142 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_0593 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_0959  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  53.73 
 
 
1039 aa  1071    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.524193  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0593  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  100 
 
 
1073 aa  2232    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4904  N4/N6-methyltransferase family protein  50.47 
 
 
1040 aa  1036    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.658462  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2068  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  39.75 
 
 
999 aa  714    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1539  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  37.48 
 
 
1077 aa  627  1e-178  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.648492 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0397  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  35.65 
 
 
1028 aa  545  1e-153  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00293449 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1480  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  35.23 
 
 
1055 aa  535  1e-150  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0062  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  33.15 
 
 
1019 aa  512  1e-143  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.218127  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1840  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  33.15 
 
 
1019 aa  512  1e-143  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0826  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  31.9 
 
 
1050 aa  456  1.0000000000000001e-126  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.927537  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1294  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  34.73 
 
 
1015 aa  311  4e-83  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.474007  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2179  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  35.25 
 
 
648 aa  286  2.0000000000000002e-75  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0543  DNA methylase N-4/N-6  33.82 
 
 
657 aa  280  1e-73  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0263725  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0851  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  33.81 
 
 
586 aa  265  2e-69  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.273669  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2240  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  31.46 
 
 
571 aa  205  4e-51  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.252325  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4042  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  31.84 
 
 
710 aa  204  9.999999999999999e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.693121 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0029  site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  32.99 
 
 
688 aa  184  6e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3213  site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  32.05 
 
 
672 aa  180  1e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0020  site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  31.45 
 
 
672 aa  180  1e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4001  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  30.81 
 
 
520 aa  180  1e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0029  site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  31.45 
 
 
668 aa  179  2e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0042  site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  32.47 
 
 
672 aa  179  4e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0930861  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0028  site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  32.47 
 
 
672 aa  179  4e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.666272  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0047  site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  32.47 
 
 
668 aa  178  4e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1691  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  27.9 
 
 
846 aa  176  2.9999999999999996e-42  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.849133  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0259  type III DNA modification methyltransferase  28.09 
 
 
677 aa  174  9e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0046  type III DNA modification methyltransferase  28.09 
 
 
677 aa  174  9e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.312444  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2674  type III DNA modification methyltransferase  28.09 
 
 
677 aa  173  2e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3280  type III DNA modification methyltransferase  28.09 
 
 
671 aa  172  2e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1847  type III DNA modification methyltransferase  28.09 
 
 
671 aa  172  2e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0046  type III DNA modification methyltransferase  28.09 
 
 
671 aa  172  2e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2705  type III DNA modification methyltransferase  28.09 
 
 
671 aa  172  2e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0041  type III DNA modification methyltransferase  27.81 
 
 
682 aa  171  8e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3047  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  29.49 
 
 
660 aa  166  2.0000000000000002e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0500  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  27.25 
 
 
846 aa  164  1e-38  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1828  site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  26.7 
 
 
632 aa  153  1e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0397  type III restriction-modification system StyLTI enzyme mod  29.08 
 
 
652 aa  152  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  decreased coverage  1.4274e-23 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0392  type III restriction-modification system StyLTI enzyme mod  29.08 
 
 
652 aa  152  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.292703  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0410  type III restriction-modification system StyLTI enzyme mod  29.08 
 
 
652 aa  152  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.640065  decreased coverage  0.0000000770056 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0389  type III restriction-modification system StyLTI enzyme mod  29.08 
 
 
652 aa  152  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  decreased coverage  1.57999e-20 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0452  type III restriction-modification system StyLTI enzyme mod  29.08 
 
 
652 aa  152  4e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  decreased coverage  1.31948e-23 
 
 
-
 
NC_013207  Aaci_3086  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine- specific)  27.05 
 
 
571 aa  151  5e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0848  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  28.57 
 
 
658 aa  150  9e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.561376  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03955  methyltransferase  28.88 
 
 
543 aa  150  1.0000000000000001e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0972  adenine specific DNA methylase  27.16 
 
 
531 aa  147  1e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.223028  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1679  adenine-specific DNA methylase  29.55 
 
 
820 aa  147  1e-33  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.140302  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1004  methyltransferase  29.21 
 
 
526 aa  146  2e-33  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0882  site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  28.53 
 
 
542 aa  146  2e-33  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0567  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  27.8 
 
 
629 aa  144  6e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0682574 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0580  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  26.95 
 
 
629 aa  144  9.999999999999999e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52350  adenine specific DNA methylase N-4/N-6  28.19 
 
