36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_3372 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_3372  RDD domain containing protein  100 
 
 		 139 aa  265  2e-70  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1916  RDD domain containing protein  51.88 
 
 		 139 aa  111  3e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0253441  hitchhiker  0.000670686 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0926  RDD domain containing protein  46.15 
 
 		 157 aa  99  2e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07510  hypothetical protein  41.26 
 
 		 160 aa  84.7  3e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.38358 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1511  RDD domain containing protein  41.43 
 
 		 160 aa  80.1  0.00000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3079  RDD domain containing protein  38.3 
 
 		 167 aa  77.4  0.00000000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0151194  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7409  RDD domain containing protein  37.5 
 
 		 158 aa  75.1  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2630  hypothetical protein  42.52 
 
 		 154 aa  73.6  0.0000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2111  RDD domain containing protein  40.56 
 
 		 174 aa  72.4  0.000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.158954  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12248  hypothetical protein  41.54 
 
 		 140 aa  72  0.000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.300466  normal  0.915257 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3141  RDD  38.89 
 
 		 134 aa  68.9  0.00000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3331  RDD domain-containing protein  38.46 
 
 		 131 aa  67.8  0.00000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.00294231  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16490  hypothetical protein  37.31 
 
 		 144 aa  67  0.00000000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.829051  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3319  RDD domain-containing protein  37.04 
 
 		 159 aa  65.9  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.436382  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3330  RDD domain-containing protein  37.04 
 
 		 159 aa  65.9  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.177645 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2037  RDD domain containing protein  41.22 
 
 		 151 aa  66.2  0.0000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.905521  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3381  RDD domain-containing protein  37.04 
 
 		 159 aa  65.9  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.15459  normal  0.0851083 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15380  hypothetical protein  39.02 
 
 		 147 aa  65.1  0.0000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0924  RDD domain-containing protein  43.64 
 
 		 116 aa  63.2  0.000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13390  hypothetical protein  41.46 
 
 		 166 aa  62.4  0.000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.408767  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1595  RDD domain containing protein  35.94 
 
 		 145 aa  61.2  0.000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000125506 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16400  hypothetical protein  33.33 
 
 		 158 aa  61.2  0.000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.189781  normal  0.428616 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3584  RDD domain-containing protein  32.47 
 
 		 155 aa  61.6  0.000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0783215  normal  0.0483583 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1263  RDD domain-containing protein  40.31 
 
 		 152 aa  60.8  0.000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0359346  normal  0.130188 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2929  RDD domain-containing protein  36.84 
 
 		 156 aa  60.8  0.000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.150764 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0933  RDD domain containing protein  36.17 
 
 		 159 aa  59.7  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0312936 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1771  RDD domain-containing protein  38.26 
 
 		 125 aa  58.5  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0920236 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1856  RDD domain containing protein  35.71 
 
 		 131 aa  57.4  0.00000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3101  RDD domain containing protein  42.64 
 
 		 160 aa  56.6  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0763481  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1483  RDD domain containing protein  38.39 
 
 		 142 aa  54.3  0.0000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1601  RDD domain-containing protein  35.94 
 
 		 145 aa  54.3  0.0000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.134056  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3567  RDD domain-containing protein  34.19 
 
 		 131 aa  50.8  0.000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0022466 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4895  RDD domain-containing protein  34.07 
 
 		 141 aa  47  0.00009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3290  RDD domain containing protein  30.3 
 
 		 144 aa  45.8  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0390662 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1918  RDD protein  24.81 
 
 		 154 aa  40.8  0.007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.002418  n/a   
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_49805  predicted protein  33.33 
 
 		 389 aa  40.4  0.009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.193845  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>