0642789 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00350  prolyl aminopeptidase 2  35.08 
 
 		 443 aa  239  1e-61  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.358137 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05870  prolyl aminopeptidase 2  35.85 
 
 		 424 aa  238  2e-61  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.208476  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11240  hypothetical protein with alpha/beta hydrolase fold  36.63 
 
 		 488 aa  221  3e-56  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.163814  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02092  Putative prolyl aminopeptidase Fragment (EC 3.4.11.5) [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q96VT1]  34.96 
 
 		 443 aa  215  9.999999999999999e-55  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.707401  normal  1 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_33188  predicted protein  34.11 
 
 		 510 aa  209  6e-53  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.860325  normal  0.52884 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_48996  prolyl aminopeptidase  30 
 
 		 478 aa  172  1e-41  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.750097  normal  0.224061 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47448  predicted protein  30.67 
 
 		 692 aa  171  2e-41  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.445648  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1623  alpha/beta hydrolase fold  31.15 
 
 		 291 aa  52.8  0.00001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.538425  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2835  proline iminopeptidase  29.65 
 
 		 337 aa  51.6  0.00003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2487  Prolyl aminopeptidase  33.33 
 
 		 314 aa  51.6  0.00003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0653759 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2093  Prolyl aminopeptidase  31.91 
 
 		 314 aa  47.4  0.0005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0430181  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2262  proline iminopeptidase  28.48 
 
 		 335 aa  47.4  0.0005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.181325  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3126  hydrolase, alpha/beta fold family  27.35 
 
 		 301 aa  47  0.0006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.83373  normal  0.0124269 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2247  alpha/beta fold family hydrolase  28.33 
 
 		 291 aa  47  0.0008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0371226  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2776  proline iminopeptidase  29.84 
 
 		 313 aa  46.2  0.001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00879626  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4235  putative hydrolase, alpha/beta fold family  24.18 
 
 		 332 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1122  proline iminopeptidase  28.27 
 
 		 339 aa  45.1  0.002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.29642  normal  0.0858208 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4171  alpha/beta fold family hydrolase  24.18 
 
 		 332 aa  45.4  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2061  alpha/beta fold family hydrolase  28.95 
 
 		 301 aa  45.1  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3858  prolyl aminopeptidase  24.18 
 
 		 332 aa  45.4  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2245  hydrolase, alpha/beta fold family  28.95 
 
 		 301 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.1528899999999994e-27 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2199  hydrolase, alpha/beta fold family  28.21 
 
 		 291 aa  45.8  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.413884  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4916  proline iminopeptidase  30.61 
 
 		 312 aa  45.4  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2217  alpha/beta fold family hydrolase  28.95 
 
 		 303 aa  45.1  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.716655  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2042  alpha/beta hydrolase fold  27.35 
 
 		 291 aa  45.1  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1856  proline iminopeptidase  31.06 
 
 		 322 aa  45.4  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.455189  normal  0.0201858 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2838  proline iminopeptidase  33.91 
 
 		 321 aa  45.1  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00251437  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0279  hypothetical protein  28.57 
 
 		 324 aa  45.1  0.003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0626253  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2329  hydrolase, alpha/beta fold family  27.35 
 
 		 291 aa  45.1  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000968473  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2001  proline iminopeptidase  28.95 
 
 		 301 aa  45.1  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000475333  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4965  proline iminopeptidase  28.95 
 
 		 308 aa  44.3  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.328745  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0299  prolyl aminopeptidase  32.48 
 
 		 316 aa  44.3  0.004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4126  putative hydrolase, alpha/beta fold family  23.77 
 
 		 332 aa  44.3  0.005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00083972 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0076  TAP domain-containing protein  24.11 
 
 		 549 aa  43.9  0.005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4011  alpha/beta fold family hydrolase  23.77 
 
 		 332 aa  44.3  0.005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2074  proline iminopeptidase  25.81 
 
 		 323 aa  44.3  0.005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3844  prolyl aminopeptidase  23.77 
 
 		 332 aa  44.3  0.005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4324  alpha/beta fold family hydrolase  23.77 
 
 		 332 aa  44.3  0.005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0071  alpha/beta fold family hydrolase  25.31 
 
 		 539 aa  43.9  0.006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0894  proline iminopeptidase  33.04 
 
 		 311 aa  43.9  0.006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0057  TAP domain-containing protein  25.43 
 
 		 546 aa  43.9  0.006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1603  prolyl aminopeptidase  34.96 
 
 		 329 aa  43.5  0.007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0208  proline iminopeptidase  30.65 
 
 		 316 aa  43.9  0.007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2000  proline iminopeptidase  28.07 
 
 		 301 aa  43.5  0.008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.118293  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4278  TAP domain-containing protein  24.11 
 
 		 540 aa  43.1  0.01  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>