 
560 aa  141  6e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2276  adenine specific DNA methylase  26.79 
 
 
559 aa  141  7e-32  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.403052  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0519  DNA methylase N-4/N-6  28.02 
 
 
610 aa  141  7e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1128  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  26.26 
 
 
643 aa  138  5e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2928  site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  26.42 
 
 
624 aa  137  9e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.537631  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1980  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  26.65 
 
 
547 aa  136  1.9999999999999998e-30  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.612228  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1548  site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  27.82 
 
 
611 aa  135  3.9999999999999996e-30  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1201  hypothetical protein  27.57 
 
 
636 aa  134  6.999999999999999e-30  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.04112 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1419  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine- specific)  28.8 
 
 
528 aa  134  6.999999999999999e-30  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3803  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  29.44 
 
 
566 aa  134  9e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0305  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  27.18 
 
 
510 aa  134  1.0000000000000001e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0676  DNA methylase N-4/N-6  29.04 
 
 
520 aa  132  3e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.635951 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4169  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  27.46 
 
 
553 aa  130  1.0000000000000001e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0802  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  27.39 
 
 
586 aa  130  2.0000000000000002e-28  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0154  site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  26.75 
 
 
646 aa  129  4.0000000000000003e-28  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0328767  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3656  adenine specific DNA methylase Mod  26.41 
 
 
567 aa  128  6e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000129355  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0099  adenine-specific DNA modification methyltransferase  26.89 
 
 
428 aa  128  7e-28  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.145446  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4593  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  27.05 
 
 
624 aa  127  1e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4096  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  28.03 
 
 
545 aa  127  1e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.480555 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0936  adenine specific DNA methylase MOD  27.37 
 
 
577 aa  123  1.9999999999999998e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.000403504  normal  0.65434 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5227  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine- specific)  26.28 
 
 
641 aa  123  1.9999999999999998e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.154135  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1085  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  26.9 
 
 
540 aa  122  3e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3561  hypothetical protein  34.69 
 
 
313 aa  122  4.9999999999999996e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1946  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  25.56 
 
 
631 aa  121  7e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1148  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  26.02 
 
 
644 aa  119  1.9999999999999998e-25  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.753419  normal  0.0281042 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2740  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  26.07 
 
 
609 aa  119  3e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00029702  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0869  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  27.34 
 
 
505 aa  119  3.9999999999999997e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0787  site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  26.15 
 
 
649 aa  117  1.0000000000000001e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0759094 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2208  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  25.13 
 
 
477 aa  116  2.0000000000000002e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4390  site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  25.29 
 
 
531 aa  115  3e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4205  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  26.52 
 
 
661 aa  114  8.000000000000001e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0188789  normal  0.0659615 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0224  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  24.33 
 
 
656 aa  113  2.0000000000000002e-23  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000113178 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5299  DNA methylase domain protein  29.84 
 
 
643 aa  112  3e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.389542  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0361  type III restriction-modification system, Mod subunit  25.3 
 
 
683 aa  112  5e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.0000361373  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1018  type III restriction-modification system enzyme, M subunit  25.81 
 
 
669 aa  110  1e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0364  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  24.7 
 
 
637 aa  106  2e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000437677 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0237  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  23.99 
 
 
626 aa  105  5e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1521  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  24.9 
 
 
632 aa  105  5e-21  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.000681847  hitchhiker  0.000103984 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0159  site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  25.29 
 
 
668 aa  101  7e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0741814  unclonable  0.0000000322464 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0582  DNA methylase N-4/N-6  25 
 
 
660 aa  101  9e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.204678  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05370  adenine specific DNA methylase Mod  26.78 
 
 
646 aa  101  1e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1743  adenine specific DNA methylase Mod-like  26.3 
 
 
445 aa  98.2  7e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0524205  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2487  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  23.89 
 
 
658 aa  97.4  1e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.661764  normal  0.0354295 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1580  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  25.48 
 
 
570 aa  97.1  2e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0731  type III restriction/modification enzyme, methylase subunit  32.42 
 
 
675 aa  95.1  6e-18  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3323  DNA methylase  33.57 
 
 
542 aa  94.7  8e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.622136  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1112  type III restriction-modification system, methylase subunit  24.56 
 
 
587 aa  93.6  2e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.350936  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2779  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  31.85 
 
 
622 aa  92  5e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.787774  normal  0.393495 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3707  site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  26.33 
 
 
392 aa  91.7  8e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0529764  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4077  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  33.08 
 
 
635 aa  90.1  2e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>