263 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_2200 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU1622  L-lactate permease  84.13 
 
 		 649 aa  1106    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.707301  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2200  L-lactate transport  100 
 
 		 649 aa  1300    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000021935  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0154  L-lactate transport  100 
 
 		 649 aa  1300    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00155991  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1316  L-lactate transport  75.19 
 
 		 649 aa  926    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.2669e-18 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2909  L-lactate transport  76.27 
 
 		 649 aa  928    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2735  L-lactate transport  74.5 
 
 		 648 aa  972    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000895009  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0394  L-lactate transport  56.1 
 
 		 558 aa  371  1e-101  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2303  L-lactate transport  54.39 
 
 		 592 aa  368  1e-100  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.922577  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0564  L-lactate transport  54.39 
 
 		 575 aa  367  1e-100  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.374965  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3408  L-lactate transport  50.14 
 
 		 552 aa  360  5e-98  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.432982  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1276  L-lactate transport  55.52 
 
 		 557 aa  353  4e-96  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0106  L-lactate transport  53.78 
 
 		 543 aa  353  5e-96  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.636834  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2129  L-lactate transport  54.91 
 
 		 551 aa  349  8e-95  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3406  L-lactate transport  52.82 
 
 		 554 aa  349  1e-94  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000381383  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2170  L-lactate transport  52.6 
 
 		 545 aa  340  5.9999999999999996e-92  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.882764  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2190  L-lactate transport  48.58 
 
 		 576 aa  330  6e-89  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.330322  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0827  L-lactate permease  46.54 
 
 		 545 aa  325  2e-87  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1409  L-lactate permease  48.71 
 
 		 547 aa  324  4e-87  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.281484  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4693  L-lactate transport  46.94 
 
 		 589 aa  320  6e-86  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.880222  normal  0.0242756 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1728  L-lactate transporter  46.65 
 
 		 586 aa  318  2e-85  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.81819 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1121  L-lactate transport  49.54 
 
 		 545 aa  317  4e-85  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.155911 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1438  L-lactate transport  46.45 
 
 		 556 aa  314  2.9999999999999996e-84  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43070  L-lactate permease  45.83 
 
 		 562 aa  313  7.999999999999999e-84  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.357177  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0710  L-lactate permease  46.26 
 
 		 557 aa  310  6.999999999999999e-83  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63080  L-lactate permease  45.81 
 
 		 560 aa  310  6.999999999999999e-83  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0133297  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0720  L-lactate permease  46.26 
 
 		 557 aa  309  8e-83  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5490  L-lactate permease  47.04 
 
 		 557 aa  309  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0696  L-lactate transport  45.89 
 
 		 556 aa  308  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.91775  hitchhiker  0.00000653044 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02843  glycolate transporter  48.19 
 
 		 560 aa  306  6e-82  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0149329  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3252  glycolate transporter  48.19 
 
 		 560 aa  306  6e-82  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02793  hypothetical protein  48.19 
 
 		 560 aa  306  6e-82  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0141341  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3434  glycolate transporter  48.19 
 
 		 560 aa  306  6e-82  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3147  glycolate transporter  48.19 
 
 		 560 aa  306  6e-82  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0726  glycolate transporter  48.19 
 
 		 560 aa  306  6e-82  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4736  L-lactate transport  45.33 
 
 		 556 aa  306  8.000000000000001e-82  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2301  L-lactate transport  45.43 
 
 		 561 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.422272  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4735  L-lactate transport  45.35 
 
 		 556 aa  305  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.168353  hitchhiker  0.00377155 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4601  L-lactate transport  45.35 
 
 		 556 aa  305  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0523719  normal  0.0421821 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0722  L-lactate transport  47.59 
 
 		 560 aa  303  5.000000000000001e-81  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3472  L-lactate transport  46.44 
 
 		 552 aa  303  5.000000000000001e-81  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0353521  normal  0.697356 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0132  L-lactate permease  44.29 
 
 		 551 aa  301  2e-80  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43260  L-lactate permease, Lldp  45.4 
 
 		 561 aa  301  3e-80  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0650163  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3909  L-lactate permease  46.6 
 
 		 551 aa  301  3e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1762  L-lactate permease  44.83 
 
 		 578 aa  299  1e-79  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.68133  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3893  L-lactate permease  46.3 
 
 		 551 aa  299  1e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0753  L-lactate permease  45.58 
 
 		 564 aa  298  2e-79  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.226744 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3971  L-lactate permease  45.99 
 
 		 551 aa  298  2e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.737729 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4016  L-lactate permease  45.99 
 
 		 551 aa  298  2e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4078  L-lactate permease  45.99 
 
 		 551 aa  298  2e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2362  L-lactate transport  45.45 
 
 		 552 aa  297  3e-79  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03461  L-lactate permease  44.29 
 
