48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_2861 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_2861  dTDP-4-dehydrorhamnose 3 5-epimerase and related enzymes-like protein  100 
 
 		 162 aa  334  2.9999999999999997e-91  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000254374  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0925  hypothetical protein  77.78 
 
 		 162 aa  274  3e-73  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.540819  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2082  hypothetical protein  75.31 
 
 		 162 aa  270  7e-72  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2463  dTDP-4-dehydrorhamnose 3 5-epimerase and related enzymes-like protein  72.84 
 
 		 162 aa  270  8.000000000000001e-72  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0126691  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1754  dTDP-4-dehydrorhamnose 3 5-epimerase and related enzymes-like protein  72.84 
 
 		 162 aa  269  1e-71  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1352  dTDP-4-dehydrorhamnose 3 5-epimerase and related enzymes-like protein  54.43 
 
 		 157 aa  185  2e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2403  dTDP-4-dehydrorhamnose 3,5 epimerase  35.88 
 
 		 158 aa  82  0.000000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.930193  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1887  dTDP-4-dehydrorhamnose 3,5-epimerase  36.88 
 
 		 181 aa  81.6  0.000000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.394283  normal  0.415914 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2142  dTDP-4-dehydrorhamnose 3,5-epimerase  38.03 
 
 		 155 aa  79  0.00000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0185  dTDP-4-dehydrorhamnose 3,5-epimerase  36.64 
 
 		 158 aa  75.9  0.0000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0259  dTDP-4-dehydrorhamnose 3,5-epimerase  36.92 
 
 		 153 aa  73.9  0.0000000000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1213  dTDP-4-dehydrorhamnose 3,5-epimerase and related enzyme  35.46 
 
 		 154 aa  72.4  0.000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0165  dTDP-4-dehydrorhamnose 3,5-epimerase related  33.09 
 
 		 151 aa  69.3  0.00000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0055  dTDP-4-dehydrorhamnose 35-epimerase related  34.09 
 
 		 153 aa  67.8  0.00000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4813  dTDP-4-dehydrorhamnose 3,5-epimerase  31.06 
 
 		 173 aa  57  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.841507  normal  0.227045 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0476  dTDP-4-dehydrorhamnose 3,5-epimerase  30.77 
 
 		 187 aa  56.2  0.0000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.0000000424629  decreased coverage  0.00000000283912 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3931  dTDP-4-dehydrorhamnose 3,5-epimerase  33.33 
 
 		 177 aa  56.2  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1473  dTDP-4-dehydrorhamnose 3,5-epimerase  29.55 
 
 		 188 aa  51.2  0.000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0401457  normal  0.0920932 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0540  dTDP-4-dehydrorhamnose 35-epimerase related  30.97 
 
 		 180 aa  49.7  0.00002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2752  dTDP-4-dehydrorhamnose 35-epimerase related protein  30.77 
 
 		 176 aa  49.3  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.711856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0256  dTDP-4-dehydrorhamnose 3,5-epimerase  31.36 
 
 		 184 aa  49.3  0.00003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.116618  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1258  dTDP-4-dehydrorhamnose epimerase  26.39 
 
 		 158 aa  48.1  0.00005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4942  dTDP-4-dehydrorhamnose 3,5-epimerase  25.93 
 
 		 190 aa  46.2  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.384259 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3351  dTDP-4-dehydrorhamnose 3,5-epimerase  35.45 
 
 		 184 aa  45.8  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.311899  normal  0.696161 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1712  dTDP-4-dehydrorhamnose 3,5-epimerase  28.46 
 
 		 190 aa  46.2  0.0002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2215  dTDP-4-dehydrorhamnose 3,5-epimerase  27.91 
 
 		 181 aa  46.2  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00989  dTDP-4-keto-6-deoxy-D-glucose-3,6-epimerase  31.67 
 
 		 181 aa  45.8  0.0003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2730  dTDP-4-dehydrorhamnose 3,5-epimerase  25.58 
 
 		 176 aa  45.1  0.0004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.305906  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0280  dTDP-4-dehydrorhamnose 3,5-epimerase  26.4 
 
 		 186 aa  44.3  0.0006  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2506  dTDP-4-dehydrorhamnose 3,5-epimerase  25.2 
 
 		 177 aa  43.9  0.001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1539  dTDP-4-dehydrorhamnose 3,5-epimerase  27.52 
 
 		 190 aa  43.9  0.001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.731559  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2380  dTDP-4-dehydrorhamnose 3,5-epimerase  29.1 
 
 		 183 aa  43.5  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00387358 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1571  dTDP-4-dehydrorhamnose 3,5-epimerase  27.52 
 
 		 190 aa  43.5  0.001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2863  hypothetical protein  30.28 
 
 		 134 aa  42.7  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.949512  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2660  dTDP-4-dehydrorhamnose 3,5-epimerase  32.48 
 
 		 179 aa  42.7  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4334  dTDP-4-dehydrorhamnose 3,5-epimerase  28.12 
 
 		 184 aa  42.7  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.412859  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5506  dTDP-4-dehydrorhamnose 3,5-epimerase  31.78 
 
 		 184 aa  41.6  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2233  dTDP-4-dehydrorhamnose 3,5-epimerase  29.51 
 
 		 183 aa  41.6  0.004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1113  dTDP-4-dehydrorhamnose 3,5-epimerase  26.32 
 
 		 189 aa  42  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.272315 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2317  dTDP-4-dehydrorhamnose 3,5-epimerase  32.67 
 
 		 183 aa  41.6  0.005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.10741 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2030  dTDP-4-dehydrorhamnose 3 5-epimerase  31.51 
 
 		 137 aa  41.6  0.005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0880  dTDP-4-dehydrorhamnose 3,5-epimerase  31.68 
 
 		 183 aa  40.8  0.007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0955  dTDP-4-dehydrorhamnose 3,5-epimerase  32 
 
 		 187 aa  41.2  0.007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.263275  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5835  dTDP-4-dehydrorhamnose 3,5-epimerase  26.95 
 
 		 184 aa  40.8  0.008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.451696  normal  0.135664 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3012  dTDP-4-dehydrorhamnose 3,5-epimerase  31.67 
 
 		 181 aa  40.8  0.008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.481041  hitchhiker  0.00156221 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0280  dTDP-4-dehydrorhamnose 3,5-epimerase  28.32 
 
 		 181 aa  40.8  0.009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4004  dTDP-4-dehydrorhamnose 3,5-epimerase  30.17 
 
 		 184 aa  40.4  0.01  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.12316  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2669  dTDP-4-dehydrorhamnose 3,5-epimerase  30.17 
 
 		 183 aa  40.4  0.01  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.492793  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>