48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_3627 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_0398  hypothetical protein  62.17 
 
 		 807 aa  1039    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.513046 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3627  hypothetical protein  100 
 
 		 835 aa  1714    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0816  hypothetical protein  23.87 
 
 		 810 aa  149  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2959  putative outer membrane protein precursor  23.39 
 
 		 830 aa  149  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1523  outer membrane protein precursor MtrB  24 
 
 		 703 aa  123  1.9999999999999998e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.415633  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3127  outer membrane protein precursor MtrB  24 
 
 		 698 aa  121  6e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000335103 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2700  outer membrane protein precursor MtrB  22.96 
 
 		 699 aa  121  6e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.140373  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2527  outer membrane protein precursor MtrB  23.77 
 
 		 699 aa  118  5e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2580  outer membrane protein precursor MtrB  22.97 
 
 		 695 aa  96.3  2e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0892811  normal  0.0284758 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2512  outer membrane protein precursor MtrB  22.97 
 
 		 695 aa  95.9  3e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.481344  hitchhiker  0.00380912 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1206  outer membrane protein precursor MtrB  21.42 
 
 		 693 aa  94.7  6e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00712734  normal  0.823248 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2678  outer membrane protein precursor MtrB  22.66 
 
 		 695 aa  93.2  2e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0120666 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1476  outer membrane protein precursor MtrB  23.3 
 
 		 704 aa  92.4  3e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0583388  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2767  outer membrane protein precursor MtrB  22.24 
 
 		 695 aa  92.8  3e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.38459  decreased coverage  0.0000000195366 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1610  outer membrane protein precursor MtrB  22.09 
 
 		 695 aa  92  4e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.170793 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1576  outer membrane protein precursor MtrB  22.09 
 
 		 695 aa  91.7  5e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0247408  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1587  outer membrane protein precursor MtrB  22.09 
 
 		 695 aa  91.7  6e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.14869  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2639  outer membrane protein precursor MtrB  22.12 
 
 		 695 aa  90.9  1e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.381518  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1776  outer membrane protein precursor MtrB  22.96 
 
 		 697 aa  87.8  8e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1403  hypothetical protein  22.22 
 
 		 772 aa  80.5  0.0000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.142579  normal  0.0825928 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2693  outer membrane protein, putative  24.32 
 
 		 706 aa  74.3  0.000000000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2819  outer membrane protein  21.47 
 
 		 674 aa  70.5  0.0000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.216315  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1529  outer membrane protein, putative  21.61 
 
 		 711 aa  70.5  0.0000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3685  outer membrane protein  21.05 
 
 		 669 aa  70.1  0.0000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2150  outer membrane protein  22.02 
 
 		 669 aa  69.3  0.0000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0260254  normal  0.662224 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0228  outer membrane protein  20.31 
 
 		 669 aa  66.6  0.000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2520  outer membrane protein, putative  21.17 
 
 		 703 aa  63.2  0.00000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.383126  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0232  outer membrane protein  20.96 
 
 		 668 aa  61.6  0.00000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0626  outer membrane protein  20.18 
 
 		 662 aa  61.6  0.00000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1403  outer membrane protein  20.03 
 
 		 668 aa  61.2  0.00000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2380  hypothetical protein  20.6 
 
 		 681 aa  61.2  0.00000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.573716  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0351  outer membrane protein  20.53 
 
 		 668 aa  61.2  0.00000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.132929 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3129  outer membrane protein  20.2 
 
 		 668 aa  60.8  0.0000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1428  outer membrane protein  21.01 
 
 		 662 aa  58.5  0.0000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1592  outer membrane protein, putative  21.53 
 
 		 716 aa  58.2  0.0000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000338536  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2507  outer membrane protein, putative  21 
 
 		 712 aa  57.4  0.000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0767045  decreased coverage  0.000584641 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1781  outer membrane protein, putative  21.2 
 
 		 712 aa  56.2  0.000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2229  outer membrane protein  19.41 
 
 		 667 aa  55.5  0.000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00516967  hitchhiker  0.0011455 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1581  outer membrane protein, putative  21.01 
 
 		 716 aa  55.5  0.000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0408477  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2762  outer membrane protein, putative  20.83 
 
 		 716 aa  55.1  0.000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00885909  hitchhiker  0.000163865 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2924  outer membrane protein  20.04 
 
 		 672 aa  53.5  0.00001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2575  outer membrane protein, putative  20.48 
 
 		 712 aa  53.9  0.00001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.382223  normal  0.0100753 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0267  outer membrane protein  19.72 
 
 		 667 aa  53.5  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1615  outer membrane protein, putative  20.55 
 
 		 716 aa  53.1  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.208848  normal  0.197166 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2673  outer membrane protein, putative  20.34 
 
 		 712 aa  51.6  0.00005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.335311  normal  0.0727867 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4081  hypothetical protein  25.48 
 
 		 706 aa  50.4  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0596135  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3676  outer membrane protein  19.26 
 
 		 667 aa  50.4  0.0001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1306  outer membrane protein  20 
 
 		 672 aa  45.1  0.006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000179151 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>