164 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMA10229_A1847 on replicon NC_008836
Organism: Burkholderia mallei NCTC 10229



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006348  BMA2674  type III DNA modification methyltransferase  100 
 
 
677 aa  1374    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0259  type III DNA modification methyltransferase  99.7 
 
 
677 aa  1370    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3213  site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  69.7 
 
 
672 aa  1003    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0041  type III DNA modification methyltransferase  95.12 
 
 
682 aa  1227    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0042  site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  70.45 
 
 
672 aa  1010    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0930861  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0020  site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  70.6 
 
 
672 aa  1013    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0028  site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  70.45 
 
 
672 aa  1010    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.666272  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3280  type III DNA modification methyltransferase  100 
 
 
671 aa  1373    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1847  type III DNA modification methyltransferase  100 
 
 
671 aa  1373    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0046  type III DNA modification methyltransferase  99.85 
 
 
671 aa  1372    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0046  type III DNA modification methyltransferase  99.7 
 
 
677 aa  1370    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.312444  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2705  type III DNA modification methyltransferase  100 
 
 
671 aa  1373    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0029  site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  70.45 
 
 
688 aa  1008    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0029  site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  70.45 
 
 
668 aa  1012    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0047  site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  70.45 
 
 
668 aa  1008    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4205  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  48.48 
 
 
661 aa  571  1e-161  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0188789  normal  0.0659615 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4593  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  45.24 
 
 
624 aa  553  1e-156  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1128  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  45.21 
 
 
643 aa  551  1e-155  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1394  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  47.44 
 
 
651 aa  546  1e-154  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0159  site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  47.74 
 
 
668 aa  537  1e-151  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0741814  unclonable  0.0000000322464 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0237  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  45.61 
 
 
626 aa  523  1e-147  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0787  site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  44.82 
 
 
649 aa  489  1e-137  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0759094 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2928  site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  39.56 
 
 
624 aa  478  1e-133  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.537631  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2179  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  39.83 
 
 
648 aa  468  9.999999999999999e-131  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0519  DNA methylase N-4/N-6  37.09 
 
 
610 aa  434  1e-120  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1548  site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  35.28 
 
 
611 aa  393  1e-108  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0543  DNA methylase N-4/N-6  35.92 
 
 
657 aa  387  1e-106  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0263725  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0154  site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  34.64 
 
 
646 aa  353  8e-96  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0328767  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0567  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  34.6 
 
 
629 aa  347  3e-94  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0682574 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0580  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  34.51 
 
 
629 aa  347  5e-94  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0514  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  32.81 
 
 
664 aa  343  5.999999999999999e-93  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2487  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  34.14 
 
 
658 aa  338  2.9999999999999997e-91  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.661764  normal  0.0354295 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5227  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine- specific)  33.96 
 
 
641 aa  337  2.9999999999999997e-91  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.154135  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3047  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  34.29 
 
 
660 aa  331  3e-89  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1828  site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  33.68 
 
 
632 aa  319  1e-85  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0848  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  33.13 
 
 
658 aa  306  6e-82  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.561376  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1201  hypothetical protein  32.36 
 
 
636 aa  306  7e-82  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.04112 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1946  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  33.13 
 
 
631 aa  306  1.0000000000000001e-81  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0802  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  34.47 
 
 
586 aa  294  5e-78  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0582  DNA methylase N-4/N-6  55.08 
 
 
660 aa  283  5.000000000000001e-75  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.204678  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0224  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  30.15 
 
 
656 aa  281  2e-74  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000113178 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1743  adenine specific DNA methylase Mod-like  34.54 
 
 
445 aa  274  5.000000000000001e-72  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0524205  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0364  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  48.82 
 
 
637 aa  245  1.9999999999999999e-63  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000437677 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2208  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  32.59 
 
 
477 aa  238  3e-61  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4904  N4/N6-methyltransferase family protein  32.63 
 
 
1040 aa  225  3e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.658462  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1148  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  42.38 
 
 
644 aa  218  2e-55  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.753419  normal  0.0281042 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0397  type III restriction-modification system StyLTI enzyme mod  32.58 
 
 
652 aa  218  2.9999999999999998e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  decreased coverage  1.4274e-23 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0452  type III restriction-modification system StyLTI enzyme mod  32.58 
 
 
652 aa  218  2.9999999999999998e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  decreased coverage  1.31948e-23 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0389  type III restriction-modification system StyLTI enzyme mod  32.58 
 
 
652 aa  218  2.9999999999999998e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  decreased coverage  1.57999e-20 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0392  type III restriction-modification system StyLTI enzyme mod  32.58 
 
