158 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcryo_0823 on replicon NC_007969
Organism: Psychrobacter cryohalolentis K5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007969  Pcryo_0823  cupin 2, barrel  100 
 
 
132 aa  269  9e-72  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.221172  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3217  DNA-binding transcriptional repressor PuuR  45.31 
 
 
185 aa  120  4e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00931444 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1941  DNA-binding transcriptional repressor PuuR  46.09 
 
 
185 aa  117  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.385308 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01276  DNA-binding transcriptional repressor  46.09 
 
 
185 aa  117  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2347  transcriptional regulator, XRE family  46.09 
 
 
185 aa  117  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.204857  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01287  hypothetical protein  46.09 
 
 
185 aa  117  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1823  DNA-binding transcriptional repressor PuuR  46.09 
 
 
185 aa  117  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0706879 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2326  DNA-binding transcriptional repressor PuuR  46.09 
 
 
185 aa  117  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1535  DNA-binding transcriptional repressor PuuR  46.09 
 
 
185 aa  117  4.9999999999999996e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1414  DNA-binding transcriptional repressor PuuR  46.09 
 
 
185 aa  117  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1509  DNA-binding transcriptional repressor PuuR  46.09 
 
 
185 aa  117  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2066  DNA-binding transcriptional repressor PuuR  40.91 
 
 
185 aa  112  1.0000000000000001e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0105  DNA-binding protein  38.76 
 
 
199 aa  87.8  4e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0238  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  37.98 
 
 
199 aa  87.8  4e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69980  putative transcriptional regulator  38.76 
 
 
182 aa  87.4  5e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6075  putative transcriptional regulator  38.76 
 
 
182 aa  87  8e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5523  transcriptional regulator  35.66 
 
 
182 aa  86.7  1e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.22086 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0202  XRE family transcriptional regulator  34.88 
 
 
182 aa  83.2  0.000000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.614203  hitchhiker  0.00167713 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4679  putative transcriptional regulator  42.31 
 
 
180 aa  80.5  0.000000000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5268  Cro/CI family transcriptional regulator  33.85 
 
 
182 aa  80.1  0.00000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5320  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 
182 aa  80.1  0.00000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.8166  normal  0.310919 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5178  XRE family transcriptional regulator  33.85 
 
 
199 aa  79.7  0.00000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.174471  normal  0.155373 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0248  XRE family transcriptional regulator  34.88 
 
 
182 aa  78.6  0.00000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2042  transcriptional regulator  37.69 
 
 
188 aa  78.2  0.00000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0970  XRE family transcriptional regulator  35.66 
 
 
182 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1128  XRE family transcriptional regulator  34.11 
 
 
182 aa  72  0.000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0544  XRE family transcriptional regulator  32.81 
 
 
203 aa  72.4  0.000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1058  XRE family transcriptional regulator  34.11 
 
 
184 aa  71.6  0.000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2921  XRE family transcriptional regulator  34.11 
 
 
208 aa  71.6  0.000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.899455  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3003  XRE family transcriptional regulator  34.11 
 
 
208 aa  71.6  0.000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.252662  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3100  XRE family transcriptional regulator  34.11 
 
 
208 aa  71.6  0.000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.510523  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4668  transcriptional regulator, XRE family  42.17 
 
 
183 aa  70.1  0.000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.443743  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1091  XRE family transcriptional regulator  34.11 
 
 
182 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.158888  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1265  transcriptional regulator, putative  32.56 
 
 
182 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3195  transcriptional regulator, XRE family  32.56 
 
 
182 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0639399 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0944  transcriptional regulator  40.96 
 
 
189 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1104  cupin 2 domain-containing protein  32.56 
 
 
182 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.183758  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1163  cupin 2 domain-containing protein  32.56 
 
 
182 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.967119  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1195  XRE family transcriptional regulator  32.56 
 
 
182 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.152731  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2985  XRE family transcriptional regulator  31.54 
 
 
183 aa  67.4  0.00000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47950  Cupin, RmlC-type protein  33.33 
 
 
182 aa  67  0.00000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0943  XRE family transcriptional regulator  32.56 
 
 
182 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3161  XRE family transcriptional regulator  30.47 
 
 
182 aa  65.1  0.0000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6340  XRE family transcriptional regulator  30.23 
 
 
183 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4415  XRE family transcriptional regulator  33.63 
 
 
213 aa  63.9  0.0000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4834  transcriptional regulator, XRE family  29.69 
 
 
182 aa  63.5  0.0000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.197047  normal  0.0345523 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4784  transcriptional regulator, XRE family  29.69 
 
 
182 aa  63.5  0.0000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0510271 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2025  aldehyde dehydrogenase-like protein  37.35 
 
 
189 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1943  Cro/CI family transcriptional regulator putative  36.14 
 
 
189 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.693839  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0733  aldehyde dehydrogenase-like protein  37.35 
 