 		 551 aa  297  5e-79  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0102  L-lactate transport  44.29 
 
 		 551 aa  297  5e-79  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4976  L-lactate permease  44.29 
 
 		 551 aa  297  5e-79  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4029  L-lactate permease  44.29 
 
 		 551 aa  297  5e-79  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03412  hypothetical protein  44.29 
 
 		 551 aa  297  5e-79  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3815  L-lactate permease  44.29 
 
 		 551 aa  297  5e-79  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3940  L-lactate permease  44.29 
 
 		 551 aa  297  5e-79  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0105  L-lactate permease  44.29 
 
 		 551 aa  297  5e-79  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4107  L-lactate permease  44.29 
 
 		 551 aa  297  5e-79  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4350  L-lactate transport  45.45 
 
 		 561 aa  296  6e-79  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.807127  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0837  L-lactate transport  44.94 
 
 		 558 aa  296  1e-78  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.308909  normal  0.463704 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3412  L-lactate transport  45.17 
 
 		 553 aa  295  2e-78  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.190436  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2544  L-lactate transport  47.11 
 
 		 555 aa  295  2e-78  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.658416  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5295  L-lactate transport  47.18 
 
 		 552 aa  295  2e-78  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4723  L-lactate transport  46.02 
 
 		 553 aa  295  2e-78  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3172  L-lactate transport  48.66 
 
 		 557 aa  294  3e-78  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3064  L-lactate transport  48.37 
 
 		 557 aa  294  3e-78  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0640601  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4067  L-lactate transport  44.89 
 
 		 553 aa  294  4e-78  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5342  L-lactate permease  45.01 
 
 		 552 aa  292  1e-77  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000594028  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6084  L-lactate transporter  43.33 
 
 		 570 aa  291  2e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.592385  normal  0.721141 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3344  L-lactate permease  43.82 
 
 		 560 aa  291  3e-77  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.542026  normal  0.656646 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5610  L-lactate permease  44.44 
 
 		 553 aa  290  8e-77  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000380023  hitchhiker  2.4648700000000003e-18 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5796  L-lactate transport  45.61 
 
 		 553 aa  289  1e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.325715 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5400  L-lactate permease  44.44 
 
 		 552 aa  289  1e-76  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000507113  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5445  L-lactate permease  42.34 
 
 		 569 aa  289  1e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.654018  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0087  L-lactate permease  44.71 
 
 		 560 aa  289  1e-76  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2077  lactate permease family protein  46.18 
 
 		 573 aa  289  1e-76  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.407091  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2673  L-lactate transport  43.84 
 
 		 566 aa  288  2e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.750265  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0072  L-lactate permease  44.11 
 
 		 565 aa  288  2.9999999999999996e-76  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5019  L-lactate transport  43.89 
 
 		 553 aa  287  2.9999999999999996e-76  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000505988  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1428  lactate permease family protein  45.14 
 
 		 572 aa  287  4e-76  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1876  glycolate permease  45.14 
 
 		 572 aa  287  4e-76  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0870  lactate permease (LctP) family protein  45.14 
 
 		 572 aa  287  4e-76  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.323613  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0113  L-lactate permease  44.11 
 
 		 560 aa  287  4e-76  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.610577  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2185  lactate permease (LctP) family protein  45.14 
 
 		 572 aa  287  4e-76  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.477622  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0461  lactate permease (LctP) family protein  45.14 
 
 		 572 aa  287  4e-76  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0433195  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2806  L-lactate transport  43.56 
 
 		 566 aa  286  8e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5077  L-lactate permease  44.17 
 
 		 552 aa  286  9e-76  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000746346  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4909  L-lactate permease  44.17 
 
 		 552 aa  286  9e-76  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000494573  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4924  L-lactate permease  44.17 
 
 		 552 aa  286  9e-76  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000193163  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5464  L-lactate permease  44.17 
 
 		 552 aa  286  9e-76  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000341601  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5317  L-lactate permease  44.17 
 
 		 552 aa  286  9e-76  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.99986e-40 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0558  glycolate permease GlcA  45.14 
 
 		 572 aa  286  1.0000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5349  L-lactate permease  44.17 
 
 		 553 aa  285  2.0000000000000002e-75  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000100445  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3763  L-lactate permease  43.61 
 
 		 553 aa  284  3.0000000000000004e-75  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0623058  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2974  L-lactate transporter  47.34 
 
 		 558 aa  284  5.000000000000001e-75  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.838258  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0908  L-lactate transport  44.38 
 
 		 558 aa  281  4e-74  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00938786  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5375  L-lactate transport  43.75 
 
 		 569 aa  280  8e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.715865  normal  0.520281 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5896  glycolate transporter  44.24 
 
 		 566 aa  279  9e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0963775  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2353  L-lactate permease  43.2 
 
 		 558 aa  273  5.000000000000001e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>