 
652 aa  218  4e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.292703  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0410  type III restriction-modification system StyLTI enzyme mod  32.58 
 
 
652 aa  218  4e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.640065  decreased coverage  0.0000000770056 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1521  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  44.49 
 
 
632 aa  218  4e-55  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.000681847  hitchhiker  0.000103984 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05370  adenine specific DNA methylase Mod  45.23 
 
 
646 aa  210  6e-53  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1746  type III restriction system methylase  54.4 
 
 
173 aa  205  2e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1112  type III restriction-modification system, methylase subunit  40.3 
 
 
587 aa  205  3e-51  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.350936  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2240  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  32.34 
 
 
571 aa  199  2.0000000000000003e-49  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.252325  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0361  type III restriction-modification system, Mod subunit  41.77 
 
 
683 aa  191  4e-47  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.0000361373  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2249  type III restriction-modification system methylation subunit  44.6 
 
 
227 aa  186  2.0000000000000003e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0851  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  34.49 
 
 
586 aa  182  2e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.273669  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0099  adenine-specific DNA modification methyltransferase  29.84 
 
 
428 aa  181  4.999999999999999e-44  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.145446  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0593  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  28.09 
 
 
1073 aa  181  5.999999999999999e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4001  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  31.39 
 
 
520 aa  175  2.9999999999999996e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0972  adenine specific DNA methylase  32.33 
 
 
531 aa  174  5.999999999999999e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.223028  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4042  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  32.68 
 
 
710 aa  171  3e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.693121 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03955  methyltransferase  30.22 
 
 
543 aa  164  6e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1018  type III restriction-modification system enzyme, M subunit  27.97 
 
 
669 aa  164  7e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1004  methyltransferase  30.77 
 
 
526 aa  161  3e-38  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013207  Aaci_3086  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine- specific)  28.99 
 
 
571 aa  161  4e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4390  site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  30.36 
 
 
531 aa  160  6e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0882  site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  29.23 
 
 
542 aa  160  7e-38  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2247  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  35.66 
 
 
396 aa  156  1e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1419  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine- specific)  27.66 
 
 
528 aa  154  5e-36  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3707  site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  30.65 
 
 
392 aa  153  8e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0529764  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2740  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  27.99 
 
 
609 aa  153  1e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00029702  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0305  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  27 
 
 
510 aa  137  5e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0869  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  29.8 
 
 
505 aa  137  7.000000000000001e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2276  adenine specific DNA methylase  30.1 
 
 
559 aa  132  2.0000000000000002e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.403052  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0676  DNA methylase N-4/N-6  29.4 
 
 
520 aa  131  5.0000000000000004e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.635951 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3323  DNA methylase  28.21 
 
 
542 aa  131  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.622136  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3803  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  28.87 
 
 
566 aa  129  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1980  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  27.04 
 
 
547 aa  127  6e-28  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.612228  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0062  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  26.37 
 
 
1019 aa  127  9e-28  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.218127  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1840  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  26.37 
 
 
1019 aa  127  9e-28  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4096  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  26.8 
 
 
545 aa  125  3e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.480555 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1463  adenine specific DNA methylase Mod-like protein  26.48 
 
 
633 aa  124  7e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5299  DNA methylase domain protein  26.55 
 
 
643 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.389542  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4240  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  26.03 
 
 
657 aa  120  7e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1480  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  29.19 
 
 
1055 aa  119  1.9999999999999998e-25  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4169  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  26.85 
 
 
553 aa  118  3.9999999999999997e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3656  adenine specific DNA methylase Mod  26.92 
 
 
567 aa  117  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000129355  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0826  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  26.84 
 
 
1050 aa  115  2.0000000000000002e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.927537  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0197  hypothetical protein  24.94 
 
 
646 aa  115  3e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52350  adenine specific DNA methylase N-4/N-6  25.52 
 
 
560 aa  115  3e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1085  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  25.78 
 
 
540 aa  113  1.0000000000000001e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1021  adenine specific DNA methyltransferase  40 
 
 
227 aa  108  4e-22  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4077  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  33.96 
 
 
635 aa  105  3e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1580  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  24.48 
 
 
570 aa  101  5e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2574  adenine specific DNA methylase Mod  25.63 
 
 
692 aa  100  1e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2779  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  33.72 
 
 
622 aa  99.4  2e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.787774  normal  0.393495 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0731  type III restriction/modification enzyme, methylase subunit  30.53 
 
 
675 aa  95.9  2e-18  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>