37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HMPREF0424_0313 on replicon NC_013721
Organism: Gardnerella vaginalis 409-05



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013721  HMPREF0424_0313  diphosphomevalonate decarboxylase  100 
 
 		 365 aa  752    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0381784 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0914  diphosphomevalonate decarboxylase  50 
 
 		 323 aa  233  4.0000000000000004e-60  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000162632  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0629  mevalonate diphosphate decarboxylase  43.91 
 
 		 327 aa  223  4.9999999999999996e-57  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0614  mevalonate diphosphate decarboxylase  43.91 
 
 		 327 aa  223  4.9999999999999996e-57  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1386  diphosphomevalonate decarboxylase  43.18 
 
 		 313 aa  213  3.9999999999999995e-54  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0239  mevalonate diphosphate decarboxylase  44.44 
 
 		 327 aa  207  2e-52  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1734  diphosphomevalonate decarboxylase  41 
 
 		 332 aa  197  3e-49  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0455  diphosphomevalonate decarboxylase  45.36 
 
 		 318 aa  191  2e-47  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0619  diphosphomevalonate decarboxylase  39.74 
 
 		 503 aa  187  3e-46  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0720  diphosphomevalonate decarboxylase/isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  39.07 
 
 		 503 aa  182  6e-45  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0013091  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1101  diphosphomevalonate decarboxylase  40.54 
 
 		 314 aa  181  1e-44  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.183579  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1034  mevalonate pyrophosphate decarboxylase  39.29 
 
 		 321 aa  175  9e-43  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1325  diphosphomevalonate decarboxylase  39.31 
 
 		 314 aa  157  4e-37  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.227256  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1123  diphosphomevalonate decarboxylase  34.84 
 
 		 295 aa  154  2e-36  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0599  mevalonate pyrophosphate decarboxylase  38.16 
 
 		 314 aa  151  2e-35  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3408  diphosphomevalonate decarboxylase  48.25 
 
 		 337 aa  149  1.0000000000000001e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0207925  normal  0.138111 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0783  diphosphomevalonate decarboxylase  36.03 
 
 		 325 aa  146  6e-34  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.424746  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL04950  diphosphomevalonate decarboxylase, putative  34.5 
 
 		 395 aa  137  2e-31  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1612  diphosphomevalonate decarboxylase  36.39 
 
 		 334 aa  136  5e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_90752  predicted protein  36.72 
 
 		 387 aa  132  7.999999999999999e-30  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0691  diphosphomevalonate decarboxylase  31.35 
 
 		 323 aa  125  2e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0953397  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0706  diphosphomevalonate decarboxylase  31.51 
 
 		 312 aa  120  3e-26  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04414  diphosphomevalonate decarboxylase (AFU_orthologue; AFUA_4G07130)  35.41 
 
 		 404 aa  117  3.9999999999999997e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00225214  normal  0.629565 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1576  diphosphomevalonate decarboxylase  34.09 
 
 		 323 aa  110  3e-23  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00467699 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2023  hypothetical protein  33.22 
 
 		 315 aa  102  1e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2018  hypothetical protein  33.22 
 
 		 315 aa  100  4e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2128  diphosphomevalonate decarboxylase  30.25 
 
 		 323 aa  98.6  1e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.706663  normal  0.846308 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0497  GHMP kinase  29.21 
 
 		 342 aa  94  4e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.0000421791  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04605  hypothetical protein  28.61 
 
 		 360 aa  88.6  2e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3390  GHMP kinase domain-containing protein  30.19 
 
 		 389 aa  86.3  8e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.199824  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1389  GHMP kinase  23.81 
 
 		 368 aa  83.6  0.000000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.385425  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1434  GHMP kinase  29.45 
 
 		 332 aa  80.9  0.00000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1087  diphosphomevalonate decarboxylase  30.56 
 
 		 327 aa  80.5  0.00000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3235  GHMP kinase  28.76 
 
 		 327 aa  68.9  0.0000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4285  GHMP kinase C terminal domain-containing protein  25.59 
 
 		 376 aa  62.4  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0398897  normal  0.0848141 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0936  GHMP kinase domain-containing protein  28.28 
 
 		 402 aa  60.5  0.00000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.579277  normal  0.1124 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0374  GHMP kinase  25.4 
 
 		 343 aa  43.5  0.006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.638274  normal  0.807327 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>