 
183 aa  62.8  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.126553  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0641  aldehyde dehydrogenase-like protein  37.35 
 
 
183 aa  62.8  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3011  XRE family transcriptional regulator  30.77 
 
 
183 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1077  XRE family transcriptional regulator  26.92 
 
 
186 aa  62.8  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2377  XRE family transcriptional regulator  30.77 
 
 
183 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2991  XRE family transcriptional regulator  30.77 
 
 
183 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6084  XRE family transcriptional regulator  34.67 
 
 
234 aa  62  0.000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.207069 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2571  transcriptional regulator, XRE family  34.13 
 
 
192 aa  61.2  0.000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000000481124  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3261  XRE family transcriptional regulator  33.59 
 
 
190 aa  60.5  0.000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.957848  normal  0.179215 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3038  XRE family transcriptional regulator  28.68 
 
 
183 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2901  XRE family transcriptional regulator  28.68 
 
 
183 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2366  transcriptional regulator, XRE family  26.56 
 
 
184 aa  59.7  0.00000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2646  XRE family transcriptional regulator  28.68 
 
 
182 aa  60.1  0.00000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2387  XRE family transcriptional regulator  32.03 
 
 
181 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3869  XRE family transcriptional regulator  29.69 
 
 
183 aa  58.9  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0925  transcriptional regulator, putative  30.16 
 
 
182 aa  58.9  0.00000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3411  transcriptional regulator, XRE family  29.63 
 
 
183 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0867  putative transcriptional regulator  30.16 
 
 
182 aa  58.9  0.00000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0318952  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1714  XRE family transcriptional regulator  29.6 
 
 
182 aa  58.2  0.00000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.510937  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0277  XRE family transcriptional regulator  28.91 
 
 
204 aa  57.8  0.00000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.128046  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2884  XRE family transcriptional regulator  32.03 
 
 
181 aa  57.4  0.00000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0819457  normal  0.480487 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2898  XRE family transcriptional regulator  32.03 
 
 
181 aa  57.4  0.00000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2806  XRE family transcriptional regulator  32.03 
 
 
181 aa  57.4  0.00000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.675672 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2705  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  31.78 
 
 
203 aa  57  0.00000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.847169  normal  0.058179 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0901  XRE family transcriptional regulator  27.91 
 
 
181 aa  56.6  0.0000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000108423 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1443  XRE family transcriptional regulator  29.69 
 
 
182 aa  56.6  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2540  Cro/CI family transcriptional regulator  27.78 
 
 
181 aa  55.1  0.0000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0751  XRE family transcriptional regulator  27.2 
 
 
179 aa  55.5  0.0000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000101746  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2901  DNA-binding protein  31.78 
 
 
182 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00299352  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0766  XRE family transcriptional regulator  28.12 
 
 
183 aa  54.7  0.0000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3586  XRE family transcriptional regulator  26.73 
 
 
207 aa  53.9  0.0000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.101767 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2125  transcriptional regulator  38.1 
 
 
182 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.318777 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2087  XRE family transcriptional regulator  31.75 
 
 
195 aa  51.6  0.000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65950  putative transcriptional regulator  24.03 
 
 
199 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1306  transcriptional regulator, XRE family  21.09 
 
 
170 aa  50.8  0.000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000237827 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2919  transcriptional regulator, XRE family  21.09 
 
 
170 aa  50.8  0.000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1325  cupin 2 domain-containing protein  28.93 
 
 
175 aa  50.4  0.000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2821  XRE family transcriptional regulator  24.81 
 
 
199 aa  50.4  0.000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2868  Cro/CI family transcriptional regulator  24.03 
 
 
199 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0361  XRE family transcriptional regulator  29.47 
 
 
205 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5722  putative transcriptional regulator  23.26 
 
 
199 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2094  transcriptional regulator Cro/CI family protein  28.77 
 
 
188 aa  48.5  0.00003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2913  XRE family transcriptional regulator  24.03 
 
 
199 aa  48.9  0.00003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0980  XRE family transcriptional regulator  23.81 
 
 
181 aa  48.1  0.00004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000294477  n/a   
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4841  cupin 2 domain-containing protein  36.67 
 
 
202 aa  48.1  0.00004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1441  XRE family transcriptional regulator  32.86 
 
 
227 aa  47.8  0.00005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0636175 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1558  cupin 2 domain-containing protein  29.63 
 
 
180 aa  47.8  0.00005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1419  XRE family transcriptional regulator  29.41 
 
 
178 aa  47.4  0.00007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1027  XRE family transcriptional regulator  32.86 
 
 
223 aa  47  0.00008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.944907 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0275  cupin 2 domain-containing protein  28.7 
 
 
188 aa  46.6  0.0001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000353927  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0273  XRE family transcriptional regulator  28.7 
 
 
176 aa  46.6  0.0001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000144131  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>