26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_3678 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_3678  Cupin 2 conserved barrel domain protein  100 
 
 		 118 aa  234  4e-61  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2766  Cupin 2 conserved barrel domain protein  57.55 
 
 		 115 aa  135  2e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5217  Cupin 2 conserved barrel domain protein  57.89 
 
 		 112 aa  132  9.999999999999999e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.181963  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4501  hypothetical protein  57.02 
 
 		 112 aa  132  1.9999999999999998e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.465454  normal  0.16262 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4773  Cupin 2 conserved barrel domain-containing protein  54.39 
 
 		 113 aa  129  1.0000000000000001e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.459011  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2960  cupin 2 domain-containing protein  56.07 
 
 		 112 aa  124  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0272486 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3831  Cupin 2 conserved barrel domain protein  53.92 
 
 		 182 aa  113  8.999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1024  cupin 2 domain-containing protein  53.54 
 
 		 102 aa  104  5e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0831873 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0731  cupin 2 domain-containing protein  42.37 
 
 		 112 aa  53.1  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00910188  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2403  Cupin 2 conserved barrel domain protein  38.98 
 
 		 115 aa  50.8  0.000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3323  Cupin 2 conserved barrel domain protein  45.76 
 
 		 107 aa  48.5  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00344723  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0923  Cupin 2 conserved barrel domain protein  44.07 
 
 		 107 aa  47.8  0.00006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.8499800000000002e-33 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2041  cupin 2 domain-containing protein  38.98 
 
 		 110 aa  47.4  0.00007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.267736 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3553  cupin 2 domain-containing protein  32.39 
 
 		 111 aa  46.6  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.31919 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0960  Cupin 2 conserved barrel domain protein  37.29 
 
 		 113 aa  45.8  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0432  cupin region  45.95 
 
 		 117 aa  45.1  0.0003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.583729  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0833  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.48 
 
 		 117 aa  44.3  0.0006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.64172  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2731  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.23 
 
 		 113 aa  44.3  0.0006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.497805  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2948  transcriptional regulator, XRE family  46.15 
 
 		 225 aa  43.9  0.0007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0211039  hitchhiker  0.000112709 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2268  cupin 2 domain-containing protein  32.86 
 
 		 111 aa  43.5  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2408  cupin 2 domain-containing protein  37.5 
 
 		 100 aa  42.4  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.231406 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2655  Cupin 2 conserved barrel domain-containing protein  37.88 
 
 		 114 aa  42.4  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.104374  hitchhiker  0.00638268 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0042  hypothetical protein  29.33 
 
 		 120 aa  42.4  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.358454 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0542  cupin 2, barrel  28.42 
 
 		 122 aa  42  0.003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4456  hypothetical protein  33.33 
 
 		 129 aa  40.8  0.006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0285903  normal  0.0443513 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0823  cupin 2, barrel  29.17 
 
 		 132 aa  40  0.01  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.221172